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オミクス統合シミュレィションを基軸にしたダイズ出芽期に耐湿性を付与する技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 15H04445
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 作物生産科学
研究機関筑波大学 (2016-2017)
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 (2015)

研究代表者

小松 節子  筑波大学, 生命環境系, 研究員 (90355751)

研究分担者 坂田 克己  前橋工科大学, 工学部, 教授 (90545419)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
15,730千円 (直接経費: 12,100千円、間接経費: 3,630千円)
2017年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2016年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2015年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
キーワードオミクス / シミュレイション / ダイズ / 湿害
研究成果の概要

ダイズは出芽期の梅雨による湿害に起因する収量低下が問題となって、生産拡大が進んでいない。そこで、出芽期の冠水抵抗性および除水後の回復過程をオミクス技術で解析し、シミュレイション法で絞り込んだ遺伝子について分子生物学的に検証する。冠水抵抗性突然変異ダイズやアブシジン酸を添加して冠水抵抗性を付加したダイズを用いて、プロテオミクス、トランスクリプトミクス、メタボロミクス解析を行った。その結果、解糖系とクエン酸回路周辺の代謝系の調節による、エネルギー供給制御の重要性を示唆した。さらに、ヘキソキナーゼの抑制によるフルクトースの蓄積が冠水耐性に関与していることが明らかになった。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (47件)

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (24件) (うち国際共著 5件、 査読あり 24件、 オープンアクセス 23件、 謝辞記載あり 5件) 学会発表 (23件) (うち国際学会 15件、 招待講演 13件)

  • [雑誌論文] Organ-Specific Proteomic Analysis of Early Vegetative Stage Soybean2018

    • 著者名/発表者名
      Khan Mudassar Nawaz、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      Protein Pept. Lett.

      巻: 24 号: 10 ページ: 897-908

    • DOI

      10.2174/0929866524666161111110627

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Subcellular Proteomics: Application to Elucidation of Flooding-Response Mechanisms in Soybean2018

    • 著者名/発表者名
      Komatsu Setsuko、Hashiguchi Akiko
    • 雑誌名

      Proteomes

      巻: 6 号: 1 ページ: 13-13

    • DOI

      10.3390/proteomes6010013

    • NAID

      120007127909

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Proteomic approaches to uncover the flooding and drought stress response mechanisms in soybean2018

    • 著者名/発表者名
      Wang Xin、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      J. Proteomics

      巻: 172 ページ: 201-215

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2017.11.006

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Phosphoproteomics: Protein Phosphorylation in Regulation of Seed Germination and Plant Growth2018

    • 著者名/発表者名
      Yin Xiaojian、Wang Xin、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      Curr. Protein Pept. Sci

      巻: 19 号: 4 ページ: 401-412

    • DOI

      10.2174/1389203718666170209151048

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Metabolic profiles of flooding-tolerant mechanism in early-stage soybean responding to initial stress2017

    • 著者名/発表者名
      Wang Xin、Zhu Wei、Hashiguchi Akiko、Nishimura Minoru、Tian Jingkui、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      Plant Molecular Biology

      巻: 94 号: 6 ページ: 669-685

    • DOI

      10.1007/s11103-017-0635-3

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Proteomic Analysis of Calcium Effects on Soybean Root Tip under Flooding and Drought Stresses2017

    • 著者名/発表者名
      Wang Xin、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol.

      巻: 58 号: 8 ページ: 1405-1420

    • DOI

      10.1093/pcp/pcx078

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Integration of gel-based and gel-free proteomic data for functional analysis of proteins through Soybean Proteome Database2017

    • 著者名/発表者名
      Komatsu Setsuko、Wang Xin、Yin Xiaojian、Nanjo Yohei、Ohyanagi Hajime、Sakata Katsumi
    • 雑誌名

      J. Proteomics

      巻: 163 ページ: 52-66

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2017.05.009

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Organ-specific proteomics of soybean seedlings under flooding and drought stresses2017

    • 著者名/発表者名
      Wang Xin、Khodadadi Ehsaneh、Fakheri Baratali、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      J. Proteomics

      巻: 162 ページ: 62-72

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2017.04.012

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Proteomic analysis of soybean seedling leaf under waterlogging stress in a time-dependent manner2017

    • 著者名/発表者名
      Kazemi Oskuei Bita、Yin Xiaojian、Hashiguchi Akiko、Bandehagh Ali、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics

      巻: 1865 号: 9 ページ: 1167-1177

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2017.06.022

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Comprehensive analysis of response and tolerant mechanisms in early-stage soybean at initial-flooding stress2017

    • 著者名/発表者名
      Yin Xiaojian、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      J. Proteomics

      巻: 169 ページ: 225-232

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2017.01.014

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Transcriptomic analysis reveals the flooding tolerant mechanism in flooding tolerant line and abscisic acid treated soybean2017

    • 著者名/発表者名
      Yin Xiaojian、Hiraga Susumu、Hajika Makita、Nishimura Minoru、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      Plant Mol. Biol.

