トゲウオ淡水進出の鍵形質の遺伝基盤

• 研究課題/領域番号: 15H02418
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 国立遺伝学研究所
• 研究代表者: 北野 潤 国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 教授 (80346105)
• 連携研究者: 牧野 能士 東北大学, 生命科学研究科, 准教授 (20443442)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 40,430千円 (直接経費: 31,100千円、間接経費: 9,330千円); 2017年度: 11,700千円 (直接経費: 9,000千円、間接経費: 2,700千円); 2016年度: 11,050千円 (直接経費: 8,500千円、間接経費: 2,550千円); 2015年度: 17,680千円 (直接経費: 13,600千円、間接経費: 4,080千円)
• キーワード: 進化 / 適応 / 生態 / 遺伝 / ゲノム / 適応放散 / 適応進化 / 種分化 / トゲウオ / 不飽和脂肪酸 / 一細胞解析

研究成果の概要

本研究室に存在するイトヨの全集団のddRAD解析を実施し、これまでに本研究室で採集した全ての淡水イトヨは、ニホンイトヨ系統でなく、イトヨ系統から由来していることを確認した。ついで、ある不飽和脂肪酸代謝酵素のコピー数がイトヨにて高いこと、当該遺伝子発現量もイトヨにて高いこと、ある不飽和脂肪酸合成能力もイトヨで高いことを見出した。そこで、淡水餌からの不飽和脂肪酸合成能力の違いが、淡水進出能力を規定していると考えられた。

研究成果

• [国際共同研究] University of Oslo(ノルウェー)
• [国際共同研究] University of Bern(スイス)
• [国際共同研究] ベルン大学(スイス)
• [国際共同研究] 北アリゾナ大学(米国)
• [国際共同研究] University of Bern(Switzerland)
• [国際共同研究] Fred Hutchinson Cancer Research Center(米国)
• [雑誌論文] Genomic landscape at a late stage of stickleback speciation: high genomic divergence interspersed by small localized regions of introgression (2018)
  • 著者名/発表者名: Ravinet, M., Yoshida, K., Shigenobu, S., Toyoda, A., Fujiyama, A., and Kitano, J.
  • 雑誌名: PLoS Genetics 巻: in press
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genetic and stable isotope analyses of threespine stickleback from the Bering and Chukchi Seas. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kume, M. Kitano, J.
  • 雑誌名: Ichthyological Research 巻: in press 号: 4 ページ: 478-480
  • DOI: 10.1007/s10228-017-0580-9
  • NAID: 40021381049
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] トゲウオにおける淡水進出の鍵形質の遺伝基盤 (2017)
  • 著者名/発表者名: 北野潤
  • 学会等名: 「配偶子産生制御」第7回領域会議
  • 発表場所: 東京海洋大学
  • 年月日: 2017-03-15
  • 招待講演
• [学会発表] Genomic signatures of introgression at the late stage of stickleback speciation (2017)
  • 著者名/発表者名: Jun Kitano, Mark Ravinet, Asano Ishikawa, Kohta Yoshida, Ryo Kakioka
  • 学会等名: European Society for Evolutionary Biology 2017
  • 国際学会
• [学会発表] A key role for an omega-3 fatty acid desaturase in stickleback freshwater colonization (2017)
  • 著者名/発表者名: Jun Kitano, Asano Ishikawa
  • 学会等名: Society of Molecular Biology ad Evolution 2017
  • 国際学会
• [学会発表] トゲウオにおける適応進化の遺伝基盤 (2016)
  • 著者名/発表者名: 北野潤
  • 学会等名: IGERセミナー
  • 発表場所: 名古屋大学
  • 年月日: 2016-04-28
  • 招待講演
• [学会発表] Genetic mechanisms of colonization of new niches in sticklebacks (2015)
  • 著者名/発表者名: Jun Kitano
  • 学会等名: Lecture Series in Ecology and Evolution
  • 発表場所: University of Bern, Switzerland
  • 年月日: 2015-10-11
  • 招待講演
• [学会発表] Drivers of sex chromosome-autosome fusions and their roles in speciation (2015)
  • 著者名/発表者名: Jun Kitano
  • 学会等名: AGA Presidents Symposium, Chromosome Evolution: Molecular Mechanisms and Evolutionary Consequences
  • 発表場所: Bainbridge Island, USA
  • 年月日: 2015-08-17
  • 招待講演
• [学会発表] Why are there so many species with Y- autosome fusions? (2015)
  • 著者名/発表者名: Kitano J. Pennell M., Kirkpatrick M., Otto S., Vamosi J., Peichel C.
  • 学会等名: ESEB 2015
  • 発表場所: Lausanne, Switzerland
  • 年月日: 2015-08-10
  • 国際学会
• [備考] 研究内容
  • URL: https://www.nig.ac.jp/labs/EcoGene/research.html