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CRISPRの解析を通したV. cholerae病原株出現と拡散機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K08465
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 細菌学(含真菌学)
研究機関長崎大学

研究代表者

竹村 太地郎  長崎大学, 熱帯医学研究所, 助教 (60572899)

連携研究者 丸山 史人  京都大学, 大学院医学研究科, 准教授 (30423122)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2017年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードVibrio cholerae / コレラ菌 / ゲノム解析 / 環境コレラ菌 / CRISPR
研究成果の概要

ベトナム北部地域において、環境水検体の収集とV.choleraeの分離培養を実施し、O1抗原を有するV.cholerae4株、非O1/O139株24株のゲノム配列を取得した。O1株の詳細な比較ゲノム解析を実施し、3株がコレラ世界流行をもたらした病原株グループと近縁であることが示された。この3株はtcpA遺伝子を保有していたが、病原株の保有するtcpA遺伝子型4、8、9、とは異なっており、環境中に生息するV. choleraeが多様性に富んだtcpA遺伝子を保有することを示し、系統関係の解析にこの領域が有用である可能性ことを示唆すると考えている。非O1/O139株24株の解析を現在進行中である。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件)

  • [国際共同研究] 国立衛生疫学研究所(ベトナム)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究]

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] 国立衛生疫学研究所/細菌部(ベトナム)

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [国際共同研究] 国立衛生疫学研究所/細菌部(ベトナム)

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Genetic diversity of environmental Vibrio cholerae O1 strains isolated in Northern Vietnam2017

    • 著者名/発表者名
      Takemura Taichiro、Murase Kazunori、Maruyama Fumito、Tran Thi Luong、Ota Atsushi、Nakagawa Ichiro、Nguyen Dong Tu、Ngo Tu Cuong、Nguyen Thi Hang、Tokizawa Asako、Morita Masatomo、Ohnishi Makoto、Nguyen Binh Minh、Yamashiro Tetsu
    • 雑誌名

      Infection, Genetics and Evolution

      巻: 54 ページ: 146-151

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2017.06.017

    • NAID

      120006987458

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Whole genome analysis of Vibrio cholerae isolated between 2007 and 20 10 in Vietnam.2018

    • 著者名/発表者名
      竹村太地郎,丸山史人 , 大田篤、 村瀬一典, 森田昌知、滝沢木綿、大西真、山城哲
    • 学会等名
      第91回細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 2007-2010年コレラ流行時におけるベトナム分離コレラ菌株の全ゲノム解析2017

    • 著者名/発表者名
      竹村太地郎,丸山史人 , 大田篤、 村瀬一典, Nguyen Dong Tu , Cuong Ngo Tuan, Binh Minh Nguyem, 森田昌知、滝沢木綿、大西真、山城哲
    • 学会等名
      第51回ビブリオシンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2022-08-19  

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