次世代ゲノム時代の染色体構造異常新規分類へ向けた基盤整備

• 研究課題/領域番号: 15H04710
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 人類遺伝学
• 研究機関: 藤田保健衛生大学
• 研究代表者: 倉橋 浩樹 藤田保健衛生大学, 総合医科学研究所, 教授 (30243215)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 17,290千円 (直接経費: 13,300千円、間接経費: 3,990千円); 2017年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2016年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円); 2015年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
• キーワード: 染色体 / ゲノム / 構造異常 / 挿入 / 端部欠失・逆位重複 / クロモスリプシス / 複雑構造異常 / 複製の停止 / 鋳型乗り換え / 遺伝子 / 遺伝学 / マイクロアレイ / 端部欠失 / 逆位重複 / FoSTeS / MMBIR

研究成果の概要

染色体の複雑構造異常の発生メカニズムはまだよくわかっていない。本研究ではG分染法で見かけ上、三カ所の切断点を持つ染色体構造異常の切断点の解析を行った。を解析した。マイクロアレイ染色体検査を行い、次世代シーケンサーによる全ゲノムシーケンスをメイトペアで行うことにより、切断点及びジャンクションの配列情報を得た。染色体挿入の切断点近傍のコピー数は複雑に入り組んでおり、クロモスリプシスと呼ばれる染色体破砕現象が生じていることが予想された。遅滞染色体に起因する微小核の中の染色体が、次のDNA複製サイクルの進行度が核ゲノムと遅れが生じることで、DNA鎖が切断されていることが推測された。

研究成果

• [国際共同研究] Newcastle University(英国)
• [国際共同研究] Cornell University(米国)
• [国際共同研究] Newcastle University(英国)
• [国際共同研究] Cornell University(米国)
• [雑誌論文] Multiplex PCR in noninvasive prenatal diagnosis for FGFR3-related disorders (2018)
  • 著者名/発表者名: Terasawa Sumire、Kato Asuka、Nishizawa Haruki、Kato Takema、Yoshizawa Hikari、Noda Yoshiteru、Miyazaki Jun、Ito Mayuko、Sekiya Takao、Fujii Takuma、Kurahashi Hiroki
  • 雑誌名: Congenital Anomalies 巻: - 号: 1 ページ: 1-7
  • DOI: 10.1111/cga.12278
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] PCS/MVA syndrome caused by an Alu insertion in the BUB1B gene (2017)
  • 著者名/発表者名: Kato Maki、Kato Takema、Hosoba Eriko、Ohashi Masanao、Fujisaki Midori、Ozaki Mamoru、Yamaguchi Masatoshi、Sameshima Hiroshi、Kurahashi Hiroki
  • 雑誌名: Human Genome Variation 巻: 4 号: 1 ページ: 17021-17021
  • DOI: 10.1038/hgv.2017.21
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Novel missense mutation in DLL4 in a Japanese sporadic case of Adams-Oliver syndrome (2017)
  • 著者名/発表者名: Nagasaka M, Taniguchi-Ikeda M, Inagaki H, Ouchi Y, Kurokawa D, Yamana K, Harada R, Nozu K, Sakai Y, Mishra SK, Yamaguchi Y, Morikoka I, Toda T, Kurahashi H, Iijima K
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 62 号: 9 ページ: 869-869
  • DOI: 10.1038/jhg.2017.59
  • 査読あり
• [雑誌論文] A case with concurrent duplication, triplication, and uniparental isodisomy at 1q42.12-qter supporting microhomology-mediated break-induced replication model for replicative rearrangements (2017)
  • 著者名/発表者名: Kohmoto T, Okamoto N, Naruto T, Murata C, Ouchi Y, Fujita N, Inagaki H, Satomura S, Okamoto N, Saito M, Masuda K, Kurahashi H, Imoto I
  • 雑誌名: Mol Cytogenet 巻: 10 号: 1 ページ: 15-15
  • DOI: 10.1186/s13039-017-0316-6
  • NAID: 120006937633
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Intragenic DOK7 deletion detected by whole-genome sequencing in congenital myasthenic syndromes. (2017)
  • 著者名/発表者名: Azuma Y, Topf A, Evangelista T, Lorenzoni PJ, Roos A, Viana P, Inagaki H, Kurahashi H, Lochmuller H
  • 雑誌名: Neurol Genet 巻: 3 号: 3
  • DOI: 10.1212/nxg.0000000000000152
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Analysis of the origin of inherited chromosomally integrated human herpesvirus 6 in the Japanese population. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kawamura Y, Ohye T, Miura H, Ihira M, Kato Y, Kurahashi H, Yoshikawa T.
