小型哺乳類の毛色関連遺伝子群の進化的動態把握と系統地理マーカーの開発

• 研究課題/領域番号: 15K07177
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 鈴木 仁 北海道大学, 地球環境科学研究院, 教授 (40179239)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2017年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2016年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: 毛色関連遺伝子 / 系統地理学 / Mc1r / Asip / 多重遺伝子族 / ハプロタイプ構造解析 / メラニズム / 毛色変異 / 連鎖不平衡 / 黒目白毛変異 / ハツカネズミ / ヤチネズミ / 腹部特異的プロモーター / 系統地理 / 逆位 / Rattus exulans / Rattus rattus / haplotype structure / recombination / phylogeography / melanism

研究成果の概要

日本産マウスにおいて毛色関連遺伝子Mc1rを含む1Mbおよび5Mbの2つの異なる染色体領域を標的とする核DNAハプロタイプ構造解析により、列島北部集団には、平均170kbの南アジア亜種系統Mus musculus castaneus由来断片が存在することが判明し、亜種間交雑後約800世代が経過していると算出された。西ヨーロッパの亜種Mus musculus domesticus由来の長い断片（2～5Mb）も観察され現代の人為的移入の可能性が示唆置換された。沖縄産クマネズミの全身黒色性はAsip遺伝子の１つの非同義置換にあり、ハプロタイプ構造解析により、沖縄島で派生した変異の可能性が示唆された。

