研究課題/領域番号 |
15K06979
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
研究分野 |
構造生物化学
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研究機関 | 首都大学東京 |
研究代表者 |
池谷 鉄兵 首都大学東京, 理工学研究科, 助教 (30457840)
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連携研究者 |
伊藤 隆 首都大学東京, 理工学研究科, 教授 (80261147)
GUENTERT PETER 首都大学東京, 理工学研究科, 客員教授 (20392110)
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研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2017年度)
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配分額 *注記 |
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2017年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
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キーワード | NMR立体構造計算 / ベイズ推定 / in-cell NMR / 高分子量蛋白質 / 蛋白質のダイナミクス / NMR / タンパク質立体構造決定 / 立体構造計算 / Bayes推定 / PCS / PRE |
研究成果の概要 |
本課題では,溶液NMR法の応用範囲拡大を目指して,S/N比の低いスパースデータにおいても,高精度の構造解析が可能なデータ解析手法を開発することを目標とした.課題期間内で,ベイズ推定を用いたNMR立体構造計算手法の改良に成功し,従来法では十分な収束構造の得られなかった蛋白質や,生きた細胞内に存在する蛋白質の立体構造決定に成功した.また,細胞内環境で常磁性金属を安定的に蛋白質に付加できるタグの合成し,これを用いて疑似コンタクトシフト(PCS)の観測に成功した.得られたPCS値から,本課題で開発した解析手法を用いて構造解析することで,細胞内蛋白質からの長距離空間情報の取得に成功した.
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