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統合失調症患者前頭葉ゲノムにおけるLINE-1挿入部位の決定

研究課題

研究課題/領域番号 15K09801
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 精神神経科学
研究機関熊本大学 (2016-2017)
東京大学 (2015)

研究代表者

文東 美紀  熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 准教授 (00597221)

連携研究者 岩本 和也  熊本大学, 大学院生命科学研究部, 教授 (40342753)
笠井 清登  東京大学, 医学部付属病院, 教授 (80322056)
加藤 忠史  理化学研究所, 脳科学研究センター, チームリーダー (30214381)
研究協力者 上田 順子  
清田 恵美  
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2017年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2016年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード統合失調症 / 死後脳 / LINE-1 / レトロトランスポゾン / 精神疾患 / 体細胞変異
研究成果の概要

Long interspersed nuclear element-1 (LINE-1)は、ヒトゲノムの約17%を占めるレトロトランスポゾン配列の一種である。本課題では、体細胞レベルでLINE-1が新規に挿入したゲノム領域を決定する技術の確立を目的とした。健常者前頭葉の神経細胞・非神経細胞を使用した解析の結果、LINE-1新規挿入は1細胞あたり数十ヶ所程度検出され、また挿入されているゲノム部位は細胞種によって異なる特徴があった。今後はこの技術を用いて、LINE-1コピー数が増大していることが報告されている統合失調症患者前頭葉のゲノムDNAについて解析を行い、疾患発症における影響を検証していく。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2018 2017 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 1件、 招待講演 3件) 図書 (3件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Identification of somatic mutations in postmortem human brains by whole genome sequencing and their implications for psychiatric disorders.2018

    • 著者名/発表者名
      Nishioka M, Bundo M, Ueda J, Katsuoka F, Sato Y, Kuroki Y, Ishii T, Ukai W, Murayama S, Hashimoto E, Nagasaki M, Yasuda J, Kasai K, Kato T, Iwamoto K.
    • 雑誌名

      Psychiatry Clin Neurosci.

      巻: 72 号: 4 ページ: 280-294

    • DOI

      10.1111/pcn.12632

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ヒト前頭葉神経細胞における体細胞ゲノム変異の検出2018

    • 著者名/発表者名
      文東美紀、加藤忠史、岩本和也
    • 学会等名
      第123回日本解剖学会総会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒト死後脳を用いたシングルセルレベルのLINE-1新規挿入同定の試み2017

    • 著者名/発表者名
      文東美紀、上田順子、西岡将基、清田恵美、石井貴男、鵜飼渉、橋本恵理、笠井清登、加藤忠史、岩本和也
    • 学会等名
      第39回日本生物学的精神医学会・第47回日本神経精神薬理学会合同年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Detection of retrotransposon by next generation sequencing and its application to single brain cells2017

    • 著者名/発表者名
      Miki Bundo, Junko Ueda-Hayashi, Masaki Nishioka, Emi Kiyota, Kiyoto Kasai, Tadafumi Kato, Kazuya Iwamoto
    • 学会等名
      第40回日本神経科学大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] LINE-1 copy number analysis of schizophrenic patients2017

    • 著者名/発表者名
      Miki Bundo, Tadafumi Kato, Kazuya Iwamoto
    • 学会等名
      More Epigenetics in Clinical Medicine
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ヒト死後脳由来のニューロン・オリゴデンドロサイトを使用したシングルセルゲノム解析2016

    • 著者名/発表者名
      文東美紀
    • 学会等名
      第38回日本生物学的精神医学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2016-09-08
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Comprehensive DNA methylation analysis of neuron and oligodendrocyte from human postmortem brains.2016

    • 著者名/発表者名
      文東美紀
    • 学会等名
      第39回日本神経科学大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2016-07-20
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Somatic mutations in human brains and monozygotic twins discordant for psychiatric disorders.2016

    • 著者名/発表者名
      西岡将基
    • 学会等名
      第39回日本神経科学大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2016-07-20
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Brain genome and epigenome analyses in psychiatric disorders.2015

    • 著者名/発表者名
      Bundo M
    • 学会等名
      第38回日本神経科学会
    • 発表場所
      神戸国際会議場・兵庫
    • 年月日
      2015-07-28
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [図書] Genomic Mosaicism in Neurons and Other Cell Types (Chapter 11: Estimation of LINE-1 Copy Number in the Brain Tissueand Isolated Neuronal Nuclei)2017

    • 著者名/発表者名
      Miki Bundo, Tadafumi Kato, Kazuya Iwamoto
    • 総ページ数
      382
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      9781493972807
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [図書] Genomic mosaicism in neurons and other cell types (book chapter:Estimation of LINE-1 copy number in the brain tissue and isolated neuronal nuclei.)2017

    • 著者名/発表者名
      Bundo M, Kato T, Iwamoto K
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [図書] Epigenetic Methods in Neuroscience Research2015

    • 著者名/発表者名
      Bundo M, Kato T, Iwamoto K
    • 総ページ数
      9
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [備考] 熊本大学大学院 生命科学研究部 分子脳科学分野

    • URL

      https://www.molbrain.com/

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 熊本大学大学院生命科学研究部先端生命医療科学部門分子脳科学分野

    • URL

      https://www.molbrain.com/

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [備考] 東京大学大学院医学系研究科 分子精神医学講座

    • URL

      http://www.molpsy.com/index.html

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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