| 研究課題/領域番号 |
15K07289
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
園芸科学
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| 研究機関 | 岐阜大学 |
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研究代表者 |
山根 京子 岐阜大学, 応用生物科学部, 准教授 (00405359)
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| 研究分担者 |
矢野 健太郎 明治大学, 農学部, 専任教授 (00446543)
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| 研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2017年度)
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| 配分額 *注記 |
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2017年度: 260千円 (直接経費: 200千円、間接経費: 60千円)
2016年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2015年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
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| キーワード | wasabi / chloroplast / genome / sequence / DNA marker / cultivar / genotyping / ワサビ / 葉緑体 / DNA / 分岐年代 / 進化 / 日本列島 / ゲノム / 栽培化 / 地史 / 気候変動 / 伝播 / 葉緑体全ゲノム解読 / Eutrema / ミロシナーゼ遺伝子 / ジェノタイピング / 品種の系譜 |
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| 研究成果の概要 |
サンガー法を用いて、世界で初めてワサビ属植物6系統の葉緑体全ゲノム配列の解読に成功した。主要品種‘ふじだるま’と‘島根3号’の全葉緑体ゲノム配列約150 kbには二か所のみで多型がみられ、全ゲノム分析の優位性が示された。
また、日本のワサビ属植物２３４系統における約２ｋｂの塩基配列の比較解析の結果、現在の栽培品種の母系は主要３品種に限定され、山根が作成した品種の系譜と矛盾がないことがわかった。これらのデータを用いて、主要三品種を判別するPCR-RFLPおよびマルチプレックスPCRマーカーを開発し、バンド判別のみで３品種を判別するＤＮＡマーカーの作成に成功した。
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