| 研究課題/領域番号 |
15K00404
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
生命・健康・医療情報学
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| 研究機関 | 鳥取大学 |
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研究代表者 |
網崎 孝志 鳥取大学, 医学部, 教授 (20231996)
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| 連携研究者 |
藤原 伸一 鳥取大学, 医学部, 准教授 (00362880)
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| 研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2017年度)
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| 配分額 *注記 |
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2017年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2016年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
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| キーワード | 構造重ね合わせ / 共分散 / 占有率 / 作業用共分散 / 立体構造 / 重ね合わせ / 分子動力学計算 / 欠損値・欠測値 / 頑健性 |
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| 研究成果の概要 |
タンパク質の静的構造の比較や動的変化（ダイナミクス）の研究には信頼のおける構造重ね合わせ法が必要である。本研究では、結晶構造の乱れに関係する占有率と共分散行列の非対角成分の両方を統一して扱える理論的枠組みを開発し、プログラムmmfitcとして実装した。分子動力学シミュレーション結果の解析など、対象構造が多数の場合に、特に有用であると思われる。また、構造が大きく異なる分子が紛れ込んでいる場合に、その影響を受けにくい構造重ね合わせ法も開発した。結晶構造の比較など、対象とする構造があまり多くない場合に有用であると思われる。
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