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ゼニゴケmicroRNAの欠失変異体の作出および形態制御メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 15J08774
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 植物分子・生理科学
研究機関東京大学

研究代表者

都筑 正行  東京大学, 総合文化研究科, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2016年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2015年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードmicroRNA / ゼニゴケ / 発生
研究実績の概要

平成28年度は、前年度作出したゼニゴケmicroRNA(miRNA)変異株の解析を主に行った。CRISPR/Cas9を用いてMIRNA遺伝子座を標的として作出したmirna変異株の1つは、本来栄養成長を続ける葉状体が生殖器様に形態が変化していた。雌雄個体ともに生殖器様の形態を示したことから、このmiRNAは雌雄決定因子ではなく、栄養成長期から生殖成長期への相転換を通常時抑制していることが推測される。詳細に表現型を解析するため、変異体の走査型電子顕微鏡を用いた観察および切片観察を行なった結果、雄株の葉状体は精子を形成し、雌株の葉状体には造卵器が形成されていた。以上の結果から、このmiRNAはゼニゴケの栄養成長期から生殖成長期への相転換抑制因子であることが強く示唆された。
miRNAは相補的な配列を持つmRNAに結合することで、標的遺伝子の発現を抑制するはたらきを持つ。そこで次に、表現型の原因となる標的遺伝子を同定することにした。前年度の研究により、プログラムによって塩基配列の相補性を元に行なったmiRNAの標的遺伝子予測、およびRACE方を用いた標的mRNAの切断部位同定の結果から、標的遺伝子としてすでに予測されていた遺伝子をRT-qPCR法によって定量し、変異株においてmRNAの蓄積量が増大していることがわかった。次にmiRNAと相補度合いの高い結合配列を、アミノ酸配列が変化しないよう同義置換した遺伝子配列をクローニングし、ベクターを用いて野生型植物体に遺伝子導入した形質転換体を作出した。miRNA耐性遺伝子の形質転換植物体は、雌雄ともにmirna変異株と同様に葉状体が生殖器官様に分化する表現型を示したことから、mirna変異体の表現型は、標的遺伝子の転写後発現抑制の欠損が原因であるということが強く示唆された。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2017 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 謝辞記載あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 2件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Monash University(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Profiling New Small RNA Sequences2017

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Tsuzuki, Yuichiro Watanabe
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 1456 ページ: 177-188

    • DOI

      10.1007/978-1-4899-7708-3_14

    • ISBN
      9781489977069, 9781489977083
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Interconnections between mRNA degradation and RDR-dependent siRNA production in mRNA turnover in plants2017

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Tsuzuki, Kazuki Motomura, Naoyoshi Kumakura, Atsushi Takeda
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 130 号: 2 ページ: 211-226

    • DOI

      10.1007/s10265-017-0906-8

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Profiling and Characterization of Small RNAs in the Liverwort, Marchantia polymorpha, Belonging to the First Diverged Land Plants2016

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Tsuzuki, Ryuichi Nishihama, Kimitsune Ishizaki, Yukio Kurihara, Minami Matsui, John L. Bowman, Takayuki Kohchi, Takahiro Hamada, and Yuichiro Watanabe
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 57(2) 号: 2 ページ: 359-372

    • DOI

      10.1093/pcp/pcv182

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 陸上植物に保存された microRNA による発生制御機構2016

    • 著者名/発表者名
      都筑正行、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • 学会等名
      日本植物学会第80回大会
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター(沖縄県宜野湾市)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Profiling and characterization of microRNAs in the liverwort, Marchantia polymorpha2016

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Tsuzuki
    • 学会等名
      OddPols 2016
    • 発表場所
      University of Michigan(米国ミシガン州)
    • 年月日
      2016-06-24
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Profiling and characterization of small RNAs in the liverwort, Marchantia polymorpha2016

    • 著者名/発表者名
      都筑正行、西浜竜一、石崎公庸、栗原志夫、松井南、John L. Bowman、河内孝之、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • 学会等名
      第57回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岩手大学上田キャンパス(岩手県盛岡市)
    • 年月日
      2016-03-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] タイ類ゼニゴケにおけるmicroRNAの機能解析2016

    • 著者名/発表者名
      都筑正行、西浜竜一、石崎公庸、栗原志夫、松井南、John L. Bowman、河内孝之、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • 学会等名
      第5回植物RNAワークショップ
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス(東京都目黒区)
    • 年月日
      2016-01-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of small RNAs in a liverwort, Marchantia polymorpha2015

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Tsuzuki, Tsuyoshi Fujimoto, Ryuichi Nishihama, Kimitsune Ishizaki, Yukio Kurihara, Minami Matsui, Takayuki Kohchi, Takahiro Hamada, Yuichiro Watanabe
    • 学会等名
      EMBL Symposium “The Non-Coding Genome”
    • 発表場所
      ハイデルベルク(ドイツ)
    • 年月日
      2015-10-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおけるmicroRNAの機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      都筑正行、藤本剛史、西浜竜一、石崎公庸、栗原志夫、松井南、河内孝之、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • 学会等名
      日本植物学会第79回大会
    • 発表場所
      朱鷺メッセ(新潟県新潟市)
    • 年月日
      2015-09-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおけるmicroRNAの機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      都筑正行、藤本剛史、西浜竜一、石崎公庸、栗原志夫、松井南、河内孝之、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • 学会等名
      第4回植物RNAワークショップ
    • 発表場所
      ホテルライフォート札幌(北海道札幌市)
    • 年月日
      2015-07-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] ノンコーディングRNA2016

    • 著者名/発表者名
      都筑正行、濱田隆宏、佐藤豊
    • 総ページ数
      372
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [備考] 渡邊雄一郎研究室ホームページ 業績一覧

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/RNAwatanabe/achievements.html

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

URL: 

公開日: 2015-11-26   更新日: 2024-03-26  

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