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次世代シークエンサーを用いた統合解析による大腸癌肝転移に関するゲノム解析

研究課題

研究課題/領域番号 15K10152
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 消化器外科学
研究機関日本大学

研究代表者

緑川 泰  日本大学, 医学部, 准教授 (10292905)

研究分担者 檜垣 時夫  日本大学, 医学部, 助教 (70246883)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2017年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2015年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード統合解析 / ネットワーク解析 / DNAメチル化 / 大腸癌 / 転移 / 次世代シーケンス / 大腸がん / 肝転移 / 次世代シークエンサー / 責任遺伝子 / ゲノム異常 / 大腸がん肝転移 / 発現解析 / エピゲノム / 大腸癌肝転移
研究成果の概要

116例の大腸癌サンプルについて発現データ及びDNAメチル化についての統合解析を行った。まず、発現データでは大腸癌患者は3つのクラスター(Cluster-1, -2, -3)に分類され、5年生存率はそれぞれ74.8%、29.2%、29.4%であった。次にDNAメチル化状態により各クラスターは二つのサブグループに分類され、特にCluster-1Hの5年生存率(36.8%)はCluster-1L(96.1%)と比較して有意に予後不良であった。さらに発現データとメチル化状態によるネットワーク解析によりPTX3 がCluster-1Hにおいて強くメチル化されていることが示された。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2017 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 謝辞記載あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] A prediction model for the grade of liver fibrosis using magnetic resonance elastography.2017

    • 著者名/発表者名
      Mitsuka Y, Midorikawa Y, Abe H, Matsumoto N, Moriyama M, Haradome H, Sugitani M, Tsuji S, Takayama T.
    • 雑誌名

      BMC Gastroenterol.

      巻: 17 号: 1 ページ: 133-133

    • DOI

      10.1186/s12876-017-0700-z

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Diabetes mellitus not an unfavorable factor on the prognosis of hepatitis C virus-related hepatocellular carcinoma.2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshida N, Midorikawa Y, Higaki T, Nakayama H, Tsuji S, Matsuoka S, Ishihara H, Moriyama M, Takayama T.
    • 雑誌名

      Hepatol Res.

      巻: 印刷中 号: 1 ページ: 28-35

    • DOI

      10.1111/hepr.12888

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Network-based analysis for identification of candidate genes for colorectal cancer progression.2016

    • 著者名/発表者名
      Tsuji S, Midorikawa Y, Seki M, Takayama T, Sugiyama Y, Aburatani H.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun.

      巻: 476 号: 2 ページ: 534-40

    • DOI

      10.1016/j.surg.2017.02.014

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Promoter hypomethylation of RAR-related orphan receptor α 1 is correlated with unfavorable clinicopathological features in patients with colorectal cancer2016

    • 著者名/発表者名
      Kano H, Takayama T, Midorikawa Y, Nagase H.
    • 雑誌名

      BioScience Trends

      巻: 10 号: 3 ページ: 202-209

    • DOI

      10.5582/bst.2016.01097

    • NAID

      130005167354

    • ISSN
      1881-7815, 1881-7823
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Preoperative diagnosis with versus without MRI in resection for hepatocellular carcinoma.2015

    • 著者名/発表者名
      Aramaki O
    • 雑誌名

      Surgery

      巻: 158 号: 6 ページ: 1512-1520

    • DOI

      10.1016/j.surg.2015.06.019

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Surgical outcomes in patients with hepatocellular carcinoma associated with metabolic syndrome.2014

    • 著者名/発表者名
      Yoshida N, Takayama T, Midorikawa Y, Higaki T, Nakayama H, Moriguchi M, Tsuji S.
    • 雑誌名

      World Journal of  Surgery

      巻: 39 号: 2 ページ: 471-7

    • DOI

      10.1007/s00268-014-2828-0

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] B型肝炎既感染肝癌患者におけるB型肝炎ウィルスDNA遺伝子組み込みの網羅的解析2017

    • 著者名/発表者名
      緑川 泰、高山忠利、油谷浩幸
    • 学会等名
      第103回日本消化器病学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Genetic diagnosis of multiple hepatocellular carcinoma2017

    • 著者名/発表者名
      Yutaka Midorikawa, Shogo Yamamoto, Kenji Tatsuno, Hiroki Ueda, Shingo Tsuji, Genta Nagae, Tadatoshi Takayama, and Hiroyuki Aburatani.
    • 学会等名
      American Association of Cancer Research 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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