ヒト造精機能障害に関わる分子基盤の全容解明を目指した統合的ゲノム・エピゲノム解析

• 研究課題/領域番号: 15H04320
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ゲノム医科学
• 研究機関: 金沢大学
• 研究代表者: 田嶋 敦 金沢大学, 医学系, 教授 (10396864)
• 研究分担者: 飯島 将司 金沢大学, 附属病院, 助教 (70749168) ; 並木 幹夫 金沢大学, 医学系, 特任教授 (70155985)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円); 2017年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2016年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円); 2015年度: 7,930千円 (直接経費: 6,100千円、間接経費: 1,830千円)
• キーワード: 男性不妊症 / ゲノム / エピゲノム / 遺伝リスク

研究成果の概要

日本の特発性非閉塞性無精子症患者の全遺伝子エクソンの変異解析（エクソーム解析）や、精巣におけるエピジェネティック制御(DNAメチル化およびヒストン修飾)パターン分析などの多面的オミックス解析から、種々のタイプの変異（新生突然変異、エピゲノム変異、遺伝的リスクSNPなど）が蓄積する遺伝子が存在しうることが明らかになり、「不妊症ホットスポット遺伝子」候補を見いだした。また、ゲノムワイド関連解析から、健常日本人男性の精子運動率の個人差に関わる遺伝要因としてERBB4 (erb-b2 receptor tyrosine kinase 4)遺伝子SNP (rs3791686)を新たに同定した。

