家畜の原因不明下痢症例におけるウイルスコミュニティーの解明と新規ウイルスの検索

• 研究課題/領域番号: 15K07718
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 獣医学
• 研究機関: 石川県立大学 (2016-2017); 東京農工大学 (2015)
• 研究代表者: 長井 誠 石川県立大学, 生物資源環境学部, 教授 (10540669)
• 研究分担者: 青木 博史 日本獣医生命科学大学, 獣医学部, 准教授 (10440067)
• 連携研究者: 水谷 哲也 東京農工大学, 農学部, 教授 (70281681) ; 白井 淳資 東京農工大学, 連合農学院研究科, 教授 (00355182)
• 研究協力者: 伊藤 美加 ; 増田 恒幸 ; 赤上 正貴 ; 新楽 和孝
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2017年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2016年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2015年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: 家畜 / 下痢症 / ウイルス / メタゲノム解析 / 新種ウイルス / 遺伝子組み換え / 種間伝播 / 新規ウイルス / 分子疫学

研究成果の概要

家畜（牛および豚）の原因不明下痢症における消化管のウイルスコミュニティーと未知のウイルスを解明するため、次世代シークエンサーによる糞便のメタゲノム解析を行ったところ、1つの新種のピコルナウイルスおよびポサウイルスの新しい遺伝子型を発見した。いずれものウイルスも下痢症との関連性をさらに検討する必要がある。また、トロウイルス、アストロウイルス、コブウイルス、エンテロウイルスおよびサポウイルスにおける遺伝子相同性組み換えを見出した。消化管内ウイルスは遺伝子組み換えにより血清学的多様性を保持し、農場の内で感染を継続させウイルス進化に寄与していることが示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Genetic diversity and recombination of enterovirus G strains in Japanese pigs: High prevalence of strains carrying a papain-like cysteine protease sequence in the enterovirus G population (2018)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiaka S., Naoi Y., Imai R., Masuda T., Ito M., Akagami M., Ouchi Y., Ishii K., Sakaguchi S., Omatsu T., Katayama Y., Oba M., Shirai J., Satani Y., Takashima Y., Taniguchi Y., Takasu M., Madarame H., Sunaga F., Aoki H., Makino S., Mizutani T., Nagai M.
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 13 号: 1 ページ: e0190819-e0190819
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0190819
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Diversity in VP3, NSP3, and NSP4 of rotavirus B detected from Japanese cattle. (2017)
  • 著者名/発表者名: Hayashi-Miyamoto M, Murakami T, Minami-Fukuda F, Tsuchiaka S, Kishimoto M, Sano K, Naoi Y, Asano K, Ichimaru T, Haga K, Omatsu T, Katayama Y, Oba M, Aoki H, Shirai J, Ishida M, Katayama K, Mizutani T, Nagai M.
  • 雑誌名: Infection, genetics and evolution 巻: 49 ページ: 97-103
  • DOI: 10.1016/j.meegid.2017.01.003
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Whole genome analysis of porcine astroviruses detected in Japanese pigs reveals genetic diversity and possible intra-genotypic recombination. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ito M, Kuroda M, Masuda T, Akagami M, Haga K, Tsuchiaka S, Kishimoto M, Naoi Y, Sano K, Omatsu T, Katayama Y, Oba M, Aoki H, Ichimaru T, Mukono I, Ouchi Y, Yamasato H, Shirai J, Katayama K, Mizutani T, Nagai M.
  • 雑誌名: Infection, genetics and evolution 巻: 50 ページ: 38-48
  • DOI: 10.1016/j.meegid.2017.02.008
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Complete genome analysis of porcine kobuviruses from the feces of pigs in Japan (2017)
  • 著者名/発表者名: Akagami Masataka、Ito Mika、Niira Kazutaka、Yamasato Hiroshi、Ouchi Yoshinao、Shirai Junsuke、Katayama Kazuhiko、Mizutani Tetsuya、Nagai Makoto
  • 雑誌名: Virus Genes 巻: 53 号: 4 ページ: 593-602
  • DOI: 10.1007/s11262-017-1464-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic diversity and intergenogroup recombination events of sapoviruses detected from feces of pigs in Japan (2017)
  • 著者名/発表者名: Kuroda Moegi、Masuda Tsuneyuki、Ito Mika、Shirai Junsuke、Katayama Kazuhiko、Mizutani Tetsuya、Oka Tomoichiro、Nagai Makoto
  • 雑誌名: Infection, Genetics and Evolution 巻: 55 ページ: 209-217
  • DOI: 10.1016/j.meegid.2017.09.013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of further diversity among posaviruses. (2016)
  • 著者名/発表者名: Sano K, Naoi Y, Kishimoto M, Masuda T, Tanabe H, Ito M, Niira K, Haga K, Asano K, Tsuchiaka S, Omatsu T, Furuya T, Katayama Y, Oba M, Ouchi Y, Yamasato H, Ishida M, Shirai J, Katayama K, Mizutani T, Nagai M.
  • 雑誌名: Archives of virology 巻: 161 号: 12 ページ: 3541-3548
  • DOI: 10.1007/s00705-016-3048-8
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Complete sequencing of bovine viral diarrhea virus 1 subgenotype 1n and 1o. (2016)
  • 著者名/発表者名: Sato A, Tateishi K, Shinohara M, Naoi Y, Shiokawa M, Aoki H, Ohmori K, Mizutani T, Shirai J, Nagai M.
  • 雑誌名: Genome announcements 巻: 18 号: 1 ページ: 1-1
  • DOI: 10.1128/genomea.01744-15
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Whole genome analysis of Japanese bovine toroviruses reveals natural recombination between porcine and bovine toroviruses. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ito M, Tsuchiaka S, Naoi Y, Otomaru K, Sato M, Masuda T, Haga K, Oka T, Yamasato H, Omatsu T, Sugimura S, Aoki H, Furuya T, Katayama Y, Oba M, Shirai J, Katayama K, Mizutani T, Nagai M.
  • 雑誌名: Infection, genetics and evolution 巻: 38 ページ: 90-95
  • DOI: 10.1016/j.meegid.2015.12.013
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Characterization and phylogenetic analysis of a novel picornavirus from swine feces in Japan. (2016)
  • 著者名/発表者名: Naoi Y, Kishimoto M, Masuda T, Ito M, Tsuchiaka S, Sano K, Yamasato H, Omatsu T, Aoki H, Furuya T, Katayama Y, Oba M, Okada T, Shirai J, Mizutani T, Nagai M.
  • 雑誌名: Archives of virology 巻: in press
  • 査読あり / 謝辞記載あり