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甘草を中心とする重要マメ科薬用資源植物の統合ゲノム研究

研究課題

研究課題/領域番号 15H02494
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 天然資源系薬学
研究機関千葉大学

研究代表者

齊藤 和季  千葉大学, 大学院薬学研究院, 教授 (00146705)

研究分担者 山崎 真巳  千葉大学, 大学院薬学研究院, 准教授 (70222370)
ライ アミット  千葉大学, 大学院薬学研究院, 特任助教 (60760535)
鈴木 秀幸  公益財団法人かずさDNA研究所, ゲノム事業推進部, グループ長 (80276162)
研究協力者 吉本 尚子  
高橋 弘喜  
櫻井 哲也  
持田 恵一  
中林 亮  
平川 英樹  
高上馬 希重  
關 光  
村中 俊哉  
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
45,890千円 (直接経費: 35,300千円、間接経費: 10,590千円)
2018年度: 11,180千円 (直接経費: 8,600千円、間接経費: 2,580千円)
2017年度: 11,180千円 (直接経費: 8,600千円、間接経費: 2,580千円)
2016年度: 11,180千円 (直接経費: 8,600千円、間接経費: 2,580千円)
2015年度: 12,350千円 (直接経費: 9,500千円、間接経費: 2,850千円)
キーワード薬用植物 / 植物二次代謝 / ゲノム / 甘草 / 薬学 / 二次代謝 / トランスクリプトーム / 遺伝子
研究成果の概要

甘草はその安定供給が危惧される最も重要な生薬の代表である。そこで、最も上質とされるウラル甘草について、全ゲノムサイズの94.5%に相当する379メガベースのドラフトゲノム情報を構築し、34,445個のタンパク質をコードする遺伝子を見出した。さらに他の甘草種植物やマメ科の重要薬用植物についても、同様の手法でゲノム配列と関連情報を取得した。このように、薬用植物の統合ゲノミクスの研究基盤を提供した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

甘草は漢方処方の7割に配合されている最も使用頻度の高い重要な生薬であるが、その供給はすべてが輸入であり、多くを中国に依存している。しかし、中国での甘草の輸出規制が始まり、その安定供給が深刻に危惧されている。本研究は、漢方処方に用いられる重要生薬の基原植物において初めてのゲノム配列決定であり、この分野の研究進展に大きく貢献した。特に、発表論文の一つは高被引用度トップ1%論文に選定され注目された。

報告書

(5件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2019 2018 2017 2016 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 8件、 招待講演 8件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] A new era in plant functional genomics2019

    • 著者名/発表者名
      Rai Amit、Yamazaki Mami、Saito Kazuki
    • 雑誌名

      Current Opinion in Systems Biology

      巻: 15 ページ: 58-67

    • DOI

      10.1016/j.coisb.2019.03.005

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 植物メタボロミクスの開拓と薬用資源植物ゲノミクスへの展開2018

    • 著者名/発表者名
      Saito Kazuki
    • 雑誌名

      薬学雑誌

      巻: 138 号: 1 ページ: 1-18

    • DOI

      10.1248/yakushi.17-00193

    • NAID

      130006300863

    • ISSN
      0031-6903, 1347-5231
    • 年月日
      2018-01-01
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Perspective: functional genomics towards new biotechnology in medicinal plants2018

    • 著者名/発表者名
      Mami Yamazaki, Amit Rai, Naoko Yoshimoto, Kazuki Saito
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology Reports

      巻: 12 号: 2 ページ: 69-75

    • DOI

      10.1007/s11816-018-0476-9

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Integrated omics analysis of specialized metabolism in medicinal plants2017

    • 著者名/発表者名
      Rai Amit、Saito Kazuki、Yamazaki Mami
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 90 号: 4 ページ: 764-787

    • DOI

      10.1111/tpj.13485

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Lysine-derived Alkaloids: Overview and Update on Biosynthesis and Medicinal Applications with Emphasis on Quinolizidine Alkaloids2017

    • 著者名/発表者名
      Bunsupa Somnuk、Yamazaki Mami、Saito Kazuki
    • 雑誌名

      Mini-Reviews in Medicinal Chemistry

      巻: 17 号: 12 ページ: 1002-1012

    • DOI

      10.2174/1389557516666160506151213

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Draft genome assembly and annotation of Glycyrrhiza uralensis, a medicinal legume2017

    • 著者名/発表者名
      Keiichi Mochida, Tetsuya Sakurai, Hikaru Seki, Takuhiro Yoshida, Kotaro Takahagi, Satoru Sawai, Hiroshi Uchiyama, Toshiya Muranaka, Kazuki Saito
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 89 号: 2 ページ: 181-194

    • DOI

      10.1111/tpj.13385

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] アルカロイド生合成遺伝子を発現したシロイヌナズナにおける新規代謝物生産2019

    • 著者名/発表者名
      清水陽平, 佐藤大, 鈴木秀幸, 斉藤和季, 山崎真巳
    • 学会等名
      第60回 日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナへのリジン脱炭酸酵素遺伝子導入による新規代謝経路誘導と化学多様性の拡張2019

    • 著者名/発表者名
      清水陽平、Amit Rai、佐藤大、鈴木秀幸、斉藤和季、山崎真巳
    • 学会等名
      日本薬学会 第139年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Phytochemical genomics: from Arabidopsis to medicinal plants2018

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Saito
    • 学会等名
      The 3rd Conference of the International Society for Plant Molecular Farming
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Phytochemical genomics for biosynthesis of specialized products in medicinal plants2018

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Saito
    • 学会等名
      Western Pacific Regional Forum for the Harmonization of Herbal Medicines 7th International Symposium
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] シロイヌナズナへのリジン/オルニチン脱炭酸酵素遺伝子導入によるカダベリン代謝誘導2018

    • 著者名/発表者名
      清水陽平,大川結子、佐藤大、鈴木秀幸、斉藤和季、山崎真巳
    • 学会等名
      日本生薬学会 第65回年会(広島)
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Discovery of novel genes and metabolites through plant genomics and metabolomics - From Arabidopsis to specialized plants2017

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Saito
    • 学会等名
      Annual Conference of American Society of Plant Biologists 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Phytochemical genomics - A basis for the future research of plant natural products chemistry2017

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Saito
    • 学会等名
      The 32nd International Symposium on Natural Products
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Metabolomics-based functional genomics of plant metabolism - From Arabidopsis to medicinal plants2017

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Saito
    • 学会等名
      15th Asian Symposium on Medicinal Plants, Spices, and other Natural Products (ASOMPS XV)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Phytochemical Genomics: A Basis for Redesign of Plant Natural Products Biosynthesis2017

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Saito
    • 学会等名
      International Symposium on Creation of Complex Functional Molecules by Rational Redesign of Biosynthetic Machineries. The 137th Annual Congress of The Pharmaceutical Society of Japan.
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Phytochemical genomics - from a model plant to medicinal plants2016

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Saito
    • 学会等名
      9th Joint Natural Procucts Conference 2016
    • 発表場所
      Copenhagen, Denmark
    • 年月日
      2016-07-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Discovery of novel genes and metabolites through plant genomics and metabolomics - From Arabidopsis to specialized plants2016

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Saito
    • 学会等名
      International Symposium in Natural Products for the Future 2016
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 千葉大学大学院薬学研究院遺伝子資源応用研究室

    • URL

      http://www.p.chiba-u.jp/lab/idenshi/index.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

URL: 

公開日: 2015-04-16   更新日: 2020-03-30  

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