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巨大な運動装置複合体を持つバクテリアの作動機構の1分子計測による解明

研究課題

研究課題/領域番号 15J12274
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生物物理学
研究機関学習院大学

研究代表者

木下 佳昭  学習院大学, 自然科学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
2016年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2015年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワードバクテリア / アーキア / トルク / べん毛多型変換 / ステップ運動 / エネルギー変換効率 / 蛍光イメージング / 全反射顕微鏡 / 3次元位置検出顕微鏡 / 電子顕微鏡 / 数理モデル
研究実績の概要

今年度は色素や微小ビーズを介したイメージングにより、バクテリアとアーキアに関する以下の4つの知見を得た。

(1) 高度好塩菌の1種であるHalobacterium salinarumに200-1000 nmの蛍光ビーズを結合させ、4000 fpsの時間分解能の下回転観察可能な実験系を構築した。回転速度はビーズのX-Y方向の時間変化をフーリエ変換により見積もり、ビーズの大きさによらず20 Hz程度となった。
(2) カメムシの共生細菌の1種であるBurkholderia sp. RPE64を蛍光色素Cy3を用いてラベルした。この方法により、細胞並びにべん毛繊維のリアルタイムイメージングが光学顕微鏡下において可能となった。観察の結果、他のバクテリアで見られる通常のべん毛運動だけでなく、べん毛繊維を自身の体に巻き付けながら遊泳運動する様子が確認できた。また、べん毛を滑走運動に使う様子を世界で初めて示した。本内容は海外学術誌において現在レビュー中である。
(3) Escherichia coli K-12をビオチン・アビジン結合により蛍光ラベルした。蛍光観察により、べん毛繊維を前にして進む運動が確認できた。どの教科書にも記述されていない新しい運動様式である。遺伝子解析により、べん毛繊維 FliCのアミノ酸がアスパラギンからリジンに変換されていることを明らかにした。この変異によりべん毛繊維のらせん方向が右巻きから左巻きに変換されており、繊維を反時計方向に回転させることで特異の運動を示すことをTIRF観察により示した。
(4) Mycoplasma mobileを高濃度の界面活性剤で処理することで、1点で回転運動する様子を検出した。回転の速度はATP濃度に依存しているが、ステッピングトルクはATP濃度によらず75-90 pN nmであった。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2017 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 謝辞記載あり 1件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 3件、 招待講演 2件) 図書 (1件) 備考 (4件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

  • [国際共同研究] 延世大学(韓国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] アーキアべん毛の回転とステップ運動の検出2017

    • 著者名/発表者名
      木下 佳昭
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 57 号: 2 ページ: 101-102

    • DOI

      10.2142/biophys.57.101

    • NAID

      130005509478

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Direct observation of rotation and steps of the archaellum in the swimming halophilic archaeon Halobacterium salinarum2016

    • 著者名/発表者名
      Kinosita, Y. Uchida, N. Nakane, D. Nishizaka, T.
    • 雑誌名

      Nat Microbiol

      巻: 1 号: 11 ページ: 16148-16148

    • DOI

      10.1038/nmicrobiol.2016.148

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Three-Dimensional Superlocalization Imaging of Gliding Mycoplasma mobile by Extraordinary Light Transmission through Arrayed Nanoholes2015

    • 著者名/発表者名
      Lee, W. Kinosita, Y. Oh, Y. Mikami, N. Yang, H. Miyata, M. Nishizaka, T. Kim, D.
    • 雑誌名

      ACS Nano

      巻: 9 号: 11 ページ: 10896-908

    • DOI

      10.1021/acsnano.5b03934

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Unforeseen movement in swimming bacteria2017

    • 著者名/発表者名
      木下佳昭、宮田真人、西坂崇之
    • 学会等名
      Bacterial Flagella, Injectisomes and Type III Secretion System
    • 発表場所
      沖縄県
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Detection of rotation and steps of the archaellum in the swimming halophilic archaeon Halobacterium salinarum2017