  • 雑誌名: J Gen Virol. 巻: 98(7) 号: 7 ページ: 1823-1830
  • DOI: 10.1099/jgv.0.000834
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The DNA Damage Checkpoint Eliminates Mouse Oocytes with Chromosome Synapsis Failure (2017)
  • 著者名/発表者名: Vera Rinaldi, Ewelina Bolcun-Filas, Hiroshi Kogo, Hiroki Kurahashi, John C.Schimenti
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 67 号: 6 ページ: 1026-1036.e2
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2017.07.027
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Remote intracranial recurrence of <i>IDH</i> mutant gliomas is associated with <i>TP53</i> mutations and an 8q gain (2017)
  • 著者名/発表者名: Nakae Shunsuke、Kato Takema、Murayama Kazuhiro、Sasaki Hikaru、Abe Masato、Kumon Masanobu、Kumai Tadashi、Yamashiro Kei、Inamasu Joji、Hasegawa Mitsuhiro、Kurahashi Hiroki、Hirose Yuichi
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 8 号: 49 ページ: 84729-84742
  • DOI: 10.18632/oncotarget.20951
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genomic Characterization of Chromosomal Insertions: Insights into the Mechanisms Underlying Chromothripsis (2017)
  • 著者名/発表者名: Kato Takema、Ouchi Yuya、Inagaki Hidehito、Makita Yoshio、Mizuno Seiji、Kajita Mitsuharu、Ikeda Toshiro、Takeuchi Kazuhiro、Kurahashi Hiroki
  • 雑誌名: Cytogenetic and Genome Research 巻: 153 号: 1 ページ: 1-9
  • DOI: 10.1159/000481586
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] PCS/MVA syndrome caused by an Alu insertion in the BUB1B gene. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kato M, Kato T, Hosoba E, Ohashi M, Fujisaki M, Ozaki M, Yamaguchi M, Sameshima H, *Kurahashi H.
  • 雑誌名: Hum Genome Var 巻: 印刷中
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Family With Craniofrontonasal Syndrome: The First Report of Familial Cases of Craniofrontonasal Syndrome With Bilateral Cleft Lip and Palate. (2017)
  • 著者名/発表者名: Inoue Y, Sakamoto Y, Sugimoto M, Inagaki H, Boda H, Miyata M, Kato H, Kurahashi H, *Okumoto T.
  • 雑誌名: Cleft Palate Craniofac J 巻: 印刷中 号: 7 ページ: 15347-15347
  • DOI: 10.1597/15-347
  • 査読あり
• [雑誌論文] Palindrome-mediated translocations in humans: a new mechanistic model for gross chromosomal rearrangements. (2016)
  • 著者名/発表者名: Inagaki H, Kato T, Tsutsumi M, Ouchi Y, Ohye T, *Kurahashi H.
  • 雑誌名: Front Genet 巻: 7 ページ: 125-125
  • DOI: 10.3389/fgene.2016.00125
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Novel compound heterozygous variants in PLK4 identified in a patient with autosomal recessive microcephaly and chorioretinopathy. (2016)
  • 著者名/発表者名: Tsutsumi M, Yokoi S, Miya F, Miyata M, Kato M, Okamoto N, Tsunoda T, Yamasaki M, Kanemura Y, Kosaki K, Saitoh S, *Kurahashi H.
  • 雑誌名: Eur J Hum Genet 巻: 24 号: 12 ページ: 1702-1706
  • DOI: 10.1038/ejhg.2016.119
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A PDE3A mutation in familial hypertension and brachydactyly syndrome (2016)
  • 著者名/発表者名: Boda H, Uchida H, Takaiso N, Ouchi Y, Fujita N, Kuno A, Hata T, et al.
