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糖鎖を標的分子とした抗菌薬リードの創製

研究課題

研究課題/領域番号 15H04496
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物有機化学
研究機関名古屋大学

研究代表者

中川 優  名古屋大学, 生命農学研究科, 准教授 (90452284)

研究分担者 竹腰 清乃理  京都大学, 理学研究科, 教授 (10206964)
相田 美砂子  広島大学, 理学研究科, 教授 (90175159)
連携研究者 小鹿 一  名古屋大学, 大学院生命農学研究科, 教授 (50152492)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2017年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2016年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2015年度: 7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円)
キーワード抗生物質 / 糖鎖 / pradimicin / 分子認識 / 有機化学 / 生理活性
研究成果の概要

本研究では,X線結晶構造解析および固体NMR解析により,Pradimicin A (PRM-A) のマンノース (Man) 認識機構を解明するとともに,合成オリゴマンノースを用いた結合試験により,PRM-Aが真菌マンナンの非還元末端Man残基が密集している箇所に選択的に結合することを見出した.さらにこれらの知見に基づいて誘導体設計を行い,凝集性を抑えたPRM-Amideおよび真菌マンナンを蛍光染色するPRM-Azideを開発した.

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (27件) (うち招待講演 3件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Quinocidin, a cytotoxic antibiotic with an unusual 3,4-dihydroquinolizinium ring and Michael acceptor reactivity toward thiols2017

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa, Y.; Sawaki, Y.; Kimura, T.; Tomura, T.; Igarashi, Y.; Ojika, M
    • 雑誌名

      Chem. Eur. J.

      巻: 23 号: 71 ページ: 17894-17897

    • DOI

      10.1002/chem.201704729

    • NAID

      120006473510

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Solid-State Nuclear Magnetic Resonance Analysis Reveals a Possible Calcium Binding Site of Pradimicin A2017

    • 著者名/発表者名
      Doi, T., Nakagawa, Y., Takegoshi, K.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 56 号: 3 ページ: 468-472

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.6b01300

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Pradimicin A, a D-mannose-binding antibiotic, binds pyranosides of L-fucose and L-galactose in a calcium-sensitive manner2015

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa, Y., Watanabe, Y., Igarashi, Y., Ito, Y. and Ojika, M.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      巻: 25 号: 15 ページ: 2963-2966

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2015.05.021

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] プラディミシンと高マンノース型糖鎖のオリゴ糖モチーフとの結合解析2018

    • 著者名/発表者名
      渡邉泰典,中川 優,山地史哉,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Quinocidinのアナログ合成と細胞毒性評価2018

    • 著者名/発表者名
      澤木裕紀,中川 優,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンAとマンノトリオースとの結合様式の解析2017

    • 著者名/発表者名
      渡邉泰典,中川 優,山地史哉,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2017年度大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 糖鎖を蛍光染色するプラディミシン誘導体の開発2017

    • 著者名/発表者名
      都築麗江,中川 優,戸村友彦,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2017年度大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 真菌マンナンのオリゴ糖モチーフに対するプラディミシンの結合活性2017

    • 著者名/発表者名
      山地史哉,中川 優,渡邉泰典,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2017年度大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] マンノース結合性天然物の糖認識機構解析:糖鎖研究への利用を目指して2017

    • 著者名/発表者名
      中川 優
    • 学会等名
      理研シンポジウム
    • 発表場所
      埼玉
    • 年月日
      2017-01-20
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 天然物研究における微生物の利用法2017

    • 著者名/発表者名
      中川 優
    • 学会等名
      第5回糸状菌分子生物学若手の会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 3,4-Dihydroquinolizinium環を有する新規天然物の単離,合成および生物活性評価2017

    • 著者名/発表者名
      澤木裕紀,中川 優,木村高啓,戸村友彦,小鹿 一
    • 学会等名
      第111回有機合成シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 天然低分子化合物を利用した真菌マンナンの蛍光染色2017

    • 著者名/発表者名
      中川 優,都築麗江,戸村友彦,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      第36回日本糖質学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンは真菌マンナンの分岐型マンノオリゴ糖部分に選択的に結合する2017

