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魚類における新規性決定遺伝子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 15H04542
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 水圏生産科学
研究機関東京大学

研究代表者

菊池 潔  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (20292790)

研究分担者 小山 喬  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特別研究員 (40749701)
連携研究者 田角 聡志  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任助教 (90359646)
細谷 将  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 助教 (60526466)
坂本 崇  東京海洋大学, 海洋科学技術研究科, 准教授 (40313390)
研究協力者 水野 直樹  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 技術専門職員
城 夕香  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 技術専門職員
藤田 真志  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 技術職員
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
17,030千円 (直接経費: 13,100千円、間接経費: 3,930千円)
2017年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2016年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2015年度: 8,970千円 (直接経費: 6,900千円、間接経費: 2,070千円)
キーワード性決定 / 生殖 / 遺伝 / 遺伝的多様性 / 多様性
研究成果の概要

性決定遺伝子は性統御や性判別に役立つことから、生物生産において典型的な有用遺伝子として活用されている。しかし魚類の性決定遺伝子は、しばしば種間で保存されておらず、ほとんどの魚種で性決定遺伝子は不明のままである。本研究では、多くの魚類に適用可能な「性決定遺伝子を迅速に同定するストラテジー」の確立を目指した。その結果、次世代シーケンサーを活用した連鎖および低解像度連鎖不平衡マッピング法を用いれば、新規性決定遺伝子候補をこれまでより容易に短時間で決定できることが明らかとなった。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (41件)

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (33件) (うち国際学会 8件、 招待講演 6件) 図書 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Identification of the sex-determining locus in grass puffer (Takifugu niphobles) provides evidence for sex-chromosome turnover in a subset of Takifugu species2018

    • 著者名/発表者名
      Risa Ieda, Sho Hosoya, Shota Tajima, Kazufumi Atsumi, Takashi Kamiya, Aoi Nozawa, Yuma Aoki, Satoshi Tasumi, Takashi Koyama, Osamu Nakamura, Yuzuru Suzuki, Kiyoshi Kikuchi
    • 雑誌名

      PLOSONE

      巻: 13 号: 1 ページ: e0190635-e0190635

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0190635

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Mucosal IgM Antibody with D-Mannose Affinity in Fugu Takifugu rubripes Is Utilized by a Monogenean Parasite Heterobothrium okamotoi for Host Recognition2017

    • 著者名/発表者名
      Igarashi K, Matsunaga R, Hirakawa S, Hosoya S, Suetake H, Kikuchi K, Suzuki Y, Nakamura O, Miyadai T, Tasumi S, Tsutsui S.
    • 雑誌名

      Journal of Immunology

      巻: in press 号: 10 ページ: 4107-4114

    • DOI

      10.4049/jimmunol.1601996

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The teleost parasite Heterobothrium okamotoi utilizes a mucous antibody from the host as a target molecule for host recognition2017

    • 著者名/発表者名
      Igarashi K, Matsunaga R, Hirakawa S, Hosoya S, Suetake H, Kikuchi K, Suzuki Y, Nakamura O, Miyadai T, Tasumi S, Tsutsui S
    • 雑誌名

      Journal of Immunology

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two isoforms of aquaporin 2 responsive to hypertonic stress in bottlenose dolphin.2016

    • 著者名/発表者名
      Suzuki M, Wakui H, Itou T, Segawa T, Inoshima Y, Maeda K, Kikuchi K.
    • 雑誌名

      J Exp Biol.

      巻: - ページ: 1249-1258

    • DOI

      10.1242/jeb.132811

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Identification and characterization of pufflectin from the grass pufferfish Takifugu niphobles and comparison of its expression with that of Takifugu rubripes2016

    • 著者名/発表者名
      Tasumi S, Yamaguchi A, Matsunaga R, Fukushi K, Suzuki Y, Nakamura O, Kikuchi K, Tsutsui S
    • 雑誌名

      Developmental and Comparative Immunology

      巻: 59 ページ: 48-56

    • DOI

      10.1016/j.dci.2016.01.007

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Accumulation of cells expressing macrophage colony-stimulating factor receptor gene in the ovary of a pregnant viviparous fish, Neoditrema ransonnetii (Perciformes, Embiotocidae)2016

    • 著者名/発表者名
      Ueda K, Saito E, Iwasaki K, Tsutsui S, Nozawa A, Kikuchi K, Nakamura O
    • 雑誌名

      Fish and Shellfish Immunology

      巻: 50 ページ: 223-230

    • DOI

      10.1016/j.fsi.2016.01.028

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 水産科学におけるゲノム情報の活用を考える2018

    • 著者名/発表者名
      菊池潔
    • 学会等名
      第34回マリントキシン研究会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] トラフグ属魚類種間雑種の初回成熟期に関する研究2018

    • 著者名/発表者名
      木元亮太・細谷将・佐藤茉奈・水野直樹・菊池潔
    • 学会等名
      平成30年度日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ブリ属の性決定遺伝子はステロイド代謝酵素である2018