  • 雑誌名: J Hum Gene 巻: Apr 7 号: 8 ページ: 1-6
  • DOI: 10.1038/jhg.2016.32
  • NAID: 40020923782
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Next-generation sequencing discloses a nonsense mutation in the dystrophin gene from long preserved dried umbilical cord and low-level somatic mosaicism in the proband mother. (2016)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi-Ikeda M, Takeshima Y, Lee T, Nishiyama M, Awano H, Yagi M, Unzaki A, Nozu K, Nishio H, Matsuo M, Kurahashi H, Toda T, Morioka I, Iijima K.
  • 雑誌名: J Hum Genet. 巻: 61 号: 4 ページ: 351-355
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.157
  • NAID: 40020802923
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Annexin A5 haplotype M2 is not a risk factor for recurrent miscarriages in Northern Europe, is there sufficient evidence? (2016)
  • 著者名/発表者名: *Markoff A, Kurahashi H, Grandone E, Bogdanova N.
  • 雑誌名: Reprod Biomed Online 巻: 32 号: 5 ページ: 469-73
  • DOI: 10.1016/j.rbmo.2016.02.004
  • 査読あり
• [雑誌論文] Authors' response to the letter of Nagirnaja et al., "Response to annexin A5 haplotype M2 is not a risk factor for recurrent miscarriages in Northern Europe, is there sufficient evidence?" (2016)
  • 著者名/発表者名: Markoff A, Kurahashi H, Grandone E, Bogdanova N.
  • 雑誌名: Reprod Biomed Online 巻: 33 号: 1 ページ: 116-7
  • DOI: 10.1016/j.rbmo.2016.05.006
  • 査読あり
• [雑誌論文] A simple cytogenetic method to detect chromosomally integrated human herpesvirus-6. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ohye T, et al.
  • 雑誌名: J Virol Methods 巻: 228 ページ: 74-78
  • DOI: 10.1016/j.jviromet.2015.11.001
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Complex X-Chromosomal Rearrangements in Two Women with Ovarian Dysfunction: Implications of Chromothripsis/Chromoanasynthesis-Dependent and -Independent Origins of Complex Genomic Alterations. (2016)
  • 著者名/発表者名: Suzuki E, Shima H, Toki M, Hanew K, Matsubara K, Kurahashi H, Narumi S, Ogata T, Kamimaki T, *Fukami M.
  • 雑誌名: Cytogenet Genome Res 巻: 150 号: 2 ページ: 86-92
  • DOI: 10.1159/000455026
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Increased levels of soluble corin in pre-eclampsia and fetal growth restriction. (2016)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki J, *Nishizawa H, Kambayashi A, Ito M, Noda Y, Terasawa S, Kato T, Miyamura H, Shiogama K, Sekiya T, Kurahashi H, Fujii T.
  • 雑誌名: Placenta 巻: 48 ページ: 20-25
  • DOI: 10.1016/j.placenta.2016.10.002
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Successful living donor liver transplantation for classical maple syrup urine disease. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yasui T, Suzuki T, Hara F, Watanabe S, Uga N, Naoe A, Yoshikawa T, Ito T, Nakajima Y, Miura H, Sugioka A, Kato Y, Tokoro T, Tanahashi Y, Kasahara M, Fukuda A, Kurahashi H. Successful living donor liver transplantation for classical maple syrup urine disease.
  • 雑誌名: Pediatr Transplant 巻: 20 号: 5 ページ: 707-710
  • DOI: 10.1111/petr.12738
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutation analysis of the JUNO gene in female infertility of unknown etiology. (2016)
  • 著者名/発表者名: Takaiso N, Nishizawa H, Nishiyama S, Sawada T, Hosoba E, Ohye T, Sato T, Inagaki H, *Kurahashi H.