      巻: 93 号: 4-5 ページ: 479-496

    • DOI

      10.1007/s11103-016-0576-2

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation, Purity Assessment, and Proteomic Analysis of Nuclei2017

    • 著者名/発表者名
      Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      Methods Mol. Biol.

      巻: 1696 ページ: 81-90

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-7411-5_5

    • ISBN
      9781493974092, 9781493974115
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Improvement of Soybean Products Through the Response Mechanism Analysis Using Proteomic Technique2017

    • 著者名/発表者名
      Wang Xin、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      Adv. Food Nutr. Res.

      巻: 82 ページ: 117-148

    • DOI

      10.1016/bs.afnr.2016.12.006

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Loss of variation of state detected in soybean metabolic and human myelomonocytic leukaemia cell transcriptional networks under external stimuli2016

    • 著者名/発表者名
      坂田 他
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 6 号: 1 ページ: 35946-35946

    • DOI

      10.1038/srep35946

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Nuclear Proteomics Reveals the Role of Protein Synthesis and Chromatin Structure in Root Tip of Soybean during the Initial Stage of Flooding Stress2016

    • 著者名/発表者名
      Yin Xiaojian、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      J. Proteome Res.

      巻: 15 号: 7 ページ: 2283-2298

    • DOI

      10.1021/acs.jproteome.6b00330

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Gel-Free/Label-Free Proteomic Analysis of Endoplasmic Reticulum Proteins in Soybean Root Tips under Flooding and Drought Stresses2016

    • 著者名/発表者名
      Wang Xin、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      J. Proteome Res.

      巻: 15 号: 7 ページ: 2211-2227

    • DOI

      10.1021/acs.jproteome.6b00190

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Quantitative Proteomics Reveals the Flooding-Tolerance Mechanism in Mutant and Abscisic Acid-Treated Soybean2016

    • 著者名/発表者名
      Yin Xiaojian、Nishimura Minoru、Hajika Makita、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      J. Proteome Res.

      巻: 15 号: 6 ページ: 2008-2025

    • DOI

      10.1021/acs.jproteome.6b00196

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Proteins involved in biophoton emission and flooding-stress responses in soybean under light and dark conditions2016

    • 著者名/発表者名
      Kamal AH, Komatsu S.
    • 雑誌名

      Mol. Biol. Rep.

      巻: 43 号: 2 ページ: 73-89

    • DOI

      10.1007/s11033-015-3940-4

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Jasmonic acid induced protein response to biophoton emissions and flooding stress in soybean2016

    • 著者名/発表者名
      Kamal AH, Komatsu S
    • 雑誌名

      Journal of Proteomics

      巻: 133 ページ: 33-47

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2015.12.004

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Impact of Post-Translational Modifications of Crop Proteins under Abiotic Stress2016

    • 著者名/発表者名
      Hashiguchi Akiko、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      Proteomes

      巻: 4 号: 4 ページ: 42-42

    • DOI

      10.3390/proteomes4040042

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Plant nuclear proteomics for unraveling physiological function2016

    • 著者名/発表者名
      Yin Xiaojian、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      N Biotechnol

      巻: 33 号: 5 ページ: 644-654

    • DOI

      10.1016/j.nbt.2016.03.001

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Plant subcellular proteomics: Application for exploring optimal cell function in soybean2016

    • 著者名/発表者名
      Wang Xin、Komatsu Setsuko
    • 雑誌名

      J Proteomics

      巻: 143 ページ: 45-56

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2016.01.011

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Gel-free/label-free proteomic analysis of root tip of soybean over time under flooding and drought stresses.2016

    • 著者名/発表者名
      Wang X, Oh M, Sakata K, Komatsu S.
    • 雑誌名

      J Proteomics

      巻: 130 ページ: 42-55

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2015.09.007

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Proteomic analysis of flooded soybean root2015

    • 著者名/発表者名
      Mustafa G, Sakata K, Komatsu S.
    • 雑誌名

      J Proteomics

      巻: 128 ページ: 280-297

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2015.08.010

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Soybean Proteomics to Reveal the Flooding-Tolerant Mechanism2018

    • 著者名/発表者名
      Setsuko Komatsu, Katsumi Sakata
    • 学会等名
      植物動物ゲノム会議XXNI, サンデイゴ(米国)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Characterization of Stress Responsive Mechanisms in Soybean under Abiotic Stresses using Quantitative Proteomic Approach2017

    • 著者名/発表者名
      Setsuko Komatsu
    • 学会等名
      国際プロテオミクス2017年大会, クアラルンプール(マレーシア)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Proteomic technique to identify the abiotic stress tolerant mechanism in crop2016