研究成果

• [国際共同研究] アデレード大学(オーストラリア)
• [国際共同研究] チンバサ動植物公園(マダガスカル)
• [国際共同研究] Yangon University(ミャンマー)
• [国際共同研究] ヤンゴン大学(ミャンマー)
• [雑誌論文] Draft genome sequence of Japanese wood mouse, Apodemus speciosus (2018)
  • 著者名/発表者名: Matsunami Masatoshi、Endo Daiji、Saitou Naruya、Suzuki Hitoshi、Onuma Manabu
  • 雑誌名: Data in Brief 巻: 16 ページ: 43-46
  • DOI: 10.1016/j.dib.2017.10.063
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Heterogeneous genetic make-up of Japanese house mice (Mus musculus) created by multiple independent introductions and spatio-temporally diverse hybridization processes (2017)
  • 著者名/発表者名: Kuwayama Takashi、Nunome Mitsuo、Kinoshita Gohta、Abe Kuniya、Suzuki Hitoshi
  • 雑誌名: Biological Journal of the Linnean Society 巻: 122 号: 3 ページ: 661-674
  • DOI: 10.1093/biolinnean/blx076
  • NAID: 120006531976
  • 査読あり
• [雑誌論文] Potential cmausativeutation for melanism in rats identified in the agouti signaling protein gene (Asip) of the Rattus rattus species complex on Okinawa Island, Japan (2017)
  • 著者名/発表者名: Sasamori, S., Wiewel, A. S., Thomson, V. A., Kobayashi, M., Nakata, K., Suzuki, H.
  • 雑誌名: Zoological Science 巻: 34 号: 6 ページ: 513-522
  • DOI: 10.2108/zs170027
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Estimation of the evolutionary rates of mitochondrial DNA in two Japanese wood mouse species based on calibrations with Quaternary environmental changes (2017)
  • 著者名/発表者名: Hanazaki, K., Tomozawa, M., Kinoshita, G., Suzuki, Y., Yamamoto, M., Irino, T., Suzuki, H.
  • 雑誌名: Zoological Science 巻: 印刷中
  • NAID: 120006470976
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Variation in the coat-color-controlling genes, Mc1r and Asip, in the house mouse Mus musculus from Madagascar. (2016)
  • 著者名/発表者名: Sakuma, Y., Ranorosoa, M. C., Kinoshita, G., Shimoji, H., Tsuchiya, K., Ohdachi, S. D., Arai, S., Tanaka, C., Ramino, H. and Suzuki, H. 2016
  • 雑誌名: Mammal Study 巻: 41 号: 3 ページ: 131-140
  • DOI: 10.3106/041.041.0303
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] 日本産小型哺乳類の自然史学への誘い (2016)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 雑誌名: 哺乳類科学 巻: 56 号: 2 ページ: 259-271
  • DOI: 10.11238/mammalianscience.56.259
  • NAID: 130005317174
  • ISSN: 0385-437X, 1881-526X
• [学会発表] 北海道産アカネズミ（Apodemus speciosus）のミトコンドリアＤＮＡの遺伝的空間構造とその形成史 (2017)
  • 著者名/発表者名: 井上結太、花崎香織里、鈴木祐太郎、木下豪太、土屋公幸、鈴木仁
  • 学会等名: 日本哺乳類学会2017年度大会
• [学会発表] 哺乳類の毛色関連遺伝子の変異と進化するための進化 (2017)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 日本哺乳類学会2017年度大会
• [学会発表] 毛色関連遺伝子 Mc1rとAsipの進化に向けた進化のしくみ (2017)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 日本遺伝学会第89回大会
• [学会発表] ミトコンドリアDNA の進化速度が時間依存的に変化する要因 (2017)
  • 著者名/発表者名: 井上結太、鈴木仁
  • 学会等名: 日本動物学会第88回富山大会
• [学会発表] ミャンマー産ナンヨウネズミにおける毛色多型と毛色関連遺伝子 Mc1r と Asip の配列多 様性の評価 (2016)
  • 著者名/発表者名: 小林 素子, San Maung Maung, Thida Lay Thwe, 片倉 賢, 鈴木 仁
  • 学会等名: 日本哺乳類学会2016年度大会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2016-09-25
• [学会発表] ハツカネズミにおける毛色関連遺伝子 Mc1r および Asip 遺伝子変異の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 佐久間 有希, 木下 豪太, 下地 博之, 鈴木 仁, 土屋 公幸, 田中 ちひろ, Hajanirina Ramin, Marie C Ranorosoa
  • 学会等名: 日本哺乳類学会2016年度大会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2016-09-25
• [学会発表] ミトコンドリア DNA 変異に基づく日本列島の小型哺乳類における進化的動態の比較 (2016)
  • 著者名/発表者名: 本田 明日香, 村上 翔大, 中本 あずさ, 原田 正史, 土屋 公幸, 鈴木 仁
  • 学会等名: 日本哺乳類学会2016年度大会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2016-09-25
• [学会発表] 日本産小型哺乳類の進化史学 (2016)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 日本哺乳類学会2016年度大会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2016-09-25
  • 招待講演
• [学会発表] ミトコンドリア DNA および核遺伝子に基づくコウベモグラの地域系統群の調査 (2016)
  • 著者名/発表者名: 中本 あずさ, 原田 正史, 篠原 明男, 土屋 公幸, 鈴木 仁
  • 学会等名: 日本哺乳類学会2016年度大会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2016-09-24
• [学会発表] Bandicota属の分子系統と毛色変異～Mc1r配列上の黒色化責任変異の探索～ (2015)
  • 著者名/発表者名: 森智子、土屋公幸、Thida Lay Thwe、Myin Zu Min、鈴木仁
  • 学会等名: 日本動物学会北海道支部第60回大会
  • 発表場所: 北海道大学理学部５号館（北海道・札幌市）
  • 年月日: 2015-08-22
• [学会発表] ミトコンドリアDNAおよび核DNAに基づくコウベモグラの遺伝的集団構造についての研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中本あずさ、原田正史、篠原明男、土屋公幸、鈴木仁
  • 学会等名: 日本動物学会北海道支部第60回大会
  • 発表場所: 北海道大学理学部５号館（北海道・札幌市）
  • 年月日: 2015-08-22
• [学会発表] Characterization of Coat Color Variation in Bandicoot Rats Species from Myanmar Using Mc1r Sequence and Spectrophotometric Data (2015)
  • 著者名/発表者名: 森智子、土屋公幸、Saw Bawm、新井智、Thida Lay Thwe、Myin Zu Min、片倉賢、安田俊平、鈴木仁
  • 学会等名: Vth International Wildlife Management Congress (IWMC)
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
  • 年月日: 2015-07-26
  • 国際学会
• [学会発表] Impact of Ice Ages on the Genetic Population Structure of the Western Japanese Mole Inferred from Mitochondrial and Nuclear DNA Sequences (2015)
  • 著者名/発表者名: 中本あずさ、原田正史、篠原明男、土屋公幸、鈴木仁
  • 学会等名: Vth International Wildlife Management Congress (IWMC)
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
  • 年月日: 2015-07-26
  • 国際学会
• [学会発表] Genome sequencing project of wood mouse (Apodemus speciosus) and its use for evolutionary study (2015)
  • 著者名/発表者名: Masatoshi Matsunami, Daiji Endo, Isaac Adeyemi Babarinde, Naruya Saitou, Hitoshi Suzuki, Manabu Onuma
  • 学会等名: Vth International Wildlife Management Congress (IWMC)
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
  • 年月日: 2015-07-26
  • 国際学会