    • 著者名/発表者名
      小山喬・森島輝・山下量平・豊田敦・内野翼・坂本崇・鈴木萌・細谷将・菊池潔
    • 学会等名
      平成30年度日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ブリ属性決定遺伝子の機能解析2018

    • 著者名/発表者名
      小山喬・山下雄史・佐々木皓平・宇野誠一・小山次朗・田角聡志・菊池潔
    • 学会等名
      平成30年度日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ブリ属性決定遺伝子の発現解析2018

    • 著者名/発表者名
      中本正俊・小山喬・水野直樹・菊池潔・坂本崇
    • 学会等名
      平成30年度日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 新規トラフグゲノム参照配列の作成と近縁魚種への利用2018

    • 著者名/発表者名
      大木駿・家田梨櫻・細谷将・菊池潔
    • 学会等名
      平成30年度日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] クサフグ性決定遺伝子の探索 - 少数個体を用いたGWASの発見的利用-2018

    • 著者名/発表者名
      家田梨櫻・小山喬・細谷将・大木駿・水野直樹・藤田真志・菊池潔
    • 学会等名
      平成30年度日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] GRAS-Di 法で明らかとなった「ゲノム再編成による新規性決定遺伝子座の誕生」2018

    • 著者名/発表者名
      藤川大学・細谷 将・小林純也・田島祥太・家田梨櫻・佐藤茉菜・城夕香・中村修・菊池潔
    • 学会等名
      平成30年度日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ショウサイフグ性決定遺伝子の探索 -Pool-seq による表現型原因遺伝子の特定-2018

    • 著者名/発表者名
      家田梨櫻・細谷将・小山喬・城夕香・菊池潔
    • 学会等名
      平成30年度日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ゼブラフィッシュを用いたブリ属性決定遺伝子の機能解析2018

    • 著者名/発表者名
      車遥介・小山喬・岡田恵治・家田梨櫻・ 朝比奈潔・菊池潔
    • 学会等名
      平成30年度日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] アンプリコシーケス法による高速ジェノタイピング技術の確立2017

    • 著者名/発表者名
      佐藤茉菜・細谷将・吉川壮太・菊池潔
    • 学会等名
      平成29年度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京海洋大学(東京・品川)
    • 年月日
      2017-03-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ターゲットキャプチャー法によるブリW染色体塩基配列決定の試み2017

    • 著者名/発表者名
      小山喬・森島輝・鈴木穣・内野翼・坂本崇・菊池潔
    • 学会等名
      平成29年度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京海洋大学(東京・品川)
    • 年月日
      2017-03-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 性決定遺伝子をNGSで簡単に決められないだろうか?2017

    • 著者名/発表者名
      菊池潔
    • 学会等名
      DMY研究会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] The reuse of the same sex chromosome in pufferfishes.2017

    • 著者名/発表者名
      Kiyoshi Kikuchi
    • 学会等名
      Asian Sex Differentiation Network (7th Gonad Biology Joint Meeting, 2017)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Footprints of selection around the sex determining gene in fugu2017

    • 著者名/発表者名
      Kabir Ahammad, Risa Ieda, Shotaro Hirase, Takashi Koyama, Satoshi Tasumi, Sho Hosoya, Kiyoshi Kikuchi
    • 学会等名
      International symposium, Fisheries Science for Future Generations
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ターゲットエンリッチメント法と長鎖シーケンサーによる領域特異的塩基配列決定の試み2017

    • 著者名/発表者名
      小山喬・森島輝・鈴木穣・内野翼・坂本崇・菊池潔
    • 学会等名
      次世代シーケンサー現場の会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 水産学会賞受賞者講演 ゲノムワイド解析によるフグ性決定遺伝子の同定2017

    • 著者名/発表者名
      菊池潔
    • 学会等名
      平成29年度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京海洋大学(東京・品川)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 世界の水産養殖産業大躍進とその基盤技術2017

    • 著者名/発表者名
      菊池潔
    • 学会等名
      日本農学会 公開シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学(東京・文京)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Incipient transition of a sex determining gene in pufferfish closely-related to fugu2016

    • 著者名/発表者名
      Ieda R, Hosoya S, Tasumi S, Kobayashi H, Suzuki S, Kikuchi K
    • 学会等名
      The 22nd International congress of zoology
    • 発表場所
      OIST(Okinawa・Onna)
    • 年月日
      2016-11-14
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Genetic basis of the parallel evolution of scale loss among closely-related species of fugu2016

    • 著者名/発表者名
      Kim D, Hosoya S, Kai W, Nozawa A, Jo Y, Suzuki Y, Tasumi S, Kikuchi K
    • 学会等名
      The 7th World Fisheries Congress
    • 発表場所
      Korea・Busan
    • 年月日
      2016-05-23
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ブリ性決定遺伝子座の高精度塩基配列決定2016

