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放線菌の生産するプレニルインドールアルカロイドの生合成研究

研究課題

研究課題/領域番号 15J10131
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生物有機化学
研究機関東京大学

研究代表者

小林 正弥  東京大学, 農学生命科学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
2017年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2016年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2015年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードアルカロイド / 生合成 / 放線菌 / テルペノイド / プレニル基転移酵素
研究実績の概要

本年度は放線菌の生産するプレニルインドール化合物カルキノスタチンAの生合成マシナリーの解明に取り組み、そのカルバゾール骨格形成の分子機構の解明を目指した。標識前駆体を用いたトレーサー実験の結果から、カルバゾールの炭素骨格はトリプトファン、ピルビン酸、2分子の酢酸に由来することが示唆されていた。この結果を考慮し、カルバゾール生合成の初期段階ではトリプトファンおよびピルビン酸の縮合、およびアシル側鎖の付加が生じ、次いでこれらの炭素鎖を骨格として閉環反応が進み、カルバゾール環構造が形成されると予想した。
そこで、炭素-炭素結合形成および環化反応に関与すると推定したケトアシルACP合成酵素CqsB1、機能未知タンパク質CqsB2、チアミン依存型酵素CqsB3に着目し、これらの組換え酵素を用いてin vitro解析を実施した。その結果、CqsB1, 2, 3の全酵素を含む反応系においてのみ、カルバゾール骨格を有する生合成中間体を確認することができた。この結果から、カルバゾール骨格の生合成における一連の増炭、閉環、酸化反応の全てをCqsB1, 2, 3が担うことが明らかとなった。特に、CqsB2は閉環反応およびオルトキノン形成を触媒するカルバゾール環合成酵素であることが判明した。
カルバゾール環形成の鍵酵素であるCqsB2の反応機構を解明するため、さらに本酵素のX線結晶構造解析を実施した。SeMet置換体結晶を用いたSAD法により構造決定を行った結果、CqsB2の初期構造が明らかとなった。今後、立体構造に基づく機能解析を進めることで、前例のないカルバゾール環形成の触媒機構を解明できると考えている。本研究により、自然界におけるアルカロイドの生合成機構の多様性の一端を示すことができたと同時に、新たな生物活性物質の創出に向けた生合成経路あるいは酵素の改良・設計への貢献が期待される。

現在までの達成度 (段落)

29年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

29年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Structure and Mechanism of the Monoterpene Cyclolavandulyl Diphosphate Synthase that Catalyzes Consecutive Condensation and Cyclization2017

    • 著者名/発表者名
      Takeo Tomita, Masaya Kobayashi, Yuma Karita, Yoko Yasuno, Tetsuro Shinada, Makoto Nishiyama, Tomohisa Kuzuyama
    • 雑誌名

      Angew. Chem. Int Ed.

      巻: 56 号: 47 ページ: 14913-14917

    • DOI

      10.1002/anie.201708474

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] プレニルインドール化合物carquinostatin Aの生合成研究2018

    • 著者名/発表者名
      小林正弥、新家一男、西山真、葛山智久
    • 学会等名
      2018年度日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] シクロラバンデュリル二リン酸合成酵素の結晶構造解析2017

    • 著者名/発表者名
      小林正弥、富田武郎、品田哲郎、西山真、葛山智久
    • 学会等名
      2017年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      京都女子大学(京都府京都市)
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Biosynthesis of Prenylated Indole Alkaloids in Streptomyces2017

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi M., Nishiyama M., Kuzuyama T.
    • 学会等名
      第2回日米天然物生合成セミナー若手の会
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都目黒区)
    • 年月日
      2017-03-04
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Structural Studies on the Biosynthesis of Cyclolavandulyl Skeleton Catalyzed by an Unprecedented Terpene Synthase2017

    • 著者名/発表者名
      Masaya Kobayashi, Takeo Tomita, Makoto Nishiyama, and Tomohisa Kuzuyama
    • 学会等名
      The 2nd A3 Foresight Symposium on “Chemical & Synthetic Biology of Natural Products”
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural Studies on the Biosynthesis of Cyclolavandulyl Skeleton Catalyzed by an Unprecedented Terpene Synthase2017

    • 著者名/発表者名
      Masaya Kobayashi, Takeo Tomita, Makoto Nishiyama, and Tomohisa Kuzuyama
    • 学会等名
      18th International Symposium on the Biology of Actinomycetes
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] プレニルインドール化合物carquinostatin Aの生合成研究2017

    • 著者名/発表者名
      小林正弥、新家一男、西山真、葛山智久
    • 学会等名
      第32回日本放線菌学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] シクロラバンデュリル2リン酸合成酵素の結晶構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      小林正弥、富田武郎、品田哲郎、西山真、葛山智久
    • 学会等名
      第26回イソプレノイド研究会
    • 発表場所
      長崎県立大学(長崎県佐世保市)
    • 年月日
      2016-09-20
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌由来新奇テルペン環化酵素の結晶構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      小林正弥、尾崎太郎、富田武郎、西山真、葛山智久
    • 学会等名
      2016年度日本放線菌学会
    • 発表場所
      東京大学(東京都文京区)
    • 年月日
      2016-09-08
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌の生産するプレニルインドールアルカロイドの生合成研究2016

    • 著者名/発表者名
      小林正弥、西山真、葛山智久
    • 学会等名
      第51回天然物化学談話会
    • 発表場所
      湯沢東映ホテル(新潟県南魚沼郡)
    • 年月日
      2016-07-06
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Biosynthesis of Prenylated Indole Alkaloids in Bacteria2016

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi M., Nishiyama M., Kuzuyama T.
    • 学会等名
      5th Seminar of Biotechnology Research Center
    • 発表場所
      東京大学(東京都文京区)
    • 年月日
      2016-04-19
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] アリル基質同士の縮合と環化反応を触媒する 新奇テルペン合成酵素の発見2015

    • 著者名/発表者名
      小林正弥, 尾﨑太郎, 趙平,富田武郎, 苅田祐馬, 保野陽子, 西村栄治, 品田哲郎, 西山真, 葛山智久
    • 学会等名
      第25回イソプレノイド研究会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2015-09-14
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2015-11-26   更新日: 2024-03-26  

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