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アーキアべん毛研究の基盤構築

研究課題

研究課題/領域番号 15H04364
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関学習院大学

研究代表者

西坂 崇之  学習院大学, 理学部, 教授 (40359112)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
15,990千円 (直接経費: 12,300千円、間接経費: 3,690千円)
2018年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2017年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2016年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2015年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
キーワードアーキア / 分子モーター / 光学顕微鏡 / アーキアべん毛 / アーキアラ / ハロアーキア / IV型分泌装置 / ATP駆動型回転モーター / ハロバクテリウム / クロスカイモグラフィー / クロス・カイモグラフィー / archaella / 遊泳運動 / 回転分子モーター / アーキアモーター / archaea / Halobacterium salinarum
研究成果の概要

生命科学において未踏の領域であった、アーキア(古細菌)が遊泳するメカニズムについて、生物物理学の視点より解明した。極限環境で生息するアーキアのべん毛は、理解が進んでいる真核生物の分子モーターや大腸菌のべん毛と異なり、分泌装置がベースとなったATP駆動による独自の運動機構を備えている。このアーキアべん毛について、らせんの構造・運動装置の特徴・それが生み出す流体への推進力の定量化・単位素子が生み出すステップを検出し、原著論文としてNature Microbiologyに発表した。さらにエネルギー変換の詳細を明らかにすることによって、全てのATP駆動型回転モーターに適応できる新しい学説を提案した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

分子モーターは化学エネルギーを力学運動に変換する機能を持つ蛋白質である。究極のナノマシンであるという認識から、モーターの研究はここ20年で飛躍的な進歩を遂げたが、アーキア遊泳を生み出す装置は手つかずのまま残されていた。この分子メカニズムは、細菌学のみならず生物物理・進化・タンパク質科学からも注目すべき課題であるはずだが、培養条件や実験の再現性の難しさから、世界的に見てもドイツの1グループを除いて大きな進展は見られなかったのである。本課題では、遊泳の仕組みを分子メカニズムにまで踏み込んで明らかにすることに成功した。生物物理においてアーキアモーターという新しい研究分野が開拓されたことになる。

報告書

(5件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (40件)

すべて 2019 2018 2017 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (18件) (うち国際共著 3件、 査読あり 17件、 オープンアクセス 13件、 謝辞記載あり 5件) 学会発表 (21件) (うち国際学会 15件、 招待講演 15件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Structural Biology, ASB/ABA meeting, Melbourne2019

    • 著者名/発表者名
      Sani Marc-Antoine、Nishizaka Takayuki
    • 雑誌名

      Biophysical Reviews

      巻: NA 号: 3 ページ: 275-276

    • DOI

      10.1007/s12551-019-00518-1

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] Single-molecule pull-out manipulation of the shaft of the rotary motor F1-ATPase2019

    • 著者名/発表者名
      Naito Tatsuya M.、Masaike Tomoko、Nakane Daisuke、Sugawa Mitsuhiro、Okada Kaoru A.、Nishizaka Takayuki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1038/s41598-019-43903-2

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Characterization of zoospore type IV pili in Actinoplanes missouriensis2019

    • 著者名/発表者名
      Kimura Tomohiro、Tezuka Takeaki、Nakane Daisuke、Nishizaka Takayuki、Aizawa Shin-Ichi、Ohnishi Yasuo
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology

      巻: in press 号: 14

    • DOI

      10.1128/jb.00746-18

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Circular orientation fluorescence emitter imaging (COFEI) of rotational motion of motor proteins2018

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro Sugawa, Tomoko Masaike, Nagisa Mikami, Shin Yamaguchi, Keitaro Shibata, Kei Saito, Fumihiko Fujii, Yoko Y Toyoshima, Takayuki Nishizaka, Junichiro Yajima.
    • 雑誌名

      Biochemical and biophysical research communications

      巻: 504 号: 4 ページ: 709-714

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2018.08.178

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Detailed analyses of stall force generation in Mycoplasma mobile gliding.2018

    • 著者名/発表者名
      Mizutani M, Tulum I, Kinosita Y, Nishizaka T and Miyata M
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 114 号: 6 ページ: 1411-9

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2018.01.029

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cross-kymography analysis to simultaneously quantify the function and morphology of the archaellum2018

    • 著者名/発表者名
      Kinosita Yoshiaki、Nishizaka Takayuki
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 15 号: 0 ページ: 121-128

    • DOI

      10.2142/biophysico.15.0_121

    • NAID

      130006733966

    • ISSN
      2189-4779
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Linear motor driven-rotary motion of a membrane-permeabilized ghost in Mycoplasma mobile2018

    • 著者名/発表者名
      Kinosita Yoshiaki、Miyata Makoto、Nishizaka Takayuki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8 号: 1 ページ: 11513-11513

    • DOI

      10.1038/s41598-018-29875-9

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Three-dimensional tracking of microbeads attached to the tip of single isolated tracheal cilia beating under external load2018