    • 著者名/発表者名
      小山喬、菊池潔、内野翼、坂本崇
    • 学会等名
      平成28年度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京・品川
    • 年月日
      2016-03-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ショウサイフグが獲得した新しい性決定遺伝子座の解析2016

    • 著者名/発表者名
      家田梨櫻、青木勇磨、中村修、城夕香、小山喬、細谷将、田角聡志、菊池潔
    • 学会等名
      平成28年度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京・品川
    • 年月日
      2016-03-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム情報は本当に水産に役立つのか? - 14 年間の定点観測から-2016

    • 著者名/発表者名
      菊池潔
    • 学会等名
      第6回太平洋中海域トラフグ研究会
    • 発表場所
      愛知県庁舎(愛知・名古屋)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 浜名湖を中心とした日本近海のフグにおける性決定遺伝子の進化2016

    • 著者名/発表者名
      家田梨櫻・カビールアハマド・小山喬・藤田真志・平瀬翔太朗・細谷将・田角聡志・菊池潔
    • 学会等名
      浜名湖をめぐる研究者の会
    • 発表場所
      東京大学水産実験所(静岡・浜松)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] NGSを用いたフグ類の性決定遺伝子の探索2016

    • 著者名/発表者名
      家田梨櫻・細谷将・小山喬・田角聡志・鈴木重則・小林久人・菊池潔
    • 学会等名
      生物資源ゲノム解析拠点シンポジウム
    • 発表場所
      東京農業大学(東京・世田谷)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Turnover of sex chromosomes in pufferfishes2016

    • 著者名/発表者名
      Kikuchi K
    • 学会等名
      The workshop on sex chromosomes in frogs and fish
    • 発表場所
      Hiroshima University(Hiroshima・Hiroshima)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Incipient transition of a sex-determining gene among closely related species of fugu2015

    • 著者名/発表者名
      Risa Ieda, Sho Hosoya, Satoshi Tasumi, Shigenori Suzuki, Kiyoshi Kikuchi
    • 学会等名
      43rd Scientific Symposium of the United State-Japan Natural Resource Aquaculture Panel
    • 発表場所
      Nagasaki・Nagasaki
    • 年月日
      2015-11-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Whole genome re-sequencing of fugu populations2015

    • 著者名/発表者名
      Sho Hosoya. Satoshi Tasumi, Kiyoshi Kikuchi
    • 学会等名
      43rd Scientific Symposium of the United State-Japan Natural Resource Aquaculture Panel
    • 発表場所
      Nagasaki・Nagasaki
    • 年月日
      2015-11-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 全ゲノムリシーケンスによるトラフグ集団の解析-日本海群と太平洋群の比較-2015

    • 著者名/発表者名
      細谷将、田角聡志、菊池潔
    • 学会等名
      動物遺伝育種学会第16回神戸大会
    • 発表場所
      兵庫・神戸
    • 年月日
      2015-11-07
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 全ゲノムリシーケンスによるトラフグの集団間比較 -日本海 vs. 太平洋-2015

    • 著者名/発表者名
      細谷将、田角聡志、菊池潔
    • 学会等名
      平成27年度日本水産学会秋季大会
    • 発表場所
      宮城・仙台
    • 年月日
      2015-09-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 性染色体進化初期段階の実験モデルとしてのブリ類の有用性2015

    • 著者名/発表者名
      小山喬、吉田一範、尾崎照遵、青木純哉、荒木和男、細谷将、菊池潔、坂本崇
    • 学会等名
      日本進化学会第17回大会
    • 発表場所
      東京・文京
    • 年月日
      2015-08-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] INCIPIENT TRANSITION OF A SEX DETERMINING GENE IN Takifugu PUFFERFISH2015

    • 著者名/発表者名
      Risa Iedaa, Sho Hosoyaa, Satoshi Tasumia, Shigenori Suzukib, Kiyoshi Kikuchi
    • 学会等名
      The International Symposium on Aquaculture Genetics XII
    • 発表場所
      Spain, Santiago de Compostela
    • 年月日
      2015-07-22
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ブリ性染色体では局所的な連鎖不平衡が観察される+魚類コア遺伝子の網羅的同定の試み2015

    • 著者名/発表者名
      小山喬、吉田一範、尾崎照遵、青木純哉、細谷将、荒木和男、菊池潔、坂本崇
    • 学会等名
      NGS現場の会第四回研究会
    • 発表場所
      茨城・つくば
    • 年月日
      2015-07-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] 水産遺伝育種学(担当 第11章水産育種におけるゲノム情報の利用)2017

    • 著者名/発表者名
      菊池潔(編集 中嶋正道, 荒井克俊, 岡本信明, 谷口順彦)
    • 総ページ数
      243
    • 出版者
      東北大学出版会
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [産業財産権] 220797012018

    • 発明者名
      坂本崇・中本正俊・菊池潔・小山喬
    • 権利者名
      坂本崇・中本正俊・菊池潔・小山喬
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2018-027260
    • 出願年月日
      2018
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-12-27  

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