微生物資源を活用する視覚的検出技術の開発-未培養微生物の機能推定技術への適用-

• 研究課題/領域番号: 15H06814
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 土木環境システム
• 研究機関: 松江工業高等専門学校
• 研究代表者: 山口 剛士 松江工業高等専門学校, 環境・建設工学科, 助教 (30759832)
• 研究期間 (年度): 2015-08-28 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円); 2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: 高感度FISH法 / HCR法 / click chemistry / Click chemistry / FISH法 / 環境微生物 / 微生物 / 視覚的検出 / 原核生物

研究成果の概要

本研究では, 酵素を用いない高感度FISH法であるin situ DNA-hybridization chain reaction (HCR) 法の蛍光感度を向上させるために, click chemistryを組み合わせた新規高感度FISH法の開発を試みた. また, 16S rRNAだけでなく機能遺伝子への視覚的検出も試みた. その結果, click chemsitryに用いる銅イオンが交雑条件に影響を及ぼし, 菌体内における最適化が困難であった. しかし, 今後, click chemistryの最適化が可能になれば, 環境微生物の分野への貢献が可能になると期待される.

研究成果

• [雑誌論文] Rapid and Sensitive Identification of Marine Bacteria by an Improved in situ DNA-Hybridization Chain Reaction (quickHCR-FISH) (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsuyoshi Yamaguchi, Bernhard M. Fuchs, Rudolf Amann, Shuji Kawakami, Kengo Kubota, Masashi Hatamoto, Takashi Yamaguchi.
  • 雑誌名: Systematic Applied MIcrobiology 巻: 38 ページ: 400-405
  • 査読あり / 国際共著
• [学会発表] 新規高感度FISH法におけるhzo遺伝子を標的としたプローブの選定 (2017)
  • 著者名/発表者名: 大野裕之, 武邊勝道, 山口剛士
  • 学会等名: 第51回日本水環境学会年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2017-03-15
• [学会発表] 中海に生息するアナモックス細菌の微生物群集構造解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 橋田一輝, 山口剛士, 武邊勝道, 加藤季晋
  • 学会等名: 第51回日本水環境学会年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2017-03-15
• [学会発表] Click chemistryを利用した高感度FISH法の開発 (2017)
  • 著者名/発表者名: 木村圭祐, 川上周司, 山口隆司, 山口剛士
  • 学会等名: 第51回日本水環境学会年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2017-03-15
• [学会発表] Development of a novel sensitive FISH by using click chemistry (2017)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Oono, Keisuke Kimura, Tsuyoshi Yamaguchi and Takashi Yamaguchi
  • 学会等名: STI-Gigaku2017
  • 発表場所: 長岡
  • 年月日: 2017-01-04
  • 国際学会
• [学会発表] A new sensitive FISH: Fluorescence amplification using click chemistry for detection of microorganisms (2016)
  • 著者名/発表者名: Keisuke Kimura, Tsuyoshi Yamaguchi, Katsumichi Takebe and Takashi Yamaguchi
  • 学会等名: The 4th Gigaku conference
  • 発表場所: 長岡
  • 年月日: 2016-10-06
  • 国際学会
• [学会発表] A rapid in situ DNA-hybridization chain reaction protocol (quickHCR-FISH) for detection of marine bacteria (2016)
  • 著者名/発表者名: Tsuyoshi Yamaguchi, Bernhard M. Fuchs, Rudolf Amann, Shuji Kawakami, Kengo Kubota, Masashi Hatamoto and Takashi Yamaguchi.
  • 学会等名: 16 th International Symposium on Microbial Ecology (ISME16)
  • 発表場所: カナダ
  • 年月日: 2016-08-22
  • 国際学会
• [学会発表] 宍道湖における主要微生物の生息状況と水質との相関の考察 (2016)
  • 著者名/発表者名: 庄司和希, 山口剛士, 川上周司, 嘉藤健二, 崎幸子, 山口隆司
  • 学会等名: 第50回日本水環境学会年会
  • 発表場所: 徳島県
  • 年月日: 2016-03-16
• [学会発表] Click chemistryを用いた新規高感度FISH法の開発 (2016)
  • 著者名/発表者名: 木村圭佑, 山口剛士, 川上周司, 山口隆司
  • 学会等名: 第50回日本水環境学会年会
  • 発表場所: 徳島県
  • 年月日: 2016-03-16