    • 著者名/発表者名
      木下佳昭、内田就也、中根大介、西坂崇之
    • 学会等名
      日本細菌学会
    • 発表場所
      宮城県
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Real-time imaging of a helical handedness, pitch and rotation rate of archaeal flagella2016

    • 著者名/発表者名
      木下佳昭、西坂崇之
    • 学会等名
      第21回べん毛交流会
    • 発表場所
      山形県天童市
    • 年月日
      2016-03-07
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] UNITARY STEPS OF SUPERMOLECULAR MOTILITY MACHINERIES IN GLIDING BACTERIA AND SWIMMING ARCHEAEA2016

    • 著者名/発表者名
      Kinosita Y, Nakane D, Uchida N, Miyata M, Nishizaka T
    • 学会等名
      Biophysical society 60th annual meeting
    • 発表場所
      アメリカカリフォルニア州ロサンゼルス
    • 年月日
      2016-02-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Real-time imaging of a polymorphism, rotation rate and stepwise rotation of archaeal flagella (archaella)2016

    • 著者名/発表者名
      Kinosita Y, Uchida N, Nakane D, Nishizaka T
    • 学会等名
      Sensory transduction in Microorganism (Gordon conference)
    • 発表場所
      アメリカカリフォルニア州ベンチュラ
    • 年月日
      2016-01-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 滑走するバクテリアのトルクからエネルギー変換効率を見積もる2016

    • 著者名/発表者名
      木下佳昭、宮田真人、西坂崇之
    • 学会等名
      2016年生体運動合同班会議
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都
    • 年月日
      2016-01-09
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Direct observation of rotation and steps of the archaellum in the swimming halophilic archaeon Halobacterium salinarum2016

    • 著者名/発表者名
      木下佳昭、内田就也、中根大介、西坂崇之
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      茨城県
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Unitary steps of supramolecula motility machineries in gliding and swimming archaea2016

    • 著者名/発表者名
      木下佳昭、中根大介、内田就也、宮田真人、西坂崇之
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      茨城県
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of the parameter in swimming motility of halophilic archaeon, Halobacterium salinarum2015

    • 著者名/発表者名
      Kinosita Y, Uchida N, Nakane D, Nishizaka T
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2015-09-14
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 未踏の領域であるアーキアべん毛の運動機構の解明に挑戦する2015

    • 著者名/発表者名
      木下佳昭、内田就也、中根大介、西坂崇之
    • 学会等名
      第5回分子モーター討論会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス
    • 年月日
      2015-06-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] アーキアべん毛の回転計測2015

    • 著者名/発表者名
      木下佳昭、内田就也、中根大介、西坂崇之
    • 学会等名
      第12回大腸菌交流会
    • 発表場所
      滋賀おごと温泉
    • 年月日
      2015-06-05
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] 月刊Bioindustry2017

    • 著者名/発表者名
      木下佳昭、内田就也、中根大介、西坂崇之
    • 総ページ数
      9
    • 出版者
      CMC出版
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [備考] アーキアのべん毛を動かす運動モーターの仕組みに迫る!

    • URL

      http://www.natureasia.com/ja-jp/nmicrobiol/interview/10

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [備考] 学習院大学初。理学部学生の研究がネイチャー姉妹誌に掲載されました。

    • URL

      http://www.univ.gakushuin.ac.jp/news/2016/0829.html

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [備考] 世界初、死海で動く微生物モーターの仕組みを理学部学生が解明

    • URL

      http://www.yomiuri.co.jp/adv/gakushuin/special/sp057/page_01.html

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [備考] First direct visualization of archaella's rotation

    • URL

      https://www.eurekalert.org/pub_releases/2016-10/gu-fdv102616.php

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] Sensory transduction in Microorganism (Gordon conference)2016

    • 発表場所
      アメリカカリフォルニア州ベンチュラ
    • 年月日
      2016-01-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2015-11-26   更新日: 2024-03-26  

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