高精度がん診断ためのマイクロRNAメチル化機構の解明

• 研究課題/領域番号: 15H05664
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 消化器内科学
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 西田 尚弘 大阪大学, 医学系研究科, 助教 (50588118)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 23,920千円 (直接経費: 18,400千円、間接経費: 5,520千円); 2017年度: 7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円); 2016年度: 7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円); 2015年度: 9,880千円 (直接経費: 7,600千円、間接経費: 2,280千円)
• キーワード: 癌 / 臨床 / 遺伝子 / 核酸

研究成果の概要

最近のRNAメチル化機構の研究からRNAはDNAやヒストン同様そのメチル化状態をダイナミックに変換させ、これが遺伝子発現の重要な調節因子として機能していることが知られるようになった。本研究ではさらに癌におけるメチル化miRNAの包括的プロファイリングによりその臨床的意義を明らかにし、メチル化を考慮することでmiRNAの癌バイオマーカーとしての精度向上を図った。その結果、マイクロRNAメチル化機構を明らかにし高精度がん診断のための基盤を構築した。

研究成果

• [雑誌論文] Enzymes of the one-carbon folate metabolism as anticancer targets predicted by survival rate analysis (2018)
  • 著者名/発表者名: Koseki Jun、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Colvin Hugh、Kawamoto Koichi、Nishida Naohiro、Sakai Daisuke、Kudo Toshihiro、Satoh Taroh、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 8 号: 1 ページ: 303-303
  • DOI: 10.1038/s41598-017-18456-x
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Computational trans-omics approach characterised methylomic and transcriptomic involvements and identified novel therapeutic targets for chemoresistance in gastrointestinal cancer stem cells (2018)
  • 著者名/発表者名: Konno Masamitsu、Matsui Hidetoshi、Koseki Jun、Asai Ayumu、Kano Yoshihiro、Kawamoto Koichi、Nishida Naohiro、Sakai Daisuke、Kudo Toshihiro、Satoh Taroh、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 8 号: 1 ページ: 899-899
  • DOI: 10.1038/s41598-018-19284-3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The one-carbon metabolism pathway highlights therapeutic targets for gastrointestinal cancer (Review) (2017)
  • 著者名/発表者名: Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Kawamoto Koichi、Nishida Naohiro、Satoh Taroh、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
  • 雑誌名: Int. J. Oncol. 巻: 50 号: 4 ページ: 1057-1063
  • DOI: 10.3892/ijo.2017.3885
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Micro-RNA-130a-3p Regulates Gemcitabine?Resistance via PPARG in Cholangiocarcinoma (2017)
  • 著者名/発表者名: Asukai Kei、Kawamoto Koichi、Eguchi Hidetoshi、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Iwagami Yoshifumi、Yamada Daisaku、Asaoka Tadafumi、Noda Takehiro、Wada Hiroshi、Gotoh Kunihito、Nishida Naohiro、Satoh Taroh、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
  • 雑誌名: Ann. Surg. Oncol. 巻: 24 号: 8 ページ: 2344-2352
  • DOI: 10.1245/s10434-017-5871-x
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Hypoxia stimulates the cytoplasmic localization of oncogenic long noncoding RNA LINC00152 in colorectal cancer (2017)
  • 著者名/発表者名: Nishizawa Yujiro、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Koseki Jun、Kawamoto Koichi、Miyoshi Norikatsu、Takahashi Hidekazu、Nishida Naohiro、Haraguchi Naotsugu、Sakai Daisuke、Kudo Toshihiro、Hata Taishi、Matsuda Chu、Mizushima Tsunekazu、Satoh Taroh、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
  • 雑誌名: Int. J. Oncol. 巻: 52 ページ: 453-460
  • DOI: 10.3892/ijo.2017.4218
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Oncogene c-Myc promotes epitranscriptome m6A reader YTHDF1 expression in colorectal cancer (2017)
  • 著者名/発表者名: Nishizawa Yujiro、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Koseki Jun、Kawamoto Koichi、Miyoshi Norikatsu、Takahashi Hidekazu、Nishida Naohiro、Haraguchi Naotsugu、Sakai Daisuke、Kudo Toshihiro、Hata Taishi、Matsuda Chu、Mizushima Tsunekazu、Satoh Taroh、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
  • 雑誌名: Oncotarget. 巻: 9 号: 7 ページ: 7476-7486
  • DOI: 10.18632/oncotarget.23554
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The importance of mitochondrial folate enzymes in human colorectal cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Miyo, M., Konno, M., Colvin, S. H., Nishida, N., Koseki, J., Kawamoto, K., Tsunekuni, K., Nishimura, J., Hata, T., Takemasa, I., Mizushima, T., Doki, Y., Mori, M., Ishii, H.
