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新規がん遺伝子であるRNAスプライシング変異の病態解明

研究課題

研究課題/領域番号 15J02911
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 内科学一般(含心身医学)
研究機関東京大学

研究代表者

塩澤 裕介  東京大学, 大学院医学系研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2016年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2015年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワード骨髄異形成症候群 / RNAスプライシング / 遺伝子発現プロファイル
研究実績の概要

1. 骨髄異形成症候群(MDS)患者検体のスプライシング異常の解析:MDS患者165例の骨髄単核細胞と、100例のCD34陽性細胞についてRNAシーケンスを行った。その結果、1)SF3B1変異例では3’スプライス部位の異常が特徴的に見られ、正常トランスクリプトの減少を来たしていること、2)その標的には、ヘム合成に関連したABCB7とTMEM14Cが、がん関連遺伝子であるNF1・DICER1・PDS5A・PMLが含まれていること、 3)SF3B1変異例ではイントロンの除去効率が高くなっていること、4)SRSF2変異例ではエクソン単位の異常が特徴的であること、が明らかになった。
2. 培養細胞を用いたSF3B1変異の機能解析:CRISPR/Cas9によるゲノム編集を用いて、HEK293T細胞にSF3B1変異を導入したところ、臨床検体で見られた3’スプライス部位の異常や、イントロンの除去効率の亢進が再現された。
3. 遺伝子発現プロファイルによるMDSの新たな分類の発見:MDS患者100例のCD34陽性細胞について、遺伝子発現によるクラスタリングを行なったところ、本疾患が2つの群に分かれることが明らかとなった。一方は赤芽球に特徴的な遺伝子発現パターンを呈していた。もう一方は骨髄前駆細胞に特徴的な遺伝子発現パターンが見られた。後者は全生存率が悪く、特に白血病化が高頻度であった。
4. RNAスプライシング変異ノックインマウスのスプライシング異常の解析:SRSF2変異のコンディショナルノックインマウスの骨髄細胞につき、RNAシーケンス解析を行った。ヒトと同様、マウスモデルでもSRSF2変異によりエクソン単位の異常が特徴的に見られた。ただ、そうした異常の標的遺伝子はヒトとは完全には一致せず、SRSF2タンパクが結合する部位の塩基配列がヒトとマウスの間で保存されていないためであると考えられた。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2017 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 3件)

  • [国際共同研究] University of Pavia/Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo(イタリア)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] Karolinska Institutet(スウェーデン)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] John Radcliffe Hospital(英国)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] パビア大学(イタリア)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] カロリンスカ研究所(スウェーデン)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Impact of genetic alterations in stem-cell transplantation for myelodysplasia and secondary acute myeloid leukemia.2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshizato T, et. al., Sanada M, et. al., Ogawa S.
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 129 号: 17 ページ: 2347-2358

    • DOI

      10.1182/blood-2016-12-754796

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Somatic PHF6 mutations in 1760 cases with various myeloid neoplasms.2016

    • 著者名/発表者名
      Mori T, Nagata Y, Makishima H, Sanada M, Shiozawa Y, Kon A, Yoshizato T, Sato-Otsubo A, Kataoka K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Ishiyama K, Miyawaki S, Mori H, Nakamaki T, Kihara R, Kiyoi H, Koeffler HP, Shih LY, Miyano S, Naoe T, Haferlach C, Kern W, Haferlach T, Ogawa S, Yoshida K.
    • 雑誌名

      Leukemia.

      巻: 30 号: 11 ページ: 2270-2273

    • DOI

      10.1038/leu.2016.212

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Combined DNA and transcriptome sequencing reveals discrete subtypes of myelodysplasia2016

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Shiozawa
    • 学会等名
      The 58th American Society of Hematology Annual Meeting
    • 発表場所
      サンディエゴ、米国
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The transcriptional and alternative splicing landscape of myelodysplastic syndromes2016

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Shiozawa
    • 学会等名
      第78回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Molecular basis of splicing factor-mutated myeloid neoplasms2016

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Shiozawa
    • 学会等名
      第75回日本癌学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Different mutant splicing factors cause distinct missplicing events and give rise to different clinical phenotypes in myelodysplastic syndromes2015

    • 著者名/発表者名
      塩澤裕介
    • 学会等名
      The 58th American Society of Hematology Annual Meeting
    • 発表場所
      オーランド、米国
    • 年月日
      2015-12-05
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 標的シーケンスの骨髄異形成症候群への臨床応用2015

    • 著者名/発表者名
      塩澤裕介
    • 学会等名
      第77回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      石川県立音楽堂(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-10-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 骨髄異形成症候群における選択的RNAスプライシングの網羅的解析2015

    • 著者名/発表者名
      塩澤裕介
    • 学会等名
      第77回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      石川県立音楽堂(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-10-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 骨髄異形成症候群における選択的RNAスプライシングの網羅的解析2015

    • 著者名/発表者名
      塩澤裕介
    • 学会等名
      第74回日本癌学会学術集会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2015-10-09
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Comprehensive Analysis of Alternative RNA Splicing in Myelodysplastic Syndromes2015

    • 著者名/発表者名
      塩澤裕介
    • 学会等名
      The 13th International Symposium on Myelodysplastic Syndromes
    • 発表場所
      ワシントン、米国
    • 年月日
      2015-04-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2015-11-26   更新日: 2024-03-26  

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