| 研究課題/領域番号 |
15H04441
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
遺伝育種科学
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| 研究機関 | 公益財団法人かずさDNA研究所 |
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研究代表者 |
磯部 祥子 公益財団法人かずさDNA研究所, 先端研究部, 室長 (20343973)
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| 研究分担者 |
中谷 明弘 大阪大学, 医学系研究科, 特任教授(常勤) (60301149)
田中 勝 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, グループ長 (60391455)
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| 研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2017年度)
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| 配分額 *注記 |
16,640千円 (直接経費: 12,800千円、間接経費: 3,840千円)
2017年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2016年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2015年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
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| キーワード | 連鎖地図 / 高次倍数性 / 連鎖不平衡 / ゲノム配列 / 育種学 / 遺伝学 |
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| 研究成果の概要 |
連鎖解析はイチゴ品種「麗紅」の自殖第１世代（S1）とサツマイモ「徐薯18号」のS１集団および「徐薯18号」と「K123-11」の交雑によるF1集団などを用いて行った。従来法による連鎖地図作成ではイチゴ、サツマイモのS1集団では連鎖地図が作成できたが、サツマイモのF1集団では連鎖群の生成が困難だった。一方、解析法の開発ではマーカー間の連鎖不平衡の程度に基づいた連鎖地図作成用のソフトウェアの開発を進め、カイ二乗値に基づく全マーカー間の連鎖不平衡を評価する指標を算出し、その結果に基づいてマーカー間の遺伝学的な位置関係の階層構造を再構築するプログラムを作成した。
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