    • 著者名/発表者名
      山地史哉,中川 優,渡邉泰典,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      第36回日本糖質学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンと高マンノース型糖鎖の分岐型オリゴ糖モチーフとの結合解析2017

    • 著者名/発表者名
      渡邉泰典,中川 優,山地史哉,伊藤幸成,五十嵐康弘,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会中部支部第180回例会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンと真菌マンナンの分岐型オリゴ糖モチーフとの結合解析2017

    • 著者名/発表者名
      山地史哉,中川 優,渡邉泰典,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会中部支部第180回例会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Quinocidinの母核化合物に対する求核剤の付加反応解析2017

    • 著者名/発表者名
      澤木裕紀,中川 優,戸村友彦,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会中部支部第180回例会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 抗生物質プラディミシンを用いた真菌マンナンの蛍光染色2017

    • 著者名/発表者名
      都築麗江,中川 優,戸村友彦,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      第35回メディシナルケミストリーシンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] チオール捕捉能を有する細胞毒性物質Quinocidinの単離と合成2017

    • 著者名/発表者名
      澤木裕紀,中川 優,木村高啓,戸村友彦,小鹿 一
    • 学会等名
      第35回メディシナルケミストリーシンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンAと分岐型マンノトリオースとの結合解析2016

    • 著者名/発表者名
      渡邉泰典,中川 優,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会中部支部第177回例会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2016-09-24
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンAを利用した糖鎖の蛍光染色2016

    • 著者名/発表者名
      都築麗江,中川 優,戸村友彦,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会中部支部第177回例会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2016-09-24
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンと真菌マンナンのオリゴ糖モチーフとの結合解析2016

    • 著者名/発表者名
      山地史哉,中川 優,渡邉泰典,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会中部支部第177回例会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2016-09-24
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 固体NMRによるプラディミシンとマンノトリオースとの相互作用解析2016

    • 著者名/発表者名
      渡邉泰典,中川 優,伊藤幸成,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,小鹿 一
    • 学会等名
      第35回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      高知
    • 年月日
      2016-09-01
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 糖鎖生物学用ツール分子の開発に向けたプラディミシンAのCa2+ 結合部位の同定2016

    • 著者名/発表者名
      都築麗江,中川 優,戸村友彦,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      第35回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      高知
    • 年月日
      2016-09-01
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンと真菌の細胞壁マンナンとの結合解析2016

    • 著者名/発表者名
      山地史哉,中川 優,渡邉泰典,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      第35回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      高知
    • 年月日
      2016-09-01
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンAとの結合におけるマンノースの環内酸素原子の寄与2016

    • 著者名/発表者名
      渡邉泰典,中川 優,都築麗江,菅原貴弘,相田美砂子,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンAはアントラキノン部分でカルシウムと結合する2016

    • 著者名/発表者名
      都築麗江,中川 優,戸村友彦,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンとCandida属真菌の細胞壁マンナンとの結合解析2016

    • 著者名/発表者名
      山地史哉,中川 優,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] プラディミシンはいかに糖を認識しているか?2015

    • 著者名/発表者名
      中川 優
    • 学会等名
      第3回天然物化学研究会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2015-11-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] プラディミシンAはマンノースの環内酸素原子を認識する2015

    • 著者名/発表者名
      渡邉泰典,中川 優,五十嵐康弘,伊藤幸成,小鹿 一
    • 学会等名
      2015年度日本農芸化学会中部・関西支部合同大会
    • 発表場所
      富山
    • 年月日
      2015-09-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] マンノース結合性抗生物質プラディミシン Aの糖結合解析2015

    • 著者名/発表者名
      渡邉泰典,中川 優,伊藤幸成,五十嵐康弘,小鹿 一
    • 学会等名
      第34回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2015-07-31
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] NMR in Glycoscience and Glycotechnology2017

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa, Y. Ito, Y.
    • 総ページ数
      458
    • 出版者
      Royal Society of Chemistry
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

URL: 

公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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