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シャペロンとオートファジーによるペルオキシソームの品質管理システムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 15J40032
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 植物分子・生理科学
研究機関京都大学

研究代表者

山田(後藤) 志野  京都大学, 理学研究科, 特別研究員(RPD)

研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2016年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードペルオキシソーム / オートファジー / ペキソファジー / 品質管理 / LONプロテアーゼ / シロイヌナズナ / 変異体
研究実績の概要

植物における新規のオートファジー因子を発見することを期待し、ペルオキシソームの増加を示す変異体(peup変異体:peroxisome unusual positioning)20ラインを解析対象とした。これらのラインにおいて、暗所飢餓における枯死、および液胞内プロテアーゼ阻害剤処理による液胞内小胞蓄積を認めた。よって、これらpeup変異体は、オートファジーが欠損している変異体であると考えられる。
原因遺伝子を明らかにするために、peup10, 13, 15, 17についてマッピングを行い大まかな原因遺伝子の位置を決定した。次世代シークエンサー(NGS)を用いて網羅的に変異箇所を特定し、その中から非同義置換を引き起こす変異を抽出した。これらをマッピングのデータと照らし合わせ、候補となる原因遺伝子の絞り込みを行った。
peup10について、候補遺伝子の欠損株を入手し、peup10変異体と交配を行い、アレリズムテストのためのF1を取得したが、F1ではpeup10の表現型が回復しなかった。すなわちこの候補遺伝子がpeup10変異体の原因遺伝子である可能性が高い。候補遺伝子はprotein kinaseであり、酵母および動物細胞のにおいて液胞輸送およびオートファジーの根冠に関わる重要な因子であることが報告されている。しかしながら、この因子を欠損した植物は致死となるため、植物での機能解析はほとんどなされていない。peup10変異体の研究は、植物におけるオートファジーのメカニズム解明に大きく貢献できると期待できる。
peup13, 15は既知のオートファジー関連因子が原因遺伝子である可能性が高いことが明らかになったが、peup17はマッピングにより決められた領域内に既知のオートファジー関連遺伝子は存在しない。よってpeup17は植物における新規オートファジー関連因子であると期待できる。

現在までの達成度 (段落)

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

今後の研究の推進方策

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Gateway Vectors for Simultaneous Detection of Multiple Protein-Protein Interactions in Plant Cells Using Bimolecular Fluorescence Complementation2016

    • 著者名/発表者名
      Kamigaki A, Nito K, Hikino K, Goto-Yamada S, Nishimura M, Nakagawa T, Mano S
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 11 号: 8 ページ: e0160717-e0160717

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0160717

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamics of the light-dependent transition of plant peroxisomes.2015

    • 著者名/発表者名
      Goto-Yamada, S., Mano, S., Yamada, K., Oikawa, K., Hosokawa, Y., Hara-Nishimura, I., and Nishimura, M.
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 56 号: 7 ページ: 1252-1263

    • DOI

      10.1093/pcp/pcv081

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Vacuolar processing enzyme in plant programmed cell death2015

    • 著者名/発表者名
      Noriyuki Hatsugai, Kenji Yamada, Shino Goto-Yamada and Ikuko Hara-Nishimura
    • 雑誌名

      Front Plant Sci

      巻: 6 ページ: 1-11

    • DOI

      10.3389/fpls.2015.00234

    • NAID

      120005670913

    • 説明
      【掲載確定】
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Seedling ER bodies consist a novel defense system against insect in Brassicaceae plants2017

    • 著者名/発表者名
      Yamada K, Goto-Yamada S, Nakazaki A, Nagano A, Nishimura M, Hara-Nishimura I.
    • 学会等名
      第58回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      鹿児島大学(鹿児島県・鹿児島市)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] PCP Award:Chaperone and Protease Functions of LON Protease 2 Modulate the Peroxisomal Transition and Degradation with Autophagy2016

    • 著者名/発表者名
      S. Goto-Yamada, S. Mano, C. Nakamori, M. Kondo, R. Yamawaki, A. Kato and M. Nishimura
    • 学会等名
      第57回植物生理学会年会
    • 発表場所
      岩手大学
    • 年月日
      2016-03-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Dynamics of peroxisomes and oil bodies based on imaging approach: Molecular players, mechanisms, and roles in metabolisms2016

    • 著者名/発表者名
      S. Mano, K. Oikawa, S. Goto-Yamada, M. Shibata, C. Songkui, H. Makoto, M. Nishimura
    • 学会等名
      第57回植物生理学会年会
    • 発表場所
      岩手大学
    • 年月日
      2016-03-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 植物ペルオキシソーム分解におけるオートファジー制御機構の解析2015

    • 著者名/発表者名
      後藤志野、真野昌二、及川和聡、西村幹夫
    • 学会等名
      第3回新学術「オートファジー」班会議・第9回オートファジー研究会
    • 発表場所
      淡路夢舞台国際会議場
    • 年月日
      2015-11-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2015-11-26   更新日: 2024-03-26  

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