  • 雑誌名: Fujita Med J 巻: 2 ページ: 59-61
  • NAID: 130005264393
  • 査読あり
• [学会発表] Recent advance in our understanding of the molecular nature of chromosomal abnormalities (2017)
  • 著者名/発表者名: 倉橋浩樹
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第62回大会
  • 招待講演
• [学会発表] Screening for Genetic Disease within the Asian Context (2017)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Kurahashi
  • 学会等名: ASPIRE 3rd Masterclass
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 次世代型PGD/PGSの現状と問題点 (2017)
  • 著者名/発表者名: 倉橋浩樹
  • 学会等名: 第62回日本生殖医学会学術講演会
  • 招待講演
• [学会発表] 造血器腫瘍のクリニカルシーケンスにおける遺伝診療体制の構築 (2017)
  • 著者名/発表者名: 倉橋浩樹
  • 学会等名: 第５９回日本小児血液・がん学会学術集会
  • 招待講演
• [学会発表] 網羅的手法による次世代型PGD ～PGDの実際とこれから (2017)
  • 著者名/発表者名: 倉橋浩樹
  • 学会等名: JISARTシンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] 着床前診断の現状と今後の展望 (2017)
  • 著者名/発表者名: 倉橋浩樹
  • 学会等名: 第19回日本イアンドナルド超音波講座
  • 招待講演
• [学会発表] 造血器腫瘍のクリニカルシーケンスにおける遺伝診療体制の構築 (2017)
  • 著者名/発表者名: 倉橋浩樹
  • 学会等名: 第59回日本小児血液・がん学会学術集会
  • 招待講演
• [学会発表] 網羅的手法による次世代型PGD ~PGDの実際とこれから (2017)
  • 著者名/発表者名: 倉橋浩樹
  • 学会等名: JISARTシンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] Gene expression analysis reveals molecular phenotypes related to schizophrenia in Neurogranin knockout mice. (2016)
  • 著者名/発表者名: Hattori S, Hagihara H, Kameyama T, Ouchi Y, Inagaki H, Kurahashi H, Huang FL, Huang KP, Miyakawa T.
  • 学会等名: Neuroscience 2016
  • 発表場所: San Diego, USA
  • 年月日: 2016-11-12
  • 国際学会
• [学会発表] Missense mutations in the PLK4 gene identified in a patient with autosomal recessive microcephaly and chorioretinopathy. (2016)
  • 著者名/発表者名: Tsutsumi M, Yokoi S, Miya F, Miyata M, Kato M, Okamoto N, Tsunoda T, Yamasaki M, Kanemura Y, Kosaki K, Saitoh S, Kurahashi H.
  • 学会等名: ASHG2016
  • 発表場所: Vancouver, Canada
  • 年月日: 2016-10-18
  • 国際学会
• [学会発表] Mechanistic analysis and prediction of interchromosomal insertional translocation. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kato T, Ouchi Y, Inagaki H, Makita Y, Mizuno S, Kurahashi H.
  • 学会等名: ASHG2016
  • 発表場所: Vancouver, Canada
  • 年月日: 2016-10-18
  • 国際学会
• [学会発表] 13q22.2q34 tetrasomy mosaicism due to an inverted duplication with a neocentromere. (2016)
  • 著者名/発表者名: Hattori T, Togawa T, Togawa Y, Kawabe H, Kato T, Kurahashi H, Saitoh S, Kouwaki M, Koyama N.
  • 学会等名: ASHG2016
  • 発表場所: Vancouver, Canada
  • 年月日: 2016-10-18
  • 国際学会
• [学会発表] Relationship between various clinical features in a genotyped population investigated for tuberous sclerosis complex. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ishihara N, Sasaki H, Kato T, Inagaki H, Tsutsumi M, Shiroki R, Kurahashi H.
  • 学会等名: ASHG2016
  • 発表場所: Vancouver, Canada
  • 年月日: 2016-10-18
  • 国際学会
• [学会発表] De novo translocation frequency of the recurrent constitutional t(11;22)(q23;q11.2) in normal somatic tissues. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kurahashi H, Kato T, Suzuki M, Tsutsumi M, Ohye T, Inagaki H.
  • 学会等名: ESHG2016
  • 発表場所: Barcelona, Spain
  • 年月日: 2016-05-21
  • 国際学会
• [学会発表] Palindrome-mediated recurrent translocations in humans. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kurahashi H.
  • 学会等名: ICHG2016
  • 発表場所: Kyoto, Japan、京都国際会館
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Mechanisms of interchromosomal insertional translocation. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kato T, Ouchi Y, Inagaki H, Makita Y, Mizuno S, Kurahashi H.
