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長鎖ノンコーディングRNA、SRAによる転写制御の構造的基礎

研究課題

研究課題/領域番号 15H04339
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関首都大学東京

研究代表者

三島 正規  首都大学東京, 理工学研究科, 准教授 (70346310)

研究分担者 田岡 万悟  首都大学東京, 理工学研究科, 准教授 (60271160)
藤原 俊伸  近畿大学, 薬学部, 教授 (80362804)
河原 行郎  大阪大学, 医学系研究科, 教授 (80542563)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
16,120千円 (直接経費: 12,400千円、間接経費: 3,720千円)
2017年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2016年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2015年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
キーワードlncRNA / SHARP / SRA / XIST / NMR / RBM15 / Xist / ノンコーディングRNA / CLIP法 / ncRNA
研究成果の概要

長鎖ノンコーディング(lnc)RNAのひとつであるSRA(steroid hormone receptor RNA activator)は、転写されたRNA分子自身が多くの因子と相互作用し、転写を調節する足場分子として機能する。SHARPタンパク質はSRAと直接相互作用し、HDACをリクルートすることで核内受容体による転写を抑制的に制御する。本研究では、SHARPによる転写調節の分子機構の解明を目指し、SHARP・SRA複合体の構造解析、またCLIP等の生化学的手法により解析を行った。SHARPのホモログRBM15や、カウンターパートとしてlncXISTの解析も行った。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2018 2017 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 3件、 招待講演 2件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] ミュンヘン工科大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] ミュンヘン工科大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [雑誌論文] Parkinson’s disease-related DJ-1 functions in thiol quality control against aldehyde attack in vitro2017

    • 著者名/発表者名
      Matsuda Noriyuki、Kimura Mayumi、Queliconi Bruno Barros、Kojima Waka、Mishima Masaki、Takagi Kenji、Koyano Fumika、Yamano Koji、Mizushima Tsunehiro、Ito Yutaka、Tanaka Keiji
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 7 号: 1 ページ: 12816-12816

    • DOI

      10.1038/s41598-017-13146-0

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Chemical shift assignments of the first and second RRMs of Nrd1, a fission yeast MAPK-target RNA binding protein2017

    • 著者名/発表者名
      Ayaho KobayashiTeppei KanabaRyosuke SatohYutaka ItoReiko SugiuraMasaki Mishima
    • 雑誌名

      Biomolecular NMR Assignments

      巻: 印刷中 号: 2 ページ: 123-126

    • DOI

      10.1007/s12104-017-9731-1

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A new carbamidemethyl-linked lanthanoid chelating tag for PCS NMR spectroscopy of proteins in living HeLa cells2016

    • 著者名/発表者名
      Hikone Y, Hirai G, Mishima M, Inomata K, Ikeya T, Arai S, Shirakawa M, Sodeoka M, Ito Y
    • 雑誌名

      J. Biomol. NMR

      巻: 66 ページ: 99-110

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 転写抑制補因子の複合体形成におけるCK2によるリン酸化の分子スイッチとしての役割2015

    • 著者名/発表者名
      三島 正規,小林 彩保,金場 哲平
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 87 号: 2 ページ: 258-261

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2015.870258

    • NAID

      40020461744

    • ISSN
      0037-1017
    • 年月日
      2015-04-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] NMR meets Neutron on the cutting edge2018

    • 著者名/発表者名
      三島 正規
    • 学会等名
      2017年度 第2回 水和ナノ構造研究会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 溶液NMRを用いたlncRNA結合タンパク質SHARPの構造解析2017

    • 著者名/発表者名
      永井敢、小林彩保、伊藤隆、三島正規
    • 学会等名
      第56回NMR討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 溶液NMR法を用いたRNA結合性タンパク質SHARPの構造解析2017

    • 著者名/発表者名
      永井敢、小林彩保、伊藤隆、三島正規
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Structural analysis of flexible multi-domain proteins.2017

    • 著者名/発表者名
      Masaki Mishima
    • 学会等名
      2017 Taiwan-Japan biomedical symposium on magnetic resonance
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural analysis of a multi-domain protein using long-range distance information derived by solution NMR2016

    • 著者名/発表者名
      永井 敢、小林 彩保、伊藤 隆、三島 正規
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] NMRとSAXSによるRNA結合性マルチドメインタンパク質Nrd1の構造解析・ポスター2016

    • 著者名/発表者名
      小林彩保,永井敢,佐藤亮介,伊藤隆,杉浦麗子,三島正規
    • 学会等名
      第55回NMR討論会
    • 発表場所
      広島国際会議場(広島県広島市)
    • 年月日
      2016-11-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Structural Analysis of Flxible Multi-Domain Proteins2016

    • 著者名/発表者名
      Ayaho Kobayashi, Kan Nagai, Akihiro Kido, Yutaka Ito, Masaki Mishima
    • 学会等名
      The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • 年月日
      2016-08-21
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural study of the an RNA-binding protein Nrd1 by combination approach using NMR and SAXS2016

    • 著者名/発表者名
      Ayaho Kobayashi, Kan Nagai, Ryosuke Satoh, Toshinobu Fujiwara, Yutaka Ito, Reiko Sugiura, Masaki Mishima
    • 学会等名
      The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • 年月日
      2016-08-21
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] lncRNA結合タンパク質SHARPの構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      永井 敢,小林 彩保, 伊藤 隆,三島 正規
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] lncRNA結合タンパク質SHARPの構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      永井 敢、小林 彩保、伊藤 隆、三島 正規
    • 学会等名
      第54回NMR討論会
    • 発表場所
      千葉工業大学(習志野市、千葉県)
    • 年月日
      2015-11-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] RNA 結合性マルチドメインタンパク質Nrd1 の溶液状態における構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      小林 彩保、佐藤 亮介、藤原 俊伸、伊藤 隆、杉浦 麗子、三島 正規
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市、徳島県)
    • 年月日
      2015-06-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] カイコ幼虫を用いた活性型PKB の発現と精製2015

    • 著者名/発表者名
      前崎 綾子、佐藤 亮介、田岡 万悟、金場 哲平、朝野 維起、藤田 千春、藤原 俊伸、伊藤 隆、礒辺 俊明、箱嶋 敏雄、前仲 勝実、三島 正規
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市、徳島県)
    • 年月日
      2015-06-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] 化学結合論2017

    • 著者名/発表者名
      橋本健朗、佐藤総一、西長亨、廣田耕志、三島正規
    • 総ページ数
      258
    • 出版者
      放送大学教育振興会
    • ISBN
      9784595317460
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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