遺伝子コピー数変化解析による新規難聴発症メカニズムに関する研究

• 研究課題/領域番号: 15K10747
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 耳鼻咽喉科学
• 研究機関: 信州大学
• 研究代表者: 茂木 英明 信州大学, 学術研究院医学系(医学部附属病院), 講師 (60422698)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2015年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 難聴 / 遺伝子 / 次世代シークエンサー / アレイCGH / CNV / 遺伝子コピー数変化 / aCGH / コピー数多型 / 先天性難聴 / 耳科学 / ゲノム

研究成果の概要

コピー数変化（CNV: copy number variation）といわれる、数千ないしは数Mbの大きな規模での遺伝子の欠失が、先天性感音難聴の原因のひとつとして注目されている。本研究期間において、難聴遺伝子CNV解析のためのCGH（比較ゲノムハイブリダイゼーション法）アレイを設計、次いで、現在保険診療で行われている先天性難聴の遺伝学的検査と同様の、次世代シークエンサーのリードデータから、コンピューター解析によるCNVの検出を行った。難聴の原因遺伝子のひとつであるSTRC遺伝子をターゲットにCNV解析を行なった結果、本遺伝子のCNVが中等度難聴において頻度が高いことが示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Simple and efficient germline copy number variant visualization method for the Ion AmpliSeq custom panel. (2018)
  • 著者名/発表者名: Nishio SY, Moteki H, Usami SI.
  • 雑誌名: Mol Genet Genomic Med. 巻: 1 号: 4 ページ: 678-686
  • DOI: 10.1002/mgg3.399
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Detection and Confirmation of Deafness-Causing Copy Number Variations in the STRC Gene by Massively Parallel Sequencing and Comparative Genomic Hybridization. (2016)
  • 著者名/発表者名: Moteki H, Azaiez H, Sloan-Heggen CM, Booth K, Nishio S, Wakui K, Yamaguchi T, Kolbe DL, Iwasa Y, Shearer AE, Fukushima Y, Smith RJ, Usami S.
  • 雑誌名: Ann Otol Rhinol Laryngol 巻: 125 号: 11 ページ: 918-923
  • DOI: 10.1177/0003489416661345
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Comprehensive genetic testing with ethnic-specific filtering by allele frequency in a Japanese hearing-loss population. (2015)
  • 著者名/発表者名: Moteki H, Azaiez H, Booth KT, Shearer AE, Sloan CM, Kolbe DL, Nishio S, Hattori M, Usami S, Smith RJ.
  • 雑誌名: Clin Genet. 巻: e-pub 号: 4 ページ: 466-472
  • DOI: 10.1111/cge.12677
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [学会発表] Copy Number Variants in the STRC Gene are a Common Cause of Moderate Hearing Loss in a Japanese Population (2018)
  • 著者名/発表者名: Hideaki Moteki, Yoh Yokota, Shin-ya Nishio, Yomomi Yamaguchi, Keiko Wakui, Shin-ichi Usami
  • 学会等名: ARO Annual midwinter meeting
  • 国際学会
• [学会発表] 先天性難聴の遺伝子診断における遺伝子コピー数変化（Copy Number Variation）同定の試み (2016)
  • 著者名/発表者名: 茂木英明、宮川麻衣子、宇佐美真一
  • 学会等名: 第117回日本耳鼻咽喉科学会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場
  • 年月日: 2016-05-18
• [学会発表] Copy Number Variants in the STRC Gene are a Common Cause of Genetic Hearing Loss in the Japanese Population. (2016)
  • 著者名/発表者名: Moteki H, Shearer A, Azaiez H, Booth K, Sloan C, Kolbe D, Nishio S, Smith R, Usami S.
  • 学会等名: ARO 39th MidWinter Metting
  • 発表場所: San Diego, California, USA
  • 年月日: 2016-02-21
  • 国際学会
• [学会発表] 遺伝子コピー数変化（Copy Number Variation）による先天性感音難聴症例 (2015)
  • 著者名/発表者名: 茂木英明、宇佐美真一
  • 学会等名: 第116回日本耳鼻咽喉科学会総会
  • 発表場所: 東京国際フォーラム
  • 年月日: 2015-05-21