| 研究課題/領域番号 |
15K08663
|
|---|
| 研究種目 |
基盤研究(C)
|
| 配分区分 | 基金 |
|---|
| 応募区分 | 一般 |
|---|
| 研究分野 |
病態検査学
|
|---|
| 研究機関 | 藤田保健衛生大学 (2017)
愛知県衛生研究所 (2015-2016) |
|---|
研究代表者 |
鈴木 匡弘 藤田保健衛生大学, 医学部, 准教授 (70446649)
|
|---|
| 研究協力者 |
山田 和弘 愛知県衛生研究所, 生物学部, 主任 (90564857)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2018-03-31
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2017年度)
|
| 配分額 *注記 |
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2017年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
|
|---|
| キーワード | Clostridioides difficile / 分子疫学 / POT法 / Clostridium difficile / 分子疫学解析 / PCR / PCR-ribotyping / MLST |
|---|
| 研究成果の概要 |
Clostridium difficileのPCR based ORF typing法（POT法）の開発を行った。POT法では遺伝子の保有パターンによってゲノムの遺伝子型を決める。検出ORFは全ゲノムデータ比較と分離株を用いたPCR実験によって選別し、MLSTと相関の見られた10個と、同一ST型内での細分類に有効な6個を採用した。これらのORFは2反応系のmultiplex PCRによって検出した。POT法のSimpson’s indexは0. 976であった。POT法は4時間で取り扱いやすい遺伝子型が得られ、C. difficileの分子疫学および感染管理に有益と期待される。
|
