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阻害剤作用機構研究を基盤とした呼吸鎖酵素NDH-2の反応機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 15K07005
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 機能生物化学
研究機関香川大学

研究代表者

山下 哲生  香川大学, 医学部, 助教 (80444727)

連携研究者 北 潔  長崎大学, 熱帯医学・グローバルヘルス研究科, 教授 (90134444)
原田 繁春  京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 教授 (80156504)
志波 智生  京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 准教授 (80401206)
稲岡 健ダニエル  長崎大学, 熱帯医学・グローバルヘルス研究科, 助教 (10623803)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2017年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2016年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2015年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワードNADH dehydrogenase / ユビキノン結合部位 / X線結晶構造解析 / 共結晶 / 阻害剤 / 基質結合部位 / ユビキノン / 酵素の触媒機構 / フラボプロテイン / 薬剤標的分子 / 結晶構造解析
研究成果の概要

Type II NADH脱水素酵素(NDH-2)はマラリアや結核菌などの病原体に対する新規治療薬の標的分子として注目されている。選択性の高い著効性阻害剤を開発するためには、NDH-2の反応機構とその構造的基盤を理解した上で、タンパク質と阻害剤の相互作用を分子レベルで調べる必要があり、基質であるNADHおよびユビキノンの結合部位を同定する必要がある。酵母NDH-2(Ndi1)はユビキノンとの共結晶構造が既に得られているが、生理的な結合部位は同定されていなかった。本研究では酵母Ndi1を研究材料とし、阻害剤を用いた構造生物学的解析および生化学的解析によってユビキノンの生理的な結合部位を決定した。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2018 2015 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] The Scripps Research Institute(米国)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Ubiquinone binding site of yeast NADH dehydrogenase revealed by structures binding novel competitive- and mixed-type inhibitors2018

    • 著者名/発表者名
      Yamashita Tetsuo, Inaoka Daniel Ken, Shiba Tomoo, Oohashi Takumi, Iwata So, Yagi Takao, Kosaka Hiroaki, Miyoshi Hideto, Harada Shigeharu, Kita Kiyoshi, Hirano Katsuya
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8 号: 1 ページ: 2427-2427

    • DOI

      10.1038/s41598-018-20775-6

    • NAID

      120006532084

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 競合および混合阻害剤との共結晶構造解析により明らかとなった出芽酵母由来Type II NADH脱水素酵素のユビキノン結合部位2018

    • 著者名/発表者名
      山下哲生,稲岡健ダニエル,志波智生,大橋匠,岩田想,矢木隆雄,三芳秀,原田繁春,北潔,平野勝也
    • 学会等名
      日本農芸化学会中四国支部第51回講演会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 出芽酵母由来Type II NADH dehydrogenase (NDH-2)のユビキノン競合阻害剤との高分解能複合体構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      大橋拓未、稲岡ダニエル健、山下哲生、志波智生、岩田想、原田繁春、北潔
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会 第41回討論会
    • 発表場所
      東京大学医学部1号館講堂
    • 年月日
      2015-12-23
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [備考] 呼吸鎖酵素NDH-2の反応機構の解明

    • URL

      http://www.med.kagawa-u.ac.jp/~cardiovasc-physiol/custom72.html

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2015-04-16   更新日: 2022-06-06  

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