    • 著者名/発表者名
      Katoh Takanobu A.、Ikegami Koji、Uchida Nariya、Iwase Toshihito、Nakane Daisuke、Masaike Tomoko、Setou Mitsutoshi、Nishizaka Takayuki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8 号: 1 ページ: 15562-15562

    • DOI

      10.1038/s41598-018-33846-5

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Unforeseen swimming and gliding mode of an insect gut symbiont, Burkholderia sp. RPE64, with wrapping of the flagella around its cell body2017

    • 著者名/発表者名
      Kinosita Yoshiaki、Kikuchi Yoshitomo、Mikami Nagisa、Nakane Daisuke、Nishizaka Takayuki
    • 雑誌名

      The ISME Journal

      巻: 12 号: 3 ページ: 838-848

    • DOI

      10.1038/s41396-017-0010-z

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Asymmetric distribution of type IV pili triggered by directional light in unicellular cyanobacteria2017

    • 著者名/発表者名
      Nakane Daisuke、Nishizaka Takayuki
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 114 号: 25 ページ: 6593-6598

    • DOI

      10.1073/pnas.1702395114

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dissection of the angle of single fluorophore attached to the nucleotide in corkscrewing microtubules2017

    • 著者名/発表者名
      Fujimura, S. Ito, Y. Ikeguchi, M. Adachi, K. Yajima, J. Nishizaka, T.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun

      巻: 485 号: 3 ページ: 614-620

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2017.01.165

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Directed binding of gliding bacterium, Mycoplasma mobile, shown by detachment force and bond lifetime2016

    • 著者名/発表者名
      Tanaka A, Nakane D, Mizutani M, Nishizaka T, Miyata M
    • 雑誌名

      mBio

      巻: 7 号: 3 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1128/mbio.00455-16

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] F1-ATPase conformational cycle from simultaneous single-molecule FRET and rotation measurements2016

    • 著者名/発表者名
      Sugawa, M. Okazaki, K. I. Kobayashi, M. Matsui, T. Hummer, G. Masaike, T. Nishizaka, T.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 0 号: 21 ページ: 0-0

    • DOI

      10.1073/pnas.1524720113

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書 2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Direct observation of rotation and steps of the archaellum in the swimming halophilic archaeon Halobacterium salinarum2016

    • 著者名/発表者名
      Kinosita, Y. Uchida, N. Nakane, D. Nishizaka, T.
    • 雑誌名

      Nat Microbiol

      巻: 1 号: 11 ページ: 16148-16148

    • DOI

      10.1038/nmicrobiol.2016.148

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Directed binding of gliding bacterium, Mycoplasma mobile, shown by detachment force and bond lifetime2016

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, A. Nakane, D. Mizutani, M. Nishizaka, T. Miyata, M.
    • 雑誌名

      mBio

      巻: 0 ページ: 0-0

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-Dimensional Superlocalization Imaging of Gliding Mycoplasma mobile by Extraordinary Light Transmission through Arrayed Nanoholes2015

    • 著者名/発表者名
      Lee, W. Kinosita, Y. Oh, Y. Mikami, N. Yang, H. Miyata, M. Nishizaka, T. Kim, D.
    • 雑誌名

      ACS Nano

      巻: 9 号: 11 ページ: 10896-908

    • DOI

      10.1021/acsnano.5b03934

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Bacteriocin Protein BacL1 of Enterococcus faecalis Targets CelDivision Loci and Specifically Recognizes L-Ala2-Cross-Bridged Peptidoglycan2015

    • 著者名/発表者名
      Jun Kurushima, Daisuke Nakane, Takayuki Nishizaka, Haruyoshi Tomitaa
    • 雑誌名

      Juornal of Bacteriology

      巻: 197 号: 2 ページ: 286-295

    • DOI

      10.1128/jb.02203-14

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Torque Generation by Axonemal Outer-Arm Dynein2014

    • 著者名/発表者名
      Shin Yamaguchi, Kei Saito, Miki Sutoh, Takayuki Nishizaka, Yoko Y Toyoshima, Junichiro Yajima
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 108 号: 4 ページ: 872-879

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2014.12.038

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Insights into the mechanism of archaellar motor rotation from observation of unexpectedly high torque2018

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T., Iwata, S. & Nakane, D.
    • 学会等名
      Asian Biophysics Association Symposium and Annual Meeting of the Australian Society for Biophysics
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] APPLICATION OF SINGLE-MOLECULE TECHNIQUES TO SUPRAMOLECULAR MACHINERY IN BACTERIA AND ARCHAEA2018

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T., Iwata, S. & Nakane, D.
    • 学会等名
      Les Houches-TSRC Workshop on Protein Dynamics
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Discoveries of Novel Motion Mechanisms of Archaea and Bacteria2018

