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新型分割イントロンのスプライシング機構と進化多様性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15H04406
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 進化生物学
研究機関筑波大学

研究代表者

橋本 哲男  筑波大学, 生命環境系, 教授 (50208451)

研究分担者 奈良 武司  いわき明星大学, 薬学部, 教授 (40276473)
稲垣 祐司  筑波大学, 計算科学研究センター, 教授 (50387958)
谷藤 吾朗  独立行政法人国立科学博物館, 動物研究部, 研究員 (70438480)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
17,940千円 (直接経費: 13,800千円、間接経費: 4,140千円)
2017年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2016年度: 7,150千円 (直接経費: 5,500千円、間接経費: 1,650千円)
2015年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
キーワード機能進化 / スプライシング / 分割イントロン / ゲノム / Giardia / Kipferlia / スプライセオソーム
研究成果の概要

原始的真核生物の一候補である Giardia intestinalis のゲノム中に存在する、trans スプライシングにより切り出される新型分割イントロンに関する分子進化学的な解析をを行い、スプライシング機構の多様性と進化に関する知見を得た。まず、Giardia および近縁種における通常および分割イントロンの分布を探査し、近縁種であるKipferliaにおいて複数の分割イントロンを発見した。また、Giardia のスプライセオソーム構成因子を他の真核生物のデータと比較して分割イントロンのtrans スプライシングに関与する因子を探るために、スプライセオソームの単離と精製を目指す実験を行った。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] The draft genome of Kipferlia bialata reveals reductive genome evolution in fornicate parasites2018

    • 著者名/発表者名
      Tanifuji G, Takabayashi S, Kume K, Takagi M, Nakayama T, Kamikawa R, Inagaki Y, Hashimoto T
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 13 号: 3 ページ: e0194487-e0194487

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0194487

    • NAID

      120007134280

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Organelles that illuminate the origins of Trichomonas hydrogenosomes and Giardia mitosomes2017

    • 著者名/発表者名
      Leger M, Kolisko M, Ryoma Kamikawa, Stairs CW, Kume K, Cepicka I, Silberman JD, Andersson JO, Xu F, Yabuki A, Zhang Q, Takishita K, Inagaki Y, Simpson AGB, Hashimoto T, Roger AJ
    • 雑誌名

      Nature Ecology and Evolution

      巻: 1 号: 4 ページ: 0092-0092

    • DOI

      10.1038/s41559-017-0092

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Comparative genomics of mitochondria in chlorarachniophyte algae: endosymbiotic gene transfer and organellar genome dynamics.2016

    • 著者名/発表者名
      Goro Tanifuji, John M. Archibald, Tetsuo Hashimoto
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 6 号: 1 ページ: 21016-21016

    • DOI

      10.1038/srep21016

    • NAID

      120007129623

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] ランブル鞭毛虫近縁種における分割イントロン(splintron)の探索:splintron の普遍性と成立 過程の解明に向けて2017

    • 著者名/発表者名
      杉崎 真, 神川 龍馬, 稲垣 祐司, 橋本 哲男, 谷藤 吾朗
    • 学会等名
      日本寄生虫学会第86回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Comparative analysis of chlorarachniophyte mitochondrial genomes; evolutionary insights from genome architecture and endosymbiotic gene transfer2015

    • 著者名/発表者名
      Tanifuji G, Archbold JM, Hashimoto T
    • 学会等名
      VII ECOP-ISOP Joint Meeting
    • 発表場所
      Sevilla, Spain
    • 年月日
      2015-09-05
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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