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嫌気環境に生育する真核微生物の多様性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15H05231
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分海外学術
研究分野 生物多様性・分類
研究機関筑波大学

研究代表者

橋本 哲男  筑波大学, 生命環境系, 教授 (50208451)

研究分担者 石田 健一郎  筑波大学, 生命環境系, 教授 (30282198)
稲垣 祐司  筑波大学, 計算科学研究センター, 教授 (50387958)
連携研究者 半澤 直人  山形大学, 理学部, 教授 (40292411)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
16,900千円 (直接経費: 13,000千円、間接経費: 3,900千円)
2017年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2016年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円)
2015年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円)
キーワード嫌気環境 / 真核微生物 / ミトコンドリア関連オルガネラ / 縮退進化 / 代謝多様性
研究成果の概要

真核微生物の中には、嫌気・微好気環境への適応の結果、酸素呼吸能をもつ典型的なミトコンドリアを2次的に失い、縮退型のミトコンドリア(Mitochondrion Related Organelles, MROs)を保持するに至った生物が存在し、それらは真核生物の系統樹上に散在している。しかし、その多様性の実態については未解明な点が多い。本研究では、国内外の嫌気・微好気水圏環境のサンプルから嫌気的培養によって単離したさまざまな培養株に関して、その微細構造や系統的位置の解析を行うとともに、トランスクリプトームデータに基づくMRO機能の推定などを行い、そのような生物の多様性の一端を明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて 2018 2017 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 3件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 7件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (17件) (うち国際学会 7件、 招待講演 1件)

  • [国際共同研究] Dalhousie University(Canada)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] Universiti Teknologi Malaysia(Malaysia)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Fates of Evolutionarily Distinct, Plastid- type Glyceraldehyde 3-phosphate Dehydrogenase Genes in Kareniacean Dinoflagellates2018

    • 著者名/発表者名
      Kamikawa, R., Yazaki, E., Tahara, M., Sakura, T., Matsuo, E., Nagamune, K., Hashimoto, T., Inagaki, Y.
    • 雑誌名

      J. Eukaryot. Microbiol.

      巻: 印刷中 号: 5 ページ: 669-678

    • DOI

      10.1111/jeu.12512

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The draft genome of Kipferlia bialata reveals reductive genome evolution in fornicate parasites2018

    • 著者名/発表者名
      Tanifuji G, Takabayashi S, Kume K, Takagi M, Nakayama T, Kamikawa R, Inagaki Y, Hashimoto T
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 13 号: 3 ページ: e0194487-e0194487

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0194487

    • NAID

      120007134280

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Organelles that illuminate the origins of Trichomonas hydrogenosomes and Giardia mitosomes2017

    • 著者名/発表者名
      Leger M, Kolisko M, Ryoma Kamikawa, Stairs CW, Kume K, Cepicka I, Silberman JD, Andersson JO, Xu F, Yabuki A, Zhang Q, Takishita K, Inagaki Y, Simpson AGB, Hashimoto T, Roger AJ
    • 雑誌名

      Nature Ecology and Evolution

      巻: 1 号: 4 ページ: 0092-0092

    • DOI

      10.1038/s41559-017-0092

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A Non-photosynthetic Diatom Reveals Early Steps of Reductive Evolution in Plastids2017

    • 著者名/発表者名
      Kamikawa R, Moog D, Zauner S, Tanifuji G, Ishida K, Miyashita H, Mayama S, Hashimoto T, Maier UG, Archibald JM, Inagaki Y
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: 34 号: 9 ページ: 2355-2366

    • DOI

      10.1093/molbev/msx172

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Microbial Eukaryotes that Lack Sterols2017

    • 著者名/発表者名
      Takishita K, Chikaraishi Y, Tanifuji G, Ohkouchi N, Hashimoto T, Fujikura K, Roger AJ
    • 雑誌名

      Journal of Eukaryotic Microbiology

      巻: 64 号: 6 ページ: 897-900

    • DOI

      10.1111/jeu.12426

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Global Kinetoplastea phylogeny inferred from a large-scale multigene alignment including prarasitic species for better understanding transitions from a free-living to a parasitic lifestyle2017

    • 著者名/発表者名
      Yazaki E, Ishikawa S, Kume K, Kumagai A, Kamaishi T, Tanifuji G, Hashimoto T, Inagaki Y
    • 雑誌名

      Gene & Genetic Systems

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial genome of Palpitomonas bilix: derived genome structure and ancestral system for cytochrome c maturation2016

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Y, Tanifuji G, Kamikawa R, Yabuki A, Hashimoto T, Inagaki Y
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 8 号: 10 ページ: 3090-3098

    • DOI

      10.1093/gbe/evw217

    • NAID

      120007129285

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 有中心粒太陽虫類におけるミトコンドリアゲノムの解読2018

    • 著者名/発表者名
      西村祐貴, 白鳥峻志, 石田健一郎, 橋本哲男, 稲垣 祐司, 大熊盛也
    • 学会等名
      第12回ゲノム微生物学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Giardiaに近縁な自由生活性鞭毛虫Dysnectes brevisのMRO機能の推測2017

    • 著者名/発表者名
      井上 貴史, 谷藤 吾朗, 神川 龍馬, 久米 慶太郎, 稲垣 祐司, 橋本 哲男
    • 学会等名
      第86回日本寄生虫学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] A heterolobosean strain SRT213 and its mitochondrion-related organelle2017