  • 学会等名: ICHG2016
  • 発表場所: Kyoto, Japan、京都国際会館
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際学会
• [学会発表] A PDE3A mutation in familial hypertension and brachydactyly syndrome. (2016)
  • 著者名/発表者名: Inagaki H, Boda H, Uchida H, Takaiso N, Ouchi Y, Fujita N, Kuno A, Hata T, Nagatani A, Funamoto Y, Miyata M, Yoshikawa T, Kurahashi H.
  • 学会等名: ICHG2016
  • 発表場所: Kyoto, Japan、京都国際会館
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際学会
• [学会発表] Spermatogenic failure by impaired meiotic sex chromosome inactivation in a mouse with reciprocal translocation. (2016)
  • 著者名/発表者名: Tsutsumi M, Kato T, Inagaki H, Ohye T, Kurahashi H.
  • 学会等名: ICHG2016
  • 発表場所: Kyoto, Japan、京都国際会館
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際学会
• [学会発表] Cell culture model for X-linked disorder: craniofrontonasal dysplasia and severe phenotype in female. (2016)
  • 著者名/発表者名: Sugimoto M, Inagaki H, Tsutsumi M, Inoue Y, Taguchi Y, Boda H, Miyata M, Okumoto T, Yoshikawa T, Kurahashi H.
  • 学会等名: ICHG2016
  • 発表場所: Kyoto, Japan、京都国際会館
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際学会
• [学会発表] A child presenting distinct phenotype in severe alternating hemiplegia with a novel ATP1A3 mutation. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ishihara N, Inagaki H, Miyake M, Ouchi Y, Ohye T, Tsutsumi M, Yoshikawa T, Kurahashi H.
  • 学会等名: ICHG2016
  • 発表場所: Kyoto, Japan、京都国際会館
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際学会
• [学会発表] Sex determination of the fetus by noninvasive prenatal testing (NIPT) with maternal blood. (2016)
  • 著者名/発表者名: Noda Y, Nishizawa H, Kato T, Kambayashi A, Terasawa S, Miyazaki J, Ito M, Kurahashi H, Fujii T.
  • 学会等名: ICHG2016
  • 発表場所: Kyoto, Japan、京都国際会館
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際学会
• [学会発表] Increased levels of soluble corin in patients with pre-eclampsia and fetal growth restriction. (2016)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki J, Nishizawa H, Kambayashi A, Ito M, Noda Y, Terasawa S, Kato T, Miyamura H, Sekiya T, Kurahashi H, Fujii T.
  • 学会等名: ICHG2016
  • 発表場所: Kyoto, Japan、京都国際会館
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際学会
• [学会発表] Advantage of next generation sequencing in molecular diagnosis in DMD -mutation screening with long preserved dried umbilical cord and detection of mosaicism-. (2016)
  • 著者名/発表者名: Unzaki A, Taniguchi-Ikeda M, Takeshima Y, Lee T, Awano H, Yagi M, Kurahashi H, Morioka I, Toda T, Matsuo M, Iijima K.
  • 学会等名: ICHG2016
  • 発表場所: Kyoto, Japan、京都国際会館
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際学会
• [学会発表] Prenatal diagnosis of the Premature chromosome separation/ mosaic variegated aneuploidy (PCS/MVA) syndrome in fetus with microcephalus. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ohashi M, Yamaguchi M, Ishii M, Yamaguchi T, Akeno K, Fijisaki M, Sumiyoshi C, Sameshima H, Ozaki M, Kato T, Inagaki H, Kurahashi H.
  • 学会等名: ICHG2016
  • 発表場所: Kyoto, Japan、京都国際会館
  • 年月日: 2016-04-03
  • 国際学会
• [学会発表] Mechanism for Structural Variation. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kurahashi H.
  • 学会等名: APAC RGH Symposium Singapore
  • 発表場所: Singapore
  • 国際学会 / 招待講演
• [備考] 藤田保健衛生大学・総合医科学研究所・分子遺伝学研究部門
  • URL: http://molgen.icms.fujita-hu.ac.jp
• [備考] ようこそ分子遺伝学研究室へ
  • URL: http://molgen.icms.fujita-hu.ac.jp