消化管癌の新規バイオマーカー開発をめざしたDNA脱メチル化関連酵素の網羅的解析

• 研究課題/領域番号: 15K10157
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 消化器外科学
• 研究機関: 静岡県立静岡がんセンター（研究所）
• 研究代表者: 村田 飛鳥 静岡県立静岡がんセンター(研究所), その他部局等, その他 (10625768)
• 研究分担者: 絹笠 祐介 静岡県立静岡がんセンター(研究所), その他部局等, その他 (20470164) ; 馬場 祥史 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 講師 (20599708) ; 今村 裕 公益財団法人がん研究会, その他部局等, 医員 (70583045) ; 渡邊 雅之 公益財団法人がん研究会, その他部局等, 食道担当部長 (80254639)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 中途終了 (2015年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: 5-hmC / TET酵素 / 消化器癌 / エピジェネティック / 全遺伝子解析

研究実績の概要

消化器癌細胞におけるDNAの脱メチル化機構に関わるジェネティックおよびエピジェネティックな異常の発見と生物学的悪性度の関連を検討することが当研究の目的である。今年度は当施設で行った大腸癌手術約500件のうち、200例以上から患者側より研究のための試料提供に関する同意をいただき、切除標本の癌部、非癌部から凍結切片を採取してDNA,RNAの抽出を行った。それらを順次、次世代型シーケンサーによる全exon解析しdata蓄積を行っているところである。またDNAはマイクロアレイによる全遺伝子発現解析を行いdata蓄積しているところである。
一方、共同研究施設である熊本大学の食道扁平上皮癌切除症例のうち凍結切片77例から抽出したDNAとRNAを用いて5-hmCの定量とTET酵素群の発現を定量した。すると癌部の5-hmC発現レベルは非癌部よりも有意に低いことが判明した(P<0.0001 by paired t-test)。またTET1とTET3の発現量は癌部と非癌部で有意差がなかったが、TET2では非癌部に比べ癌部での発現量が有意に低値であった(P < 0.0001)。また、5-hmCとTET酵素群の発現量の相関関係について解析した結果、TET1とTET3はそれぞれP = 0.306、P = 0.927で有意な相関関係は認めなかった。一方、TET2はP = 0.003で有意な相関関係を認めた。これらの結果はOncotargetという癌研究分野の一流誌に既に掲載された。

研究成果

• [雑誌論文] The Prognostic Significance of Histone Lysine Demethylase JMJD3/KDM6B in Colorectal Cancer. (2016)
  • 著者名/発表者名: Tokunaga R, Sakamoto Y, Nakagawa S, Miyake K, Izumi D, Kosumi K, Taki K, Higashi T, Imamura Y, Ishimoto T, Iwatsuki M, Baba Y, Miyamoto Y, Yoshida N, Oki E, Watanabe M, Baba H.
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol 巻: 23(2) 号: 2 ページ: 678-85
  • DOI: 10.1245/s10434-015-4879-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] TET family proteins and 5-hydroxymethylcytosine in esophageal squamous cell carcinoma. (2015)
  • 著者名/発表者名: Murata A, Baba Y, Ishimoto T, Miyake K, Kosumi K, Harada K, Kurashige J, Iwagami S, Sakamoto Y, Miyamoto Y, Yoshida N, Yamamoto M, Oda S, Watanabe M, Nakao M, Baba H
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 6（27） 号: 27 ページ: 23372-82
  • DOI: 10.18632/oncotarget.4281
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Relationship between LINE-1 hypomethylation and Helicobacter pylori infection in gastric mucosae (2015)
  • 著者名/発表者名: Kosumi K, Baba Y, Ishimoto T, Harada K, Miyake K, Izumi D, Tokunaga R, Murata A, Eto K, Sugihara H, Shigaki H, Iwagami S, Sakamoto Y, Miyamoto Y, Yoshida N, Watanabe M, Komohara Y, Takeya M, Baba H
  • 雑誌名: Med Oncol 巻: 32(4) 号: 4 ページ: 571-571
  • DOI: 10.1007/s12032-015-0571-5
  • 査読あり