    • 著者名/発表者名
      Yazaki Y, Shiratori T, Kume K, Hashimoto T, Ishida K, Inagaki Y
    • 学会等名
      ICOP 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 新奇ヘテロロボサ生物SRT213における縮退的ミトコンドリア機能の推測2017

    • 著者名/発表者名
      矢崎裕規, 白鳥峻志, 久米慶太郎, 橋本哲男, 石田健一郎, 稲垣 祐司
    • 学会等名
      日本進化学会第19回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] セスジアカムカデ消化管内寄生虫の網羅的mRNAデータに基づくアピコンプレクサの初期進化に関する一考察2017

    • 著者名/発表者名
      宮田 凌佑, 松尾 恵梨子, 中山 卓郎, 谷藤 吾朗, 千頭 康彦, 八畑 謙介, 橋本 哲男, 稲垣 祐司
    • 学会等名
      日本進化学会第19回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Mitochondrial genome of a protist branched at the base of Euglenozoa2017

    • 著者名/発表者名
      Yazaki Y, Shiratori T, Kume K, Hashimoto T, Ishida K, Inagaki Y
    • 学会等名
      Mitochondrial Genomics and Evolution, an SMBE Satellite Meeting
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ユーグレノゾア基部から分岐する新奇原生生物のミトコンドリアゲノム2017

    • 著者名/発表者名
      矢崎裕規, 白鳥峻志, 久米慶太郎, 橋本哲男, 石田健一郎, 稲垣 祐司
    • 学会等名
      第50回日本原生生物学会・第1回日本共生生物学会合同大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 陸生節足動物消化管から単離されたグレガリナ様寄生虫の系統学的位置と非光合成性色素体の探索2017

    • 著者名/発表者名
      宮田 凌佑, 松尾 恵梨子, 中山 卓郎, 谷藤 吾朗, 千頭 康彦, 八畑 謙介, 橋本 哲男, 稲垣 祐司
    • 学会等名
      第50回日本原生生物学会・第1回日本共生生物学会合同大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] A phylogenomic study placed a previously undescribed eukaryote, strain SRT308, at the base of the Euglenozoa clade2016

    • 著者名/発表者名
      Yazaki E, Shiratori T, Hashimoto T, Ishida K, Inagaki Y
    • 学会等名
      ICES 2016
    • 発表場所
      Kyoto Prefectural University, Kyoto, Japan
    • 年月日
      2016-09-10
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 真核生物進化の空白を埋める!分子系統解析が解き明かすプロティストの系統関係2016

    • 著者名/発表者名
      矢崎裕規, 白鳥峻志, 久米慶太郎, 石田健一郎, 橋本哲男, 稲垣祐司
    • 学会等名
      日本進化学会第18回大会
    • 発表場所
      東京工業大学, 東京都・目黒区
    • 年月日
      2016-08-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Characterization of strain SRT308; a new heterotrophic flagellate basal to Euglenozoa2016

    • 著者名/発表者名
      Shiratori T, Yazaki E, Inagaki Y, Hashimoto T, Ishida K
    • 学会等名
      Protis-2016 Moscow Forum
    • 発表場所
      Moscow, Russia
    • 年月日
      2016-06-06
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 嫌気性生物PAP020株のミトコンドリア様オルガネラの代謝機能の推測2016

    • 著者名/発表者名
      矢崎裕規, 白鳥峻志, 久米慶太郎, 橋本哲男, 石田健一郎, 稲垣祐司
    • 学会等名
      第85回日本寄生虫学会
    • 発表場所
      宮崎市民プラザ, 宮崎県・宮崎市
    • 年月日
      2016-03-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] The draft genome of Kipferlia bialata reveals that the gain of function contributes the massive reductive evolution in Metamonada2016

    • 著者名/発表者名
      Tanifuji G, Takabayashi S, Kume k, Takagi M, Inagaki Y, Hashimoto T
    • 学会等名
      Protis-2016 Moscow Forum
    • 発表場所
      Moscow, Russia
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Prediction and comparison of the metabolism of mitochondrion-related organelles in free-living fornicate organisms2015

    • 著者名/発表者名
      Kume K, Takabayashi S, Kamikawa R, Tanifuji G, Inagaki Y, Hashimoto T
    • 学会等名
      2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells
    • 発表場所
      University of Tsukuba, Tsukuba, Ibaraki, Japan
    • 年月日
      2015-09-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Strain PAP020, a novel anaerobic microeukaryote branching at the base of Fornicata2015

    • 著者名/発表者名
      Yazaki Y, Shiratori, T, Kume K, Ishikawa SA, Ishida K, Hashimoto T, Inagaki Y
    • 学会等名
      VII ECOP-ISOP Joint Meeting 2015
    • 発表場所
      Sevilla, Spain
    • 年月日
      2015-09-05
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] トランスクリプトームデータを基盤とした大規模分子系統解析による新奇嫌気性真核微生物PAP020株の系統的位置の解明2015

    • 著者名/発表者名
      矢崎裕規, 白鳥隆志, 久米慶太郎, 橋本哲男, 石田健一郎, 稲垣祐司
    • 学会等名
      日本進化学会第17回大会
    • 発表場所
      中央大学, 東京都・文京区
    • 年月日
      2015-08-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] フォルニカータ+パラバサリア生物群内でのミトコンドリア縮退進化2015

    • 著者名/発表者名
      髙林舜, 久米慶太郎, 神川龍馬, 谷藤吾朗, 稲垣祐司, 橋本哲男
    • 学会等名
      第75回日本寄生虫学会東日本支部大会
    • 発表場所
      順天堂大学, 東京都・文京区
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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