研究成果

• [雑誌論文] De novo non-synonymous TBL1XR1 mutation alters Wnt signaling activity. (2018)
  • 著者名/発表者名: Nishi Akira、Numata Shusuke、Tajima Atsushi、Zhu Xiaolei、Ito Koki、Saito Atsushi、Kato Yusuke、Kinoshita Makoto、Shimodera Shinji、Ono Shinji、Ochi Shinichiro、Imamura Akira、Kurotaki Naohiro、Ueno Shu-ichi、Iwata Nakao、Fukui Kiyoshi、Imoto Issei、Kamiya Atsushi、Ohmori Tetsuro
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 7 ページ: 2887-2887
  • DOI: 10.1038/s41598-017-02792-z
  • NAID: 120006309984
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
• [雑誌論文] Association of TUSC1 and DPF3 gene polymorphisms with male infertility. (2018)
  • 著者名/発表者名: Sato Youichi、Hasegawa Chise、Tajima Atsushi、Nozawa Shiari、Yoshiike Miki、Koh Eitetsue、Kanaya Jiro、Namiki Mikio、Matsumiya Kiyomi、Tsujimura Akira、Komatsu Kiyoshi、Itoh Naoki、Eguchi Jiro、Yamauchi Aiko、Iwamoto Teruaki
  • 雑誌名: J Assist Reprod Genet 巻: 35 ページ: 257-263
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
• [雑誌論文] Genome-wide association study identifies ERBB4 on 2q34 as a novel locus associated with sperm motility in Japanese men. (2018)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Tajima A, Sato T, Nozawa S, Yoshiike M, Imoto I, Yamauchi A, Iwamoto T
  • 雑誌名: J Med Genet. 巻: - ページ: 415-21
  • DOI: 10.1136/jmedgenet-2017-104991
  • 査読あり / オープンアクセスとしている
• [雑誌論文] Prothymosin alpha-deficiency enhances anxiety-like behaviors and impairs learning/memory functions and neurogenesis (2017)
  • 著者名/発表者名: Ueda H, Sasaki K, Halder SK, Deguchi Y, Takao K, Miyakawa T, Tajima A
  • 雑誌名: Journal of Neurochemistry 巻: 141 号: 1 ページ: 124-136
  • DOI: 10.1111/jnc.13963
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Association of common polymorphisms with gestational diabetes mellitus in Japanese women: A case-control study. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kasuga, Y. Hata, K. Tajima, A. Ochiai, D. Saisho, Y. Matsumoto, T. Arata, N. Miyakoshi, K. Tanaka, M.
  • 雑誌名: Endocr J 巻: 64 号: 4 ページ: 463-475
  • DOI: 10.1507/endocrj.EJ16-0431
  • NAID: 130005630406
  • ISSN: 0918-8959
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Folding of the Cerebral Cortex Requires Cdk5 in Upper-Layer Neurons in Gyrencephalic Mammals. (2017)
  • 著者名/発表者名: Shinmyo Yohei、Terashita Yukari、Dinh Duong Tung Anh、Horiike Toshihide、Kawasumi Muneo、Hosomichi Kazuyoshi、Tajima Atsushi、Kawasaki Hiroshi
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 20 ページ: 2131-2143
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2017.08.024
  • NAID: 120006374153
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
• [雑誌論文] Whole-exome sequencing analysis of supernumerary teeth in Japanese individuals (2017)
  • 著者名/発表者名: Takahashi M, Hosomichi K, Yamaguchi T, Yano K, Funatsu T, Adel M, Haga S, Maki K, Tajima A
  • 雑誌名: Hum Genome Var. 巻: 印刷中 ページ: 16046-16046
  • DOI: 10.1038/hgv.2016.46
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
• [雑誌論文] A partial nuclear genome of the Jomons who lived 3000 years ago in Fukushima, Japan (2017)
  • 著者名/発表者名: Kanzawa-Kiriyama H, Kryukov K, Jinam TA, Hosomichi K, Saso A, Suwa G, Ueda S, Yoneda M, Tajima A, Shinoda KI, Inoue I, Saitou N. A partial nuclear genome of the Jomons who lived 3000 years ago in Fukushima, Japan
  • 雑誌名: J Hum Genet. 巻: 印刷中 ページ: 213-221
  • DOI: 10.1038/jhg.2016.110
  • NAID: 40021064864
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] An independent validation study of three single nucleotide polymorphisms at the sex hormone-binding globulin locus for testosterone levels identified by genome-wide association studies (2017)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Tajima A, Katsurayama M, Nozawa S, Yoshiike M, Koh E, Kanaya J, Namiki M, Matsumiya K, Tsujimura A, Komatsu K, Itoh N, Eguchi J, Imoto I, Yamauchi A, Iwamoto T.
  • 雑誌名: Human Reproduction Open 巻: 2017 ページ: 1-8
  • DOI: 10.1093/hropen/hox002
  • NAID: 120006380963
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A homozygous mutation of VWA3B causes cerebellar ataxia with intellectual disability. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kawarai T, Tajima A, Kuroda Y, Saji N, Orlacchio A, Terasawa H, Shimizu H, Kita Y, Izumi Y, Mitsui T, Imoto I, Kaji R.
  • 雑誌名: J Neurol Neurosurg Psychiatry 巻: 87 ページ: 656-662
  • DOI: 10.1136/jnnp-2014-309828
  • 査読あり
• [雑誌論文] A replication study of a candidate locus for follicle-stimulating hormone levels and association analysis for semen quality traits in Japanese men. (2016)
  • 著者名/発表者名: Y.Sato, A.Tajima, M.Katsurayama, S.Nozawa, M.Yoshiike, E.Koh, J.Kanaya, M.Namiki, K.Matsumiya, A.Tsujimura, K.Komatsu, N.Itoh, J.Eguchi, I.Imoto, A.Yamauchi, T.Iwamoto
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 61 ページ: 911-915
  • DOI: 10.1038/jhg.2016.82
  • NAID: 120005951705
