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遺伝子多様度解析を用いたアントクメ個体群消滅危険性の予測

研究課題

研究課題/領域番号 15J11734
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 水圏生産科学
研究機関東京海洋大学

研究代表者

秋田 晋吾  東京海洋大学, 海洋科学技術研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
2017年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2016年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2015年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワード磯焼け / 藻場 / マイクロサテライト / 遺伝子多様度 / アントクメ / nad3-16s / 生物系統地理 / カジメ類の雑種
研究実績の概要

本課題では,遺伝子多様度の高い個体群が環境変異や物理的撹乱に強いことに着目し,海藻類の個体群である藻場における遺伝子多様度を解明することで,磯焼けの発生リスクが高い個体群を検出できるか調べた。平成29年度は,平成27年度に採集した個体と平成28年度に開発したマイクロサテライトマーカーを用いて,1)集団遺伝解析および2)遺伝子多様度解析を行った。
1)集団遺伝解析
平成28年度に実施した系統地理解析の結果を検証するために,11個のマイクロサテライトマーカーを用いて集団遺伝解析を行った。その結果,アントクメの遺伝集団は九州西岸と太平洋岸の2グループ,もしくは,伊豆大島,平沢,仁科,早田浦,土佐清水,串木野,長島,野母崎,新三重および原島と嫦娥崎の10グループに分かれると推定された。この結果は前年度に実施した系統地理解析を支持し,各地の個体群は遺伝的に大きく離れており,本種の分散能力は低いことが示唆された。
2)遺伝子多様度解析
各地の個体群において,検出されたアレルの数(Na: 最小の個体群に補正),ヘテロ接合度の観察値(Ho)と期待値(He),近交係数(Fis)およびアレル共有度(Psaxy)を求めた。これらの指数のうち近交係数(Fis)は,嫦娥崎,原島,新三重,野母崎,串木野,土佐清水および仁科で低く,長島,早田浦,伊豆大島および平沢で高いことが確認された。各地の生育状況から,アントクメの個体群は,拡大(嫦娥崎,原島),安定(長島,早田浦,伊豆大島および平沢)および縮小(新三重,野母崎)の3段階に分けられ,Fisと比較すると,大きな変動を示す個体群でFisが低く,Fisは個体群の現状を示す指標となり得ることが示された。

現在までの達成度 (段落)

29年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

29年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2018 2017 2016 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Development of 11 Ecklonia radicosa (Phaeophyceae, Laminariales) SSRs markers using next-generation sequencing and intra-genus amplification analysis2018

    • 著者名/発表者名
      Akita Shingo、Koiwai Keiichiro、Hanyuda Takeaki、Kato Syou、Nozaki Reiko、Uchino Tsubasa、Sakamoto Takashi、Kondo Hidehiro、Hirono Ikuo、Fujita Daisuke
    • 雑誌名

      Journal of Applied Phycology

      巻: in press 号: 3 ページ: 2111-2115

    • DOI

      10.1007/s10811-018-1406-5

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 遺伝子多様度解析を用いたアントクメ個体群の消長予測2018

    • 著者名/発表者名
      秋田晋吾・小祝敬一郎・近藤秀裕・廣野育生・坂本崇・藤田大介
    • 学会等名
      日本藻類学会第42回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Phylogeographical study revealed instability of annual kelp Ecklonia radicosa population2017

    • 著者名/発表者名
      Shingo Akita, Keiichiro Koiwai, Keigo Kobayashi, Hidehiro Kondo, Ikuo Hirono, Daisuke Fujita
    • 学会等名
      22 nd International Seaweed Symposium
    • 発表場所
      Copenhargen Denmark
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] アントクメの系統地理学的解析2017

    • 著者名/発表者名
      秋田晋吾・小祝敬一郎・羽生田岳昭・近藤秀裕・廣野育生・藤田大介
    • 学会等名
      日本藻類学会第41回大会
    • 発表場所
      高知
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 長﨑県壱岐沿岸で採集されたカジメ類の交雑体における分子同定の試み2016

    • 著者名/発表者名
      秋田晋吾・小祝敬一郎・清本節夫・吉村拓・近藤秀裕・廣野育生・藤田大介
    • 学会等名
      日本藻類学会40回大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-03-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] Researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/akita4567/

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

URL: 

公開日: 2015-11-26   更新日: 2024-03-26  

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