植物ゲノムにおける遺伝子内トランスポゾンのエピジェネティック制御

• 研究課題/領域番号: 15H04405
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 遺伝・染色体動態
• 研究機関: 沖縄科学技術大学院大学
• 研究代表者: 佐瀬 英俊 沖縄科学技術大学院大学, 植物エピジェネティクスユニット, 准教授 (70510006)
• 研究協力者: レ トゥゴ 沖縄科学技術大学院大学, 植物エピジェネティクスユニット (30748249) ; 宮崎 裕士 沖縄科学技術大学院大学, 植物エピジェネティクスユニット (40708773)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 12,610千円 (直接経費: 9,700千円、間接経費: 2,910千円); 2017年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2016年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2015年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
• キーワード: エピジェネティクス / トランスポゾン / 植物ゲノム / 植物遺伝学

研究成果の概要

動植物を含む真核生物のゲノムの大部分はトランスポゾンなどのリピート配列によって形成されており、その一部は遺伝子内に挿入されている。本研究課題では植物ゲノムにおいて遺伝子内トランスポゾンがどう制御されているのかを明らかにすることを目的とした。我々の解析からシロイヌナズナではおよそ３％のトランスポゾンが遺伝子内、特にイントロンに挿入されていることを見出した（Le et al., 2015). さらこれらリピート配列のサイレンシングにはRNA-directed DNAメチル化という経路に関与する因子とMET1, DDM1といった因子が必要であることを見出した.

研究成果

• [雑誌論文] 植物における遺伝子とトランスポゾンとの相互作用と環境への適応 (2018)
  • 著者名/発表者名: 佐瀬英俊
  • 雑誌名: 領域融合レビュー 巻: 7 ページ: e001
  • DOI: 10.7875/leading.author.7.e001
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Epigenetic regulation of intronic transgenes in Arabidopsis (2017)
  • 著者名/発表者名: Osabe K, Harukawa Y, Miura S, Saze H.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 7 号: 1 ページ: 45166-45166
  • DOI: 10.1038/srep45166
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A stress-Activated Transposon in Arabidopsis Induces transgenerational Abscisic Acid Insensitivity. Scientific Reports. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ito H, Kim JM, Matsunaga W, Saze H, Matsui A, Endo TA, Harukawa Y, Takagi H, Yaegashi H, Masuta Y, Masuda S, Ishida J, Tanaka M, Takahashi S, Morosawa T, Toyoda T, Kakutani T, Kato A, Seki M.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 6, Article number: 23181 号: 1 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1038/srep23181
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Epigenetic regulation of intragenic transposable elements impacts gene transcription in Arabidopsis thaliana. (2015)
  • 著者名/発表者名: Le Tu N., Miyazaki Y., Takuno S., Saze H.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 43 号: 8 ページ: 3911-21
  • DOI: 10.1093/nar/gkv258
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] DNA Methylation within Transcribed Regions. (2015)
  • 著者名/発表者名: To TK, Saze H, Kakutani T
  • 雑誌名: Plant Physiol 巻: 168 号: 4 ページ: 1219-1225
  • DOI: 10.1104/pp.15.00543
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Epigenetic regulation of intragenic transposons impacts gene transcription in Arabidopsis. (2017)
  • 著者名/発表者名: Hidetoshi Saze
  • 学会等名: Cutting Edge Developments in RNA biology for the Control of Gene Expression
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Epigenetic regulation of intronic repeats in plants (2017)
  • 著者名/発表者名: Hidetoshi Saze
  • 学会等名: Taiwan-Japan Plant Biology 2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Epigenetic regulation of genes and transposable elements in plants (2017)
  • 著者名/発表者名: Hidetoshi Saze
  • 学会等名: The 33rd Annual Meeting of the Society of Population Ecology
  • 招待講演
• [学会発表] 植物ゲノムにおける遺伝子内反復配列のエピジェネティック制御 (2016)
  • 著者名/発表者名: 佐瀬英俊
  • 学会等名: 日本遺伝学会第88会年会
  • 発表場所: 日本大学国際関係学部（静岡県三島市）
• [学会発表] Epigenetic Regulation of Repeats in Intronic Region in the Arabidopsis thaliana genome (2015)
  • 著者名/発表者名: 佐瀬英俊
  • 学会等名: 日本エピジェネティクス研究会
  • 発表場所: 学術総合センター
  • 年月日: 2015-05-25