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iQTL-seq; 品種間交雑後代における新規遺伝子単離技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 15H05611
研究種目

若手研究(A)

配分区分補助金
研究分野 遺伝育種科学
研究機関石川県立大学 (2016-2017)
公益財団法人岩手生物工学研究センター (2015)

研究代表者

高木 宏樹  石川県立大学, 生物資源環境学部, 助教 (80616467)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
24,310千円 (直接経費: 18,700千円、間接経費: 5,610千円)
2017年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
2016年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
2015年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円)
キーワード植物育種 / バイオインフォマティクス / 植物育種学 / 植物 / 育種学 / 遺伝学 / 植物遺伝学
研究成果の概要

農業上有用な遺伝子の単離は、農作物における育種を加速するうえで、重要な課題である。本研究は、次世代シーケンサーを用いて品種間の表現型の差異を決定する原因遺伝子を単離する技術「iQTL-seq; identification of the gene in QTL」の開発を試みた。iQTL-seqは、シーケンスdepthを比較し、品種間の差異を決定する遺伝子を同定する手法である。本研究では、実際に構築された iQTL-seq法のpipelineを適用して、イネ品種間交雑後代におけるイネいもち病に対する耐病性レベルの品種間差異を決定する遺伝子の同定を試みた。パイプラインは、現在公開準備中である。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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