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アクアポリンを模した淡水化膜の設計

研究課題

研究課題/領域番号 15J02109
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 熱工学
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

山本 詠士  慶應義塾大学, 理工学部, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2017-03-31
研究課題ステータス 採択後辞退 (2016年度)
配分額 *注記
1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
2016年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2015年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワード分子動力学シミュレーション / 淡水化 / アクアポリン
研究実績の概要

近年の人口増加,工業化,環境問題から純水の需要が増加しており,効率的かつ選択的な淡水化技術の開発が望まれている.本研究目的は,分子動力学シミュレーションによって,水分子のみを透過させる膜タンパク質であるアクアポリンの水分子透過メカニズムを分子レベルで解明し,得られた知見をもとに淡水化技術に応用できる新規の淡水化膜を設計することである.まず,アクアポリンの水分子透過メカニズムを分子レベルで解明するために,アクアポリン/細胞膜/水分子/イオンの系について10万原子以上,1マイクロ秒の分子動力学シミュレーションを行った.アクアポリンの水分子の取り込み口の機構に着目した.アクアポリンの細孔口付近の親水基や疎水基のマッピングを行い,水分子がどの部分と相互作用して影響を受けているのかを,水分子の回転緩和時間や拡散係数,滞在時間等を解析して調べた.イオン原子の周りを覆っている水和殻が,入口付近に近づいた際に,周りのアミノ酸残基との相互作用でどのように変化するのか検証した.
また、平成28年度の課題であったAQPを模した淡水化膜設計の研究の一環として,カーボンナノチューブによって細孔が空いたグラフェンシート(二重膜)と水/メタノール混合溶液系の分子動力学シミュレーションを行った.電場の効果によってカーボンナノチューブ内で水分子が螺旋構造を形成することを発見した.また,電場の効果による混合溶液からのメタノールの単離について検証した.

現在までの達成度 (段落)

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

今後の研究の推進方策

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

報告書

(1件)
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (20件) (うち国際学会 13件)

  • [国際共同研究] オックスフォード大学(英国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] アクアポリンの1/f ゆらぎと水分子透過2016

    • 著者名/発表者名
      山本詠士, 泰岡顕治
    • 雑誌名

      高分子

      巻: 65 ページ: 175-176

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Anomalous Dynamics of a Lipid Recognition Protein on a Membrane Surface2015

    • 著者名/発表者名
      Eiji Yamamoto, Antreas C. Kalli, Takuma Akimoto, Kenji Yasuoka and Mark S. P. Sansom
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 5 号: 1 ページ: 18245-18245

    • DOI

      10.1038/srep18245

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Water-methanol separation with carbon nanotubes and electric fields2015

    • 著者名/発表者名
      Winarto, Daisuke Takaiwa, Eiji Yamamoto, and Kenji Yasuoka
    • 雑誌名

      Nanoscale

      巻: 7 号: 29 ページ: 12659-12665

    • DOI

      10.1039/c5nr02182k

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structures of water molecules in carbon nanotubes under electric fields2015

    • 著者名/発表者名
      Winarto, Daisuke Takaiwa, Eiji Yamamoto, and Kenji Yasuoka
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 142 号: 12

    • DOI

      10.1063/1.4914462

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Water transport into protein inside in active rhodopsin: a molecular dynamics study2016

    • 著者名/発表者名
      Katsufumi Tomobe, Eiji Yamamoto, Kholmirzo Kholmurodov, and Kenji Yasuoka
    • 学会等名
      The first pacific rim thermal engineering conference
    • 発表場所
      Hawaii(USA)
    • 年月日
      2016-03-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Water dynamics and ion interaction at channel entrance of aquaporin 12016

    • 著者名/発表者名
      Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka
    • 学会等名
      Biophysical Society 60th Annual Meeting
    • 発表場所
      Los Angeles(USA)
    • 年月日
      2016-02-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Molecular dynamics study of ganglioside GM3/DPPC membrane by using coarse-grained model2016

    • 著者名/発表者名
      Kento Inoue, Eiji Yamamoto, Daisuke Takaiwa, Kenji Yasuoka, and Masuhiro Mikami
    • 学会等名
      Biophysical Society 60th Annual Meeting
    • 発表場所
      Los Angeles(USA)
    • 年月日
      2016-02-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Vibrations of water molecules in monosaccharide hydration shell by DFT-MD studies2016

    • 著者名/発表者名
      Katsufumi Tomobe, Takashi Iijima, Eiji Yamamoto, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka
    • 学会等名
      Biophysical Society 60th Annual Meeting
    • 発表場所
      Los Angeles(USA)
    • 年月日
      2016-02-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Investigating the interactions of peripheral membrane proteins with model membranes using high throughput molecular dynamics simulations2016

    • 著者名/発表者名
      Antreas C. Kalli, Eiji Yamamoto, Fiona B. Naughton, and Mark S. P. Sansom
    • 学会等名
      Biophysical Society 60th Annual Meeting
    • 発表場所
      Los Angeles(USA)
    • 年月日
      2016-02-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Effect of electric field on water molecules confined in carbon nanotubes2015