  • 雑誌名: Oncol. Rep. 巻: 37 号: 1 ページ: 417-425
  • DOI: 10.3892/or.2016.5264
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Clinical significance of histone demethylase NO66 in invasive colorectal cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Nishizawa, Y., Nishida, N., Konno, M., Kawamoto, K., Asai, A., Koseki, J., Takahashi, H., Haraguchi, N., Nishimura, J., Hata, T., Matsuda, C., Mizushima, T., Satoh, T., Doki, Y., Mori, M., Ishii, H.
  • 雑誌名: Ann. Surg. Oncol. 巻: 24 号: 3 ページ: 841-849
  • DOI: 10.1245/s10434-016-5395-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Metabolic adaptation to nutritional stress in human colorectal cancer. (2016)
  • 著者名/発表者名: Miyo, M., Konno, M., Nishida, N. Sueda, T., Noguchi, K., Matsui, H., Colvin, H., Kawamoto, K., Koseki, J., Haraguchi, N., Nishimura, J., Hata, T., Gotoh, N., Mastuda, F., Saatoh, T., Mizushima, T., Shimizu, H., Doki, Y., Mori, M., Ishii, H.
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 6 号: 1 ページ: 38415-38415
  • DOI: 10.1038/srep38415
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Oncometabolite D-2-hydroxyglurate directly induces epithelial-mesenchymal transition and is associated with distant metastasis in colorectal cancer. (2016)
  • 著者名/発表者名: Colvin, S. H., Nishida, N., Konno, M., Haraguchi, N., Takahashi, H., Nishimura, J., Hata, T., Kawamoto, K. Asai, A., Tsunekuni, K., Koseki, J., Mizushima, T., Satoh, T., Doki, Y., Mori, M., Ishii, H.
  • 雑誌名: Sci. Rep 巻: 6 号: 1 ページ: 36289-36289
  • DOI: 10.1038/srep36289
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] MicroRNA miR-374, a potential radiosensitizer for carbon ion beam radiotherapy. (2016)
  • 著者名/発表者名: Baek, SJ., Sato, K., Nishida, N., Koseki, J., Azuma, R., Kawamoto, K., Konno, M., Hayashi, K., Satoh, T., Doki, Y., Mori, M., Ishii, H., Ogawa, K.
  • 雑誌名: Oncol. Rep. 巻: 36 号: 5 ページ: 2946-2950
  • DOI: 10.3892/or.2016.5122
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Pancreaticoduodenal artery aneurysm associated with coeliac artery occlusion from an aortic intramural hematoma. (2016)
  • 著者名/発表者名: Sakatani, A., Doi, Y., Kitayama, T., Matsuda, T., Sasai, Y., Nishida, N., Sakamoto, M., Uenoyama, N., Kinoshita, K.
  • 雑誌名: World. J. Gastroenterol. 巻: 22 号: 16 ページ: 4259-4263
  • DOI: 10.3748/wjg.v22.i16.4259
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A crucial epithelial to mesenchymal transition regulator, Sox4/Ezh2 axis is closely related to the clinical outcome in pancreatic cancer patients. (2016)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa, S., Nagano, H., Konno, M., Eguchi, H., Tomokuni, A., Tomimaru, Y., Asaoka, T., Wada, H., Hama, N., Kawamoto, K., Marubashi, S., Nishida, N., Koseki, J., Mori, M., Doki, Y., Ishii, H.
