配列依存的アレル特異的ヒドロキシメチル化の普遍性の検証

• 研究課題/領域番号: 15K06894
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 金沢大学
• 研究代表者: 山田 洋一 金沢大学, 電子情報学系, 准教授 (30377402)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円); 2017年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2016年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2015年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
• キーワード: ヒドロキシメチル化

研究成果の概要

本研究では独自に開発した手法を用いて、配列依存的アレル特異的ヒドロキシメチル化がマウスゲノム上でどの程度普遍的に存在するかを調べることを目的とした。
互いに亜種関係にあり多くの多型を有するJF1マウスとB6マウスを相互に掛け合わせたJF1/B6マウスとB6/JF1マウスの脳由来ゲノムを用いて、既知の配列依存的アレル特異的メチル化領域10個が配列依存的アレル特異的ヒドロキシメチル化を受けているかを
独自に構築した方法法とバイサルファイトシークエンス法により調べた。結果として、このうち一つが配列依存的アレル特異的ヒドロキシメチル化を受けていることがわかった。