    • 著者名/発表者名
      Winarto, Daisuke Takaiwa, Eiji Yamamoto, and Kenji Yasuoka
    • 学会等名
      The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015)
    • 発表場所
      Hawaii(USA)
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] アクアポリンの水分子透過に関する分子シミュレーション2015

    • 著者名/発表者名
      山本詠士, 秋元琢磨, 安井正人, 泰岡顕治
    • 学会等名
      第29回分子シミュレーション討論会
    • 発表場所
      朱鷺メッセ(新潟県・新潟市)
    • 年月日
      2015-11-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 単糖水和殻中の水分子振動スペクトル解析単糖水和殻中の水分子振動スペクトル解析2015

    • 著者名/発表者名
      友部勝文,飯島崇,山本詠士,安井正人,泰岡顕治
    • 学会等名
      第29回分子シミュレーション討論会
    • 発表場所
      朱鷺メッセ(新潟県・新潟市)
    • 年月日
      2015-11-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 粗視化分子動力学シミュレーションを用いたGM3/DPPC膜の解析2015

    • 著者名/発表者名
      井上堅斗,山本詠士,高岩大輔,泰岡顕治,三上益弘
    • 学会等名
      第29回分子シミュレーション討論会
    • 発表場所
      朱鷺メッセ(新潟県・新潟市)
    • 年月日
      2015-11-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Structures of water molecules in carbon nanotubes induced with electric fields and its application for water-alcohol separation2015

    • 著者名/発表者名
      Winarto, Daisuke Takaiwa, Eiji Yamamoto, and Kenji Yasuoka
    • 学会等名
      International Conference on Mechanical and Manufacturing Engineering (ICMME)
    • 発表場所
      Yogyakarta(Indonesia)
    • 年月日
      2015-11-05
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Formation of ordered structures of water in carbon nanotubes with electric fields2015

    • 著者名/発表者名
      Winarto, Daisuke Takaiwa, Eiji Yamamoto, and Kenji Yasuoka
    • 学会等名
      International Symposium on Current Progress in Mathematics and Sciences (ISCPMS)
    • 発表場所
      Depok(Indonesia)
    • 年月日
      2015-11-03
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] アクアポリン細孔口での水分子とイオンの振る舞い2015

    • 著者名/発表者名
      山本詠士, 秋元琢磨, 安井正人, 泰岡顕治
    • 学会等名
      第36回日本熱物性シンポジウム
    • 発表場所
      東北大学(宮城県・仙台市)
    • 年月日
      2015-10-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 糖鎖周りの水分子のスペクトル解析2015

    • 著者名/発表者名
      友部勝文,飯島崇,山本詠士,安井正人,泰岡顕治
    • 学会等名
      第36回日本熱物性シンポジウム
    • 発表場所
      東北大学(宮城県・仙台市)
    • 年月日
      2015-10-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Water dynamics at channel entrance of aquaporin 12015

    • 著者名/発表者名
      山本詠士,秋元琢磨,安井正人,泰岡顕治
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学(石川県・金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Structure-property of ganglioside GM3/DPPC membranes using coarse-grained molecular dynamics simulation2015

    • 著者名/発表者名
      井上堅斗,山本詠士,高岩大輔,泰岡顕治,三上益弘
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学(石川県・金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Elucidating the interactions of peripheral membrane proteins with phosphatidylinositol phosphates via a high throughput molecular dynamics simulations approach2015

    • 著者名/発表者名
      Antreas C. Kalli, Eiji Yamamoto, Fiona Naughton, and Mark S. P. Sansom
    • 学会等名
      Signalling 2015: Cellular Functions of Phosphoinositides and Inositol Phosphates
    • 発表場所
      Cambridge(UK)
    • 年月日
      2015-09-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Pathway for water molecule exchange between protein inside and bulk on active rhodopsin2015

    • 著者名/発表者名
      Katsufumi Tomobe, Eiji Yamamoto, Kholmirzo Kholmurodov, and Kenji Yasuoka
    • 学会等名
      4th IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県・名古屋市)
    • 年月日
      2015-08-31
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Molecular dynamics simulations of GM3/DPPC membrane with coarse-grained model2015

    • 著者名/発表者名
      Kento Inoue, Eiji Yamamoto, Daisuke Takaiwa, Kenji Yasuoka, and Masuhiro Mikami
    • 学会等名
      4th IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県・名古屋市)
    • 年月日
      2015-08-31
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Water confined in carbon nanotubes under the influence of electric fields for water-alcohol separation2015

    • 著者名/発表者名
      Winarto, Daisuke Takaiwa, Eiji Yamamoto, and Kenji Yasuoka
    • 学会等名
      4th IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県・名古屋市)
    • 年月日
      2015-08-31
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Preferential Adsorption of Water-Methanol Mixture in Carbon Nanotubes with Eletric Field2015

    • 著者名/発表者名
      Winarto, Daisuke Takaiwa, Eiji Yamamoto, and Kenji Yasuoka
    • 学会等名
      5th International Symposium on Micro and Nano Technology
    • 発表場所
      Calgary(Canada)
    • 年月日
      2015-05-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2015-11-26   更新日: 2024-03-26  

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