  • 雑誌名: Int J Oncol. 巻: 48 号: 1 ページ: 145-152
  • DOI: 10.3892/ijo.2015.3258
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Trans-omics Mathematical Analysis Reveals Novel Functions of the Ornithine Metabolic Pathway in Cancer Stem Cells. (2016)
  • 著者名/発表者名: Koseki, J., Matsui, H., Konno, M., Nishida, N., Kawamoto, K., Kano, Y., Mori, M., Doki, Y., Ishii, H.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 6 号: 1 ページ: 20726-20726
  • DOI: 10.1038/srep20726
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mathematical analysis predicts imbalanced IDH1/2 expression associates with 2-HG-inactivating β-oxygenation pathway in colorectal cancer (2015)
  • 著者名/発表者名: Koseki, J., Colvin, H., Fukusumi, T., Nishida, N., Konno, M., Kawamoto, K., Tsunekuni, K., Matsui, H., Doki, Y., Mori, M. and Ishii, H.
  • 雑誌名: International Journal of Oncology 巻: 46 号: 3 ページ: 1181-1191
  • DOI: 10.3892/ijo.2015.2833
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pyruvate kinase M2, but not M1, allele maintains immature metabolic states of murine embryonic stem cells (2015)
  • 著者名/発表者名: Konno, M., Ishii, H., Koseki, J., Tanuma, N., Nishida, N., Kawamoto, K., Nishimura, T., Nakata, A., Matsui, H., Noguchi, K., Ozaki, M., Noguchi, Y., Shima, H., Gotoh N., Nagano, H., Doki, Y. and Mori, M.
  • 雑誌名: Regenerative Therapy 巻: 1 ページ: 63-71
  • DOI: 10.1016/j.reth.2015.01.001
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] MicroRNAs induce epigenetic reprogramming and suppress malignant phenotypes of human colon cancer cells. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ogawa, H., Wu, X., Kawamoto, K., Nishida, N., Konno, M., Koseki, J., Matsui, H., Noguchi, K., Gotoh, N., Yamamoto, T., Miyata, K., Nishiyama, N., Nagano, H., Yamamoto, H., Obika, S., Kataoka, K., Doki, Y., Mori, M., Ishii, H.
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 10 号: 5 ページ: 1-23
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0127119
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Cancer stem cells: The potential of carbon ion beam radiation and new radiosensitizers (Review). (2015)
  • 著者名/発表者名: Baek, SJ., Ishii, H., Tamari, K., Hayashi, K., Nishida, N., Konno, M., Kawamoto, K., Koseki, J., Fukusumi, T., Hasegawa, S., Ogawa, H., Hamabe, A., Miyo, M., Noguchi, K., Seo, Y., Doki, Y., Mori, M., Ogawa, K.
  • 雑誌名: Oncol Rep. 巻: 34 号: 5 ページ: 2233-2237
  • DOI: 10.3892/or.2015.4236
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Susceptibility of pancreatic cancer stem cells to reprogramming. (2015)
  • 著者名/発表者名: Noguchi, K., Eguchi, H., Konno, M., Kawamoto, K., Nishida, N., Koseki, J., Wada, H., Marubashi, S., Nagano, H., Doki, Y., Mori, M., Ishii, H.
  • 雑誌名: Cancer Sci. 巻: 106 号: 9 ページ: 1182-1187
  • DOI: 10.1111/cas.12734
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Embryonic microRNA-369 controls metabolic splicing factors and urges cellular reprograming. (2015)
