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ヒストン翻訳後修飾特異的一本鎖抗体(scFv)の構築とクロマチン修飾動態の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15J06807
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 遺伝・染色体動態
研究機関早稲田大学

研究代表者

鯨井 智也  早稲田大学, 理工学術院, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
2017年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2016年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2015年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワードヒストン修飾 / scFv / クロマチン / 翻訳後修飾 / 抗体 / ヒストン翻訳後修飾 / X線結晶構造解析 / 細胞内抗体 / ヒストン
研究実績の概要

本研究では、遺伝子の発現制御機構の解明のため、細胞核内におけるヒストン修飾の動態を明らかにするためのプローブの開発研究を行う。これまでに、経時的に変化するヒストン修飾動態をライブイメージングするために、細胞内においてヒストン修飾特異的一本鎖抗体(scFv)を発現させる修飾特異的細胞内抗体プローブ(mintbody)の開発研究が進行している。しかし、細胞内においてscFvを発現させた場合に、多くのscFvが抗原に結合せず機能しないことが明らかになっている。そこで本研究では、生化学的、構造生物学的解析によりscFvが細胞内において機能するために必要な性質を明らかにすることで、さらなるmintbodyをデザインすることを目標としている。
これまでに、ヒストンH4の20番目のモノメチル化(H4K20me1)特異的scFvである15F11-scFvをモデルに、細胞におけるscFvの機能とscFvの構造的特徴の相関について解析を行ってきた。その結果、scFvのフレーム形成領域の疎水性の相互作用が重要であり、scFvの構造安定性もしくはフォールディングが重要であることが示唆されていた。そこで、さらなるmintbodyの作製のため、様々なscFvについて構造モデリングソフトェアを用いて立体構造モデルを構築し、変異体を予測した。いくつかのscFvについて構造予測を行った結果、mintbodyとして機能するscFvを取得することに成功した。今後、本知見が様々なmintbody作製のための一助となることが期待され、翻訳後修飾全般に関する研究の発展に貢献できると考えられる。

現在までの達成度 (段落)

29年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

29年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 1件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 3件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Crystal Structure and Characterization of Novel Human Histone H3 Variants, H3.6, H3.7, and H3.82017

    • 著者名/発表者名
      Taguchi H, Xie Y, Horikoshi N, Maehara K, Harada A, Nogami J, Sato K, Arimura Y, Osakabe A, Kujirai T, Iwasaki T, Semba Y, Tachibana T, Kimura H, Ohkawa Y, Kurumizaka H.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 56 号: 16 ページ: 2184-2196

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.6b01098

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Influence of polynucleosome preparation methods on sedimentation velocity analysis of chromatin.2017

    • 著者名/発表者名
      Kujirai T, Machida S, Osakabe A, Kurumizaka H.
    • 雑誌名

      J. Biochem.

      巻: 161 号: 4 ページ: 381-388

    • DOI

      10.1093/jb/mvw081

    • NAID

      40021219908

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] In vitro reconstitution and biochemical analyses of theSchizosaccharomyces pombe nucleosome.2017

    • 著者名/発表者名
      Masako Koyama, Wataru Nagakura, Hiroki Tanaka, Tomoya Kujirai, Yuji Chikashige, Tokuko Haraguchi, Yasushi Hiraoka, Hitoshi Kurumizaka.
    • 雑誌名

      Biochemical and biophysical research communications.

      巻: 482 号: 4 ページ: 896-901

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.11.130

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Identification of the amino acid residues responsible for stable nucleosome formation by histone H3.Y.2017

    • 著者名/発表者名
      Kujirai T, Horikoshi N, Xie Y, Taguchi H, Kurumizaka H.
    • 雑誌名

      Nucleus.

      巻: - 号: 3 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1080/19491034.2016.1277303

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A genetically encoded probe for live-cell imaging of H4K20 monomethylation2016

    • 著者名/発表者名
      Sato Y., Kujirai T., Arai R., Asakawa H., Ohtsuki C., Horikoshi N., Yamagata K., Ueda J., Nagase T., Haraguchi T., Hiraoka Y., Kimura A., Kurumizaka H., Kimura, H.
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol.

