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遊離代謝物を用いた13C代謝フラックス解析法の構築と動物細胞代謝プロセスへの応用

研究課題

研究課題/領域番号 15J05988
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生物機能・バイオプロセス
研究機関大阪大学

研究代表者

岡橋 伸幸  大阪大学, 情報科学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
2016年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2015年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワード13C代謝フラックス解析 / がん細胞 / 中心炭素代謝 / p53変異 / 絶対定量 / 質量分析 / 動物培養細胞 / 代謝工学 / 還元的グルタミン代謝
研究実績の概要

近年、疾患細胞に特異的な代謝が報告されており、細胞内代謝の計測ニーズが高まっている。代謝を直接的に理解するためには、代謝フラックス(反応速度)を計測する13C代謝フラックス解析法が有効である。昨年度の研究では、遊離代謝物の13C標識割合を計測することで培養がん細胞に適用可能な代謝フラックス解析法を構築し、既知の代謝阻害剤を用いて解析法の妥当性を検証することができた。そこで本年度は、構築した手法を用いてがん抑制遺伝子p53の変異が中枢代謝経路に与える影響のフラックスレベルでの解明に取り組んだ。
まず、p53欠損マウス軟部腫瘍由来細胞株(コントロール株)にレトロウィルスベクターを用いて変異型p53を再構成した(p53mut株)。両株の比増殖速度に有意な差はみられなかった。一方、細胞内代謝物の絶対定量を行ったところ、p53mut株では細胞内ピルビン酸やクエン酸の蓄積量がコントロール株に比べて61%、52%に減少していた。このことから、変異型p53が中枢代謝経路のフラックスに影響を与えていることが示唆された。そこで、コントロール株とp53mut株を [1-13C]グルコースを含む培地で24時間培養し、13C代謝フラックス解析を行った。ガスクロマトグラフ質量分析装置で細胞内遊離代謝物の13C標識割合を計測し、フラックス分布を推定することができた。ペントースリン酸経路のフラックスには変化がなかったのに対し、p53mut株では、解糖系のフラックスがコントロール株の80%程度に減少していた。また、グルタミンの取り込みやTCAサイクル、リンゴ酸酵素のフラックスも70~80%程度に減少していた。以上の結果より、変異型p53は中枢代謝経路のうち解糖系とTCAサイクルのフラックスを負に制御していることが明らかとなった。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] Metabolic characterization of cultured mammalian cells by mass balance analysis, tracer labeling experiments and computer-aided simulations.2015

    • 著者名/発表者名
      Okahashi N, Kohno S, Kitajima S, Matsuda F, Takahashi C, Shimizu H.
    • 雑誌名

      J Biosci Bioeng.

      巻: 120 号: 6 ページ: 725-731

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2015.04.003

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 同位体非定常情報を用いた動物培養細胞の13C代謝フラックス解析2016

    • 著者名/発表者名
      岡橋 伸幸、前田 昂亮、河野 晋、松田 史生、高橋 智聡、清水 浩
    • 学会等名
      第10回メタボロームシンポジウム
    • 発表場所
      慶應義塾大学先端生命科学研究所(鶴岡市)
    • 年月日
      2016-10-19
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析法を用いた動物培養細胞のNADPHターンオーバー速度の計測2016

    • 著者名/発表者名
      岡橋 伸幸、松田 史生、河野 晋、高橋 智聡、清水 浩
    • 学会等名
      第68回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      富山国際会議場(富山市)
    • 年月日
      2016-09-28
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 同位体ターンオーバー情報を用いた中心代謝フラックス解析法の構築2016

    • 著者名/発表者名
      岡橋伸幸、前田昴亮、荒木千絵、河野晋、松田史生、高橋智聡、清水浩
    • 学会等名
      第4回がんと代謝研究会
    • 発表場所
      かごしま県民交流センター(鹿児島市)
    • 年月日
      2016-07-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ガスクロマトグラフィー-タンデム四重極型質量分析装置(GC-MS/MS)を用いた13C代謝フラックス解析の精度向上2016

    • 著者名/発表者名
      岡橋伸幸、川名修一、飯田順子、清水浩、松田史生
    • 学会等名
      化学工学会第81年会
    • 発表場所
      関西大学千里山キャンパス(吹田市)
    • 年月日
      2016-03-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] p53欠損マウス軟部腫瘍由来細胞株の13C代謝フラックス解析2015

    • 著者名/発表者名
      岡橋伸幸、河野晋、松田史生、高橋智聡、清水浩
    • 学会等名
      第3回がんと代謝研究会
    • 発表場所
      石川県立音楽堂交流ホール(金沢市)
    • 年月日
      2015-07-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 動物培養細胞中枢代謝経路の13C代謝フラックス解析法の構築2015

    • 著者名/発表者名
      岡橋伸幸、松田史生、河野晋、高橋智聡、清水浩
    • 学会等名
      第63回質量分析総合討論会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(つくば市)
    • 年月日
      2015-06-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2015-11-26   更新日: 2024-03-26  

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