  • 著者名/発表者名: Masamitsu Konno, Jun Koseki, Koichi Kawamoto, Naohiro Nishida, Hidetoshi Matsui, Dyah Laksmi Dewi, Miyuki Ozaki, Yuko Noguchi, Koshi Mimori, Noriko Gotoh, Nobuhiro Tanuma, Hiroshi Shima, Yuichiro Doki, Masaki Mori , Hideshi Ishii
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 10(7) 号: 7 ページ: 1-16
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0132789
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Epigenetic modifications on non-coding RNAs in cancer (2017)
  • 著者名/発表者名: Nishida, N., Konno, M., Koseki, Jun., Kawamoto, Koichi., Asai, Ayumu., Mizushima, T., Eguchi, H., Takiguchi, S., Satoh, T., Doki, Y., Mori1, M., Ishii, H.,
  • 学会等名: 2017 Cellular and Molecular Bioengineering Annual Conference
  • 発表場所: Hapuna Beach Prince Hotel (アメリカ）
  • 年月日: 2017-01-03
  • 国際学会
• [学会発表] ヒストンメチル化酵素 KDM5B の消化器がん進展への関わり (2017)
  • 著者名/発表者名: 西田尚弘、太田勝也、加納義浩、小関準、今野雅允、浅井歩、川本弘一、佐藤太郎、森正樹、土岐祐一郎、石井秀始
  • 学会等名: 第26回日本がん転移学会学術集会・総会
• [学会発表] 大腸がんにおけるヒストン脱メチル化酵素N066の臨床的意義の解明 (2017)
  • 著者名/発表者名: 西沢佑次郎、西田尚弘、今野雅允、川本弘一、小関準、浅井歩、西村潤一、畑康司、松田宙、佐藤太郎、水島恒和、山本浩文、土岐祐一郎、森正樹、石井秀始
  • 学会等名: 第26回日本がん転移学会学術集会・総会
• [学会発表] 長鎖ノンコーディングRNAの大腸癌におけるエピゲノム制御 (2017)
  • 著者名/発表者名: 西田 尚弘、Jana Ferdin、今野 雅允、小関 準、川本 弘一、 浅井 歩、George Calin、土岐 祐一郎、森 正樹、石井 秀始
  • 学会等名: 第76回日本癌学会学術総会
• [学会発表] 大腸癌進展におけるヒストン脱メチル化酵素NO66の重要性 (2017)
  • 著者名/発表者名: 西沢 佑次郎、西田 尚弘、今野 雅允、川本 弘一、小関 準、浅井歩、西村 潤一、畑 泰司、松田 宙、水島 恒和、土岐 祐一 郎、森 正樹、石井 秀始
  • 学会等名: 第76回日本癌学会学術総会
• [学会発表] 臨床情報が裏付けるノンコーディングRNAエピゲノム修飾の意義 (2016)
  • 著者名/発表者名: 西田尚弘、大房健、山縣彰、小関準、今野雅允、川本弘一、浅井歩、水島恒和、江口英利、瀧口修司、佐藤太郎、落谷孝広、三森功士、土岐祐一郎、森正樹、石井秀始
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川）
  • 年月日: 2016-11-30
• [学会発表] 消化器癌におけるヒストン脱メチル化酵素の標的化 (2016)
  • 著者名/発表者名: 西田 尚弘、小関 準、今野 雅允、川本 弘一、太田 勝也、土岐祐一郎、森 正樹、石井 秀始
  • 学会等名: 第75回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川）
  • 年月日: 2016-10-06
• [学会発表] ノンコーディングRNAの消化器癌進展への関わり (2015)
  • 著者名/発表者名: 西田尚弘、Ferdin Jana、今野雅允、小関準、川本弘一、Calin George、三森功士、石井秀始、森正樹
  • 学会等名: 第26回日本消化器癌発生学会総会
  • 発表場所: 米子全日空ホテル（鳥取）
  • 年月日: 2015-11-19
• [学会発表] ヒストン脱メチル化酵素KDM5B の大腸癌進展機構への関わり (2015)
  • 著者名/発表者名: 西田尚弘、太田勝也、加納義浩、小関準、今野雅允、川本弘一、溝端栄一、井上豪、土岐祐一郎、森正樹、石井秀始
  • 学会等名: 第74回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場（愛知）
  • 年月日: 2015-10-08
• [学会発表] Cell cycle regulation of KDM5B and its involvement in cancer progression. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nishida N, Koseki J, Konno M, Kawamoto K, Ohta K, Kano Y, Doki Y, Mori M, Ishii H.
  • 学会等名: Cell Symposia Multifaceted Mitochondria
  • 発表場所: Hyatt Regency McCormick Place(アメリカ）
  • 年月日: 2015-07-19
  • 国際学会
• [学会発表] KDM5B plays a central role in esophageal cancer progression. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nishida N, Kano Y, Koseki J, Konno M, Kawamoto K, Doki Y, Mori M, Ishii H.
  • 学会等名: AACR Annual Meeting 2015
  • 発表場所: PENNSYLVANIA CONVENTION CENTER（アメリカ）
  • 年月日: 2015-04-18
  • 国際学会
• [産業財産権] がんを検出、又はがんの進行期を判定する方法 (2016)
  • 発明者名: 石井秀始、西田尚弘...大房健 他8
  • 権利者名: 石井秀始、西田尚弘...大房健 他8
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2016-162203
  • 出願年月日: 2016-08-22