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サツマイモ窒素固定共生系の分子生態学的解明

研究課題

研究課題/領域番号 15H04620
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 環境農学(含ランドスケープ科学)
研究機関国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構

研究代表者

池田 成志  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 北海道農業研究センター 大規模畑作研究領域, 上級研究員 (20396609)

研究分担者 小林 有紀  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター 畑作研究領域, 上級研究員 (00729519)
小林 晃  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター 畑作研究領域, 上級研究員 (90626954)
関山 恭代  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 食品研究部門 食品分析研究領域, 上級研究員 (60342804)
菊地 淳  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー (00321753)
鶴丸 博人  鹿児島大学, 農水産獣医学域農学系, 助教 (60545226)
塔野岡 純子  佐賀大学, 農学部, 特定研究員 (00713314)
連携研究者 平藤 雅之  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任教授 (00370495)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
16,120千円 (直接経費: 12,400千円、間接経費: 3,720千円)
2017年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2016年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2015年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
キーワード窒素固定 / サツマイモ / 共生細菌 / 多様性 / 16S rRNA遺伝子 / Alphaproteobacteria / メタノール培地 / Rhizobiales / Rhodopseudomonas / 微生物生態 / 共生 / NMR / メタボローム解析 / 微生物 / 細菌 / 応用微生物 / 環境 / 生態学 / 微生物多様性
研究成果の概要

サツマイモの茎、塊根の表面と内部の共生細菌群集について非培養法による多様性解析を行った結果、各組織に共通して他の作物種よりもアルファプロテオバクテリアの優占化が観察された。また、多様性指数は塊根表面、茎、塊根内部、の順番で小さくなることが明らかにされた。上記と対応する組織から共生細菌の網羅的な分離培養を実施した。約2000株の分離菌について16S rRNA遺伝子に基づくクラスタリング解析を行った結果、約320個のグループが得られた。これらのグループの代表的な菌株について培養法により空中窒素固定活性を測定した結果、塊根に共生するダイズ根粒菌に類似した1菌株について活性を検知した。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (2件) (うち招待講演 2件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] NMRによる実践的な農業メタボロミクス研究に向けて2017

    • 著者名/発表者名
      関山恭代、池田成志、冨田理
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 55 号: 6 ページ: 392-399

    • DOI

      10.1271/kagakutoseibutsu.55.392

    • NAID

      130006742954

    • ISSN
      0453-073X, 1883-6852
    • 年月日
      2017-05-20
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 植物共生科学から考える土壌病害の発生しにくい土づくり2017

    • 著者名/発表者名
      池田成志
    • 雑誌名

      土づくりとエコ農業

      巻: 49 ページ: 33-39

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Rice bran amendment suppresses potato common scab by increasing the populations of antagonistic bacteria in rhizosphere2016

    • 著者名/発表者名
      Tsuyoshi Tomihama, Yatsuka Nishi, Kiyofumi Mori, Toshiya Iida, Shihomi Uzuhashi, Moriya Ohkuma, and Seishi Ikeda
    • 雑誌名

      Phytopathology

      巻: In press 号: 7 ページ: 719-728

    • DOI

      10.1094/phyto-12-15-0322-r

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 土壌微生物が創る共生の世界―その先端的研究事例と農業への応用的研究展開5.作物共生微生物の生態研究の現状と農業・食品産業への応用の可能性2016

    • 著者名/発表者名
      池田成志
    • 雑誌名

      日本土壌肥料学雑誌

      巻: 87 ページ: 373-382

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 植物共生細菌群集を利用した持続的農業2016

    • 著者名/発表者名
      大久保卓、池田成志、南澤究
    • 雑誌名

      土と微生物

      巻: 70 ページ: 10-16

    • NAID

      130005170826

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Community analysis of root- and tuber-associated bacteria in field-grown potato plants harboring different resistance levels against common scab2015

    • 著者名/発表者名
      A. Kobayashi, Y. O. Kobayashi, N. Someya, and S. Ikeda
    • 雑誌名

      Microbes and Environments

      巻: 30 ページ: 301-309

    • NAID

      130005116039

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 農業・食品分野における微生物科学とメタボロミクスの連携の可能性について2017

    • 著者名/発表者名
      池田成志、関山恭代
    • 学会等名
      第11回メタボロームシンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 共生微生物学の視点から考える理想の土づくりと農業・食品産業の新展開2016

    • 著者名/発表者名
      池田成志
    • 学会等名
      北海道d上肥料懇話会・日本土壌肥料学会北海道支部会 共催
    • 発表場所
      とかちプラザ(北海道・帯広市)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] メタゲノム解析実験プロトコール(植物共生細菌群集のメタゲノム解析)2016

    • 著者名/発表者名
      池田成志、大久保卓、鶴丸博人、南澤究(分担執筆、監修:服部正平)
    • 総ページ数
      229
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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