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樹木種の浸透性交雑を通した適応的遺伝子の獲得プロセスの解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K07489
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 森林科学
研究機関国立研究開発法人森林研究・整備機構

研究代表者

内山 憲太郎  国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (40501937)

研究分担者 津山 幾太郎  国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (80725648)
連携研究者 上野 真義  国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 (40414479)
研究協力者 津村 義彦  筑波大学, 生命環境系, 教授 (20353774)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2017年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2016年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2015年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード浸透交雑 / モミ属 / RAD-seq / 潜在生育域 / ゲノムワイドSNP / Rad-seq
研究成果の概要

本州以南のモミ属3種(シラビソ、ウラジロモミ、モミ)42集団を対象に、ミトコンドリア(mt)・核DNA解析および分布予測モデルを用いて、種間の浸透交雑の実態を調査した。核DNAの解析の結果、3種は明瞭に分化しており、現在の種間の遺伝的交流は限られていることが示された。一方でモミの北方集団のmtDNAハプロタイプは他の2種の主要ハプロタイプに置き換わっており、浸透交雑の可能性が示された。これらの地域は、最終氷期最盛期の潜在生育域も重複していた。また、ゲノムワイドなDNA解析の結果、これらの集団では、他種に特異的な対立遺伝子も集団内に複数検出され、過去に浸透交雑が起こった可能性が示唆された。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2018 2016 2015

すべて 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [学会発表] Range shift and introgression of three Japanese Abies species : insights from genomic analysis and species distribution modelling.2018

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Uchiyama
    • 学会等名
      2017 International Symposium of Korean National Arboretum: Conifer
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Range shift and introgression of three Japanese Abies species : insights from microsatellite,mtDNA and species distribution modelling2016

    • 著者名/発表者名
      UCHIYAMA Kentaro, FUJII Sayaka, TSUYAMA Ikutaro, SUZUKI Setsuko, MORIGUCHI Yoshinari, KIMURA K Megumi, TSUMURA Yoshihiko
    • 学会等名
      The 15th International Conference on Ecology and Silviculture of Fir
    • 発表場所
      北海道大学農学部(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-09-21
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 樹木種のゲノムワイド解析に向けたマーカー整備2016

    • 著者名/発表者名
      内山憲太郎、加藤珠理、上野真義、鈴木節子、須貝杏子、松本麻子
    • 学会等名
      第127回日本森林学会大会
    • 発表場所
      日本大学生物資源科学部(神奈川県藤沢市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 森林樹木種における効率的なゲノムワイドマーカーの開発2015

    • 著者名/発表者名
      内山憲太郎、加藤珠理、上野真義、松本麻子
    • 学会等名
      森林遺伝育種学会第4回大会
    • 発表場所
      東京大学農学部キャンパス           弥生講堂アネックス・セイホクギャラリー(東京都文京区弥生)
    • 年月日
      2015-11-06
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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