    • 著者名/発表者名
      Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      The Korean Human Proteome Organization, 16th Annual International Proteomics Conference
    • 発表場所
      Daejeon, Korea
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Omics technique to enhance flooding tolerance of soybean2016

    • 著者名/発表者名
      Setsuko Komatsu
    • 学会等名
      The 6th National Plant Protein Research Conference, Haikou (China)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Nuclear phosphoproteomics to identify the abiotic stress tolerant mechanism in crop2016

    • 著者名/発表者名
      Setsuko Komatsu
    • 学会等名
      8th Anuual Meeting of Proteomics Society India & 3rd AOAPO Conference, New Delhi (India)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Gel-free/label-free phosphoproteomics reveals response mechanism in soybean under flooding stress2016

    • 著者名/発表者名
      Setsuko Komatsu
    • 学会等名
      Maritime Silk Road, Hangzou (China)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Quantitative proteomics reveals initial-response mechanism in soybean under flooding stress2016

    • 著者名/発表者名
      Setsuko Komatsu
    • 学会等名
      2nd INPPO World Congress, Bratislava (Slovakia)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Proteomics to identify the abiotic stress tolerant mechanism in crop2016

    • 著者名/発表者名
      Setsuko Komatsu
    • 学会等名
      The 8th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Congress, Sun Moon Lake (Taiwan)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Quantitative proteomic analysis of flooding and its recovery in soybean exposed to aluminum oxide nanoparticles2016

    • 著者名/発表者名
      Setsuko Komatsu
    • 学会等名
      15th Human Proteome Organization World Congress, Taipei (Taiwan)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 湿害耐性に対するダイズ品種系統間の比較プロテオミクス解析2016

    • 著者名/発表者名
      小松節子、南條洋平、西村実
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2016年大会, 北里大学 (東京)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Temporal analysis of flooded soybean root exposed to silver nanoparticles using proteomic technique.2015

    • 著者名/発表者名
      Ghazala MUSTAFA, Katsumi SAKATA, Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド、神戸
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Organ specific analysis of post-flooding recovery in soybean using proteomic and enzymatic technique.2015

    • 著者名/発表者名
      Mudassar Nawaz KHAN, Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド、神戸
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Nuclear proteomics of soybean root tip during initial stages of flooding stress.2015

    • 著者名/発表者名
      Xiaojian YIN, Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド、神戸
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Endoplasmic reticulum proteomics of soybean root tip under flooding and drought stresses.2015

    • 著者名/発表者名
      Xin WANG, Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド、神戸
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Proteomic and morphological analyses of post-flooding recovery in soybean root exposed to aluminum oxide nanoparticles.2015

    • 著者名/発表者名
      Farhat YASMEEN, Naveed Iqbal RAJA, Ghazala MUSTAFA, Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド、神戸
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Proteomic techniques and management of flooding tolerance in soybean.2015

    • 著者名/発表者名
      Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      7th International Symposium on Frontiers in Agricultural Proteome Research
    • 発表場所
      Chungcheongbuk, Korea
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Functional analysis of post-flooding recovery in soybean using proteomic technique.2015

    • 著者名/発表者名
      Mudassar Nawaz KHAN, Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      7th International Symposium on Frontiers in Agricultural Proteome Research
    • 発表場所
      Chungcheongbuk, Korea
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Proteomic Analysis of flooded soybean root exposed to aluminum oxide nanoparticles.2015

    • 著者名/発表者名
      Ghazala MUSTAFA, Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      7th International Symposium on Frontiers in Agricultural Proteome Research
    • 発表場所
      Chungcheongbuk, Korea
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Characterization of stress-response mechanism in soybean roots under flooding and drought stresses using proteomic technique.2015

    • 著者名/発表者名
      MyeongWon OH, Xin WANG, Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      7th International Symposium on Frontiers in Agricultural Proteome Research
    • 発表場所
      Chungcheongbuk, Korea
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Temporal organ-specific analysis of soybean under flooding and drought stresses using quantitative proteomic technique.2015

    • 著者名/発表者名
      Xin WANG, Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2015年会
    • 発表場所
      森都心プラザ, 熊本
    • 年月日
      2015-07-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative proteomics of nuclear phosphoproteins in the root tip of soybean during the initial stages of flooding stress.2015

    • 著者名/発表者名
      Xiaojian YIN, Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2015年会
    • 発表場所
      森都心プラザ, 熊本
    • 年月日
      2015-07-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Proteomic technique for identifying flooding-tolerant mechanism in soybean.2015

    • 著者名/発表者名
      Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      Plant Abiotic Stress Tolerant III
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2015-06-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Characterization of flooding tolerance mechanisms in soybean using proteomic techniques.2015

    • 著者名/発表者名
      Setsuko KOMATSU
    • 学会等名
      Plant Biotechnology: Green For Good III
    • 発表場所
      Olomouc, Czech Republic
    • 年月日
      2015-06-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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