      巻: 428 号: 20 ページ: 3885-3902

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2016.08.010

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure and function of human histone H3.Y nucleosome.2016

    • 著者名/発表者名
      Kujirai, T., Horikoshi, N., Sato, K., Maehara, K., Machida, S., Osakabe, A., Kimura, H., Ohkawa, Y. and Kurumizaka, H.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 1 号: 13 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1093/nar/gkw202

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Solution structure of variant H2A.Z.1 nucleosome investigated by small-angle X-ray and neutron scatterings2015

    • 著者名/発表者名
      M. Sugiyama, N. Horikoshi, Y. Suzuki, H. Taguchi, T. Kujirai, R. Inoue, Y. Oba, N. Sato, A. Martel, L. Porcar, and H. Kurumizaka
    • 雑誌名

      Biochemistry and Biophysics Reports

      巻: 4 ページ: 28-32

    • DOI

      10.1016/j.bbrep.2015.08.019

    • NAID

      120005893550

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] ヒストンH3.Yヌクレオソームの構造機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也, 堀越直樹, 胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第34回染色体ワークショップ・第15回核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      木更津
    • 年月日
      2017-01-11
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Structural studies of the nucleosomes of ancient land plant Marchantia polymorpha.2017

    • 著者名/発表者名
      Tomoya Kujirai, Yuka Fujino, Akihisa Osakabe, Frederic Berger, Hitoshi Kurumizaka
    • 学会等名
      EMBO CONFERENCE, The Nucleosome: From Atoms to Genomes.
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヌクレオソーム結合因子の探索及び機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、粉間信樹、増本博司、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      生命科学系学会合同年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] クロマチン結合タンパク質DEKの機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、粉間信樹、木村宏、増本博司、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第35回染色体ワークショップ・第16回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ヒストン修飾特異的細胞内発現抗体の機能解析2016

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、佐藤優子、堀越直樹、木村宏、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2016-11-30
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子発現制御に重要なH3.Yヌクレオソームの機能解析2016

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、堀越直樹、佐藤浩一、前原一満、町田晋一、越阪部晃永、木村宏、大川恭行、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第89回日本生化学会大会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2016-09-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Structural characterization of the H3.Y nucleosome2016

    • 著者名/発表者名
      Tomoya Kujirai, Naoki Horikoshi, Koichi Sato, Kazumitsu Maehara, Shinichi Machida, Akihisa Osakabe, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Asia Conference, CHROMATIN, EPIGENETICS & TRANSCRIPTION
    • 発表場所
      Shzhou, China
    • 年月日
      2016-05-09
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 構造から見たヒストン修飾特異的一本鎖抗体(scFv)の機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也
    • 学会等名
      Robert Feulgen Prize 受賞記念ワークショップ
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2015-09-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] The distinct property of histone H3.Y nucleosome2015

    • 著者名/発表者名
      Tomoya Kujirai, Naoki Horikoshi, Koichi Sato, Kazumitsu Maehara, Akihisa Osakabe, Shinichi Machida, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka
    • 学会等名
      International Symposium on Chromatin Structure, Dynamics, and Function
    • 発表場所
      兵庫
    • 年月日
      2015-08-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヒストン修飾特異的一本鎖抗体の結合解析2015

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、堀越直樹、佐藤優子、木村宏、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      GE Life Science Day 2015
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2015-07-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ヒストンH3.Yが形成するクロマチン及びヌクレオソームの機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、堀越直樹、佐藤浩一、前原一満、越阪部晃永、町田晋一、大川恭行、木村宏、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第9回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2015-05-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [産業財産権] ヒストンH3トリメチル化リシン特異的モノクローナル抗体又はその抗原結合性断片2017

    • 発明者名
      木村宏、佐藤優子、大井彰人、胡桃坂仁志、鯨井智也、大川恭行
    • 権利者名
      木村宏、佐藤優子、大井彰人、胡桃坂仁志、鯨井智也、大川恭行
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2017-111580
    • 出願年月日
      2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2015-11-26   更新日: 2024-03-26  

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