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A de novo mutation of the LDL receptor gene as the cause of familial hypercholesterolemia identified using whole exome sequencing (2016)
  • 著者名/発表者名: Tada H, Hosomichi K, Okada H, Kawashiri MA, Nohara A, Inazu A, Tomizawa S, Tajima A, Mabuchi H, Hayashi K.
  • 雑誌名: Clinica Chimica Acta 巻: 453 ページ: 194-196
  • DOI: 10.1016/j.cca.2015.12.028
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] CRISPR/Cas9-mediated gene knockout in the mouse brain using in utero electroporation (2016)
  • 著者名/発表者名: Shinmyo Y, Tanaka S, Tsunoda S, Hosomichi K, Tajima A, Kawasaki H.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 6 ページ: 20611-20611
  • DOI: 10.1038/srep20611
  • NAID: 120005764199
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Lack of replication of four candidate SNPs implicated in human male fertility traits: a large-scale population-based study. (2015)
  • 著者名/発表者名: Youichi Sato, Atsushi Tajima, Kouki Tsunematsu, Shiari Nozawa, Miki Yoshiike, Eitetsue Koh, Jiro Kanaya, Mikio Namiki, Kiyomi, Matsumiya, Akira Tsujimura, Kiyoshi Komatsu, Naoki Itoh, Jiro Eguchi, Issei Imoto, Aiko Yamauchi, Teruaki Iwamoto.
  • 雑誌名: Hum Reprod 巻: 30 ページ: 1505-1509
  • DOI: 10.1093/humrep/dev081
  • NAID: 120005661919
  • 査読あり
• [雑誌論文] An association study of four candidate loci for human male fertility traits with male infertility. (2015)
  • 著者名/発表者名: Youichi Sato, Atsushi Tajima, Kouki Tsunematsu, Shiari Nozawa, Miki Yoshiike, Eitetsue Koh, Jiro Kanaya, Mikio Namiki, Kiyomi, Matsumiya, Akira Tsujimura, Kiyoshi Komatsu, Naoki Itoh, Jiro Eguchi, Issei Imoto, Aiko Yamauchi, Teruaki Iwamoto.
  • 雑誌名: Hum Reprod 巻: 30 ページ: 1510-1514
  • DOI: 10.1093/humrep/dev088
  • NAID: 120005661918
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sex differences of leukocytes DNA methylation adjusted for estimated cellular proportions. (2015)
  • 著者名/発表者名: Inoshita M, Numata S, Tajima A, Kinoshita M, Umehara H, Yamamori H, Hashimoto R, Imoto I, Ohmori T.
  • 雑誌名: Biol Sex Differ 巻: 6 ページ: 11-11
  • DOI: 10.1186/s13293-015-0029-7
  • NAID: 120005646687
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
• [雑誌論文] The impact of next-generation sequencing technologies on HLA research. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Shiina T, Tajima A, Inoue I.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 60 ページ: 665-673
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.102
  • NAID: 40020655134
  • 査読あり / オープンアクセスとしている
• [学会発表] Sequence Capture法によるKIRハプロタイプ構造決定と日本人におけるその多様性 (2017)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、井ノ上逸朗、田嶋敦、中岡博史、椎名隆、東史啓、猪子英俊、屋部登志雄、森島泰雄
  • 学会等名: 第26回日本組織適合性学会大会
• [学会発表] 古代ゲノム解析から推定される北アジアの人類集団史 (2017)
  • 著者名/発表者名: 佐藤丈寛、安達登、木村亮介、米田穣、太田博樹、田嶋敦、豊田敦、松前ひろみ、小金渕佳江、清水健太郎、埴原恒彦、Andrzej Weber、加藤博文、石田肇
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第62回大会
• [学会発表] GWASによる精子濃度の関連遺伝子座の探索 (2017)
  • 著者名/発表者名: 木口美沙妃、佐藤陽一、田嶋敦、佐藤丈寛、井本逸勢、岩本晃明、山内あい子
  • 学会等名: 2017年度生命科学系学会合同年次大会（ConBio2017）
• [学会発表] GWASによる血中inhibin Bレベル関連遺伝子座の探索 (2017)
  • 著者名/発表者名: 小薬鈴、佐藤陽一、田嶋敦、佐藤丈寛、井本逸勢、岩本晃明、山内あい子
  • 学会等名: 2017年度生命科学系学会合同年次大会（ConBio2017）
• [学会発表] 北海道礼文島浜中２遺跡出土オホーツク文化期人骨のゲノム解析． (2016)
  • 著者名/発表者名: 佐藤丈寛、安達登、木村亮介、米田穣、太田博樹、田嶋敦、松前ひろみ、清水健太郎、Andrzej Weber、加藤博文、石田肇．
  • 学会等名: 第70回日本人類学会大会
  • 発表場所: NSG学生総合プラザSTEP（新潟）
  • 年月日: 2016-10-08
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いた未診断疾患への取り組み． (2016)
  • 著者名/発表者名: 田嶋敦．
  • 学会等名: 第70回日本小児神経学会北陸地方会公開シンポジウム
  • 発表場所: 金沢大学附属病院 宝ホール（金沢）
  • 年月日: 2016-09-04
  • 招待講演
• [学会発表] A replication study of four candidate loci for sex hormone levels, identified by genome-wide association studies. (2016)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Tajima A, Katsurayama M, Imoto I, Yamauchi A, Iwamoto T.
  • 学会等名: ICHG2016（第13回国際人類遺伝学会）
  • 発表場所: 国立京都国際会館（京都）
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際共著/国際学会である
• [学会発表] High-throughput sequencing method of the KIR haplotype for integrated MHC-KIR genotyping approach for clinical applications. (2016)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Yabe T, Shiina T, Tajima A, Inoue I.
  • 学会等名: ICHG2016（第13回国際人類遺伝学会）
  • 発表場所: 国立京都国際会館（京都）
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際共著/国際学会である
• [学会発表] 性ホルモン関連遺伝子座3 SNPsの日本人男性を対象としたreplication解析． (2015)
  • 著者名/発表者名: 葛山元貴、佐藤陽一、田嶋敦、井本逸勢、岩本晃明、山内あい子．
  • 学会等名: 第54回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会 中国四国支部学術大会
  • 発表場所: 高知市文化プラザ かるぽーと（高知）
  • 年月日: 2015-10-31
• [学会発表] 細胞異種性を考慮した末梢血白血球のDNAメチル化の性差の検討． (2015)
  • 著者名/発表者名: 井下真利、沼田周助、田嶋敦、木下誠、梅原英裕、山森英長、橋本亮太、井本逸勢、大森哲郎．
  • 学会等名: 第45回日本神経精神薬理学会・第37回日本生物学的精神医学会 合同年会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京）
  • 年月日: 2015-09-24
• [備考] 金沢大学医薬保健研究域医学系 革新ゲノム情報学分野
  • URL: http://big.w3.kanazawa-u.ac.jp
• [備考] 金沢大学 医薬保健研究域医学系 革新ゲノム情報学分野
  • URL: http://big.w3.kanazawa-u.ac.jp