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      新学術領域 "ゆらぎと構造の協奏" 若手研究会「統計物理学とその周辺」
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Visualization of Behavior of Virus and Proteins in Planova Membrane Filters Using Advanced Microscope System with Confocal Optics2018

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      THE 21st PLANOVA WORKSHOP
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] アーキアラとIV型線毛のモーターの動態を可視化する2017

    • 著者名/発表者名
      西坂崇之
    • 学会等名
      日本物理学会 第72回年次大会
    • 発表場所
      大阪大学 豊中キャンパス
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Unitary steps of supermolecular motility machineries in gliding bacteria and swimming archaea2017

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Nishizaka
    • 学会等名
      Bacterial Flagella, Injectisomes and Type III Secretion Systems
    • 発表場所
      Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University
    • 年月日
      2017-03-01
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] "Single-molecule detection of biomolecules and protein conformational dynamics."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T Fujimura, S. Sohma, Y. Nakane, D
    • 学会等名
      第55回 日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] "Development of optical-microscope techniques for single-molecule biophysics and their application to microbiology."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      10th International Conference on Advanced Materials and Devices
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] "Development of Imaging Techniques to Reveal Singl-Protein Dynamics and their Application to Microbiology."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      International Symposium on Fluctuation and Structure out of Equilibrium 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] “Development of Techniques for Single-Molecule Detection of Protein Conformational Dynamics and Their Application to Microbiology.”2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      The 2nd Korea-Japan Joint Symposium on Single-Molecule Biophysics
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] "Direct observation of dynamics in Type IV pili system and archaella motor."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      19th IUPAB congress and 11th EBSA congress
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] "Development of imaging techniques to reveal single-protein dynamics and their application to microbiology."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      Telluride Science Research Center Workshop on Protein Dynamics
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] "Application of single-molecule techniques to supramolecular machinery in bacteria and archaea."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      The 15th International Conference of “Na,K-ATPases and Related Transport ATPases”
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural and functional dynamics of nanoscale molecular motors2016

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Nishizaka Y. Kinosita T. A. Katoh D. Nakane
    • 学会等名
      31st International Congress on High Speed Imaging and Photonics
    • 発表場所
      Hotel Hankyu Expo Park
    • 年月日
      2016-11-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Visualization of dynamics of motors in archaella and type IV pili system2016

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Nishizaka
    • 学会等名
      Current and Future Perspectives in Active Matter
    • 発表場所
      The University of Tokyo
    • 年月日
      2016-10-28
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光学顕微鏡技術の新展開:膜超分子モーターへの先進的な応用 シンポジウム「膜タンパク分子作動原理解明の新基軸」2016

    • 著者名/発表者名
      西坂崇之
    • 学会等名
      第89回日本生化学会大会
    • 発表場所
      東北大学川内北キャンパス
    • 年月日
      2016-09-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Unitary Steps of Supermolecular Motility Machineries in Gliding Bacteria and Swimming Arcaea2016

    • 著者名/発表者名
      Kinosita, Yoshiaki Nakane, Daisuke Uchida, Nariya Miyata, Makoto Nishizaka, Takayuki
    • 学会等名
      Biophyscial Society 60th Annual Meeting
    • 発表場所
      Los Angeles Convention Center, Los Angeles, California
    • 年月日
      2016-02-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Real-time imaging of a polymorphism, rotation rate and stepwise rotation of archaeal flagella (archaella)2016

    • 著者名/発表者名
      Kinosita, Y Uchida, N Nakane, D Nishizaka, T
    • 学会等名
      Sensory transduction in Microorganism (Gordon conference)
    • 発表場所
      January 17-22, 2016
    • 年月日
      2016-01-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Detection of rotation of archaeal flagella under advanced optical microscopes2015

    • 著者名/発表者名
      Kinosita, Yoshiaki Nakane, Daisuke Nishizaka, Takayuki
    • 学会等名
      Pacifichem 2015
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Mechanics of Motor Proteins and Supermolecular Motility Machinery Revealed under Advanced Optical Microscopes2015

    • 著者名/発表者名
      西坂崇之
    • 学会等名
      WPI-next international workshop ~~High resolution cell biology~~
    • 発表場所
      E & S building, Nagoya Univ.
    • 年月日
      2015-10-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] シンポジウム「べん毛・繊毛が織りなす多様な生命現象に挑む ~分子から個体まで~ Diverse functions of flagella and cilia; -From molecules to mammalian development-」 先進光学顕微鏡により明らかになる繊毛とアーキアべん毛の力学機能 Mechanical function of cilia and archaeal flagella resolved by advanced optical microscopes2015

    • 著者名/発表者名
      西坂崇之
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学 角間キャンパス 自然科学本館
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] Katoh, T. A. Fujimura, S. Nishizaka, T.2015

    • 著者名/発表者名
      Katoh, T. A. Fujimura, S. Nishizaka, T.
    • 総ページ数
      15
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2020-03-30  

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