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モデフィコミクスによる歯周疾患のバイオマーカー開発

研究課題

研究課題/領域番号 15K11379
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 歯周治療系歯学
研究機関千葉大学

研究代表者

土田 祥央  千葉大学, 医学部附属病院, 特任助教 (90410422)

研究分担者 佐藤 守  千葉大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (20401002)
連携研究者 青木 章  東京医科歯科大学, 医歯(薬)学総合研究科, 講師 (30302889)
小林 宏明  東京医科歯科大学, 医歯(薬)学総合研究科, 助教 (50396967)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード歯学 / 歯周病学 / プロテオミクス / 質量分析計 / モディフィコミクス / 歯周疾患 / 質量分析技術 / MALDI-TOF MS
研究成果の概要

本研究ではモディフィコミクス(翻訳後修飾を特異的に検出する技術)を発展させ、歯周疾患に起こりうる代表的な翻訳後修飾である糖鎖修飾および最も広く研究されているリン酸化に焦点をあてて、歯周疾患における翻訳後修飾を網羅的探索により捉え、歯周疾患の早期診断および再発予測治療効果判定等に応用することを目的とした。
これまで網羅的な探索が行われてこなかった歯周疾患の翻訳後修飾を最新の質量分析技術により検出し、診断マーカーの可能性を追及することが可能となった。しかし、 歯周疾患特異的リン酸化ペプチドでのアレイ作製まで至らなかったため、実現化に向けて今後も検討を重ねる予定である。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 7件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 7件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (10件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] An improved in-house lysis-filtration protocol for bacterial identification from positive blood culture bottles with high identification rates by MALDI-TOF MS.2018

    • 著者名/発表者名
      Tsuchida S, Murata S, Miyabe A, Satoh M, Takiwaki M, Matsushita K, Nomura F
    • 雑誌名

      Journal of microbiological methods

      巻: 18 ページ: 1684-1688

    • DOI

      10.1016/j.mimet.2018.03.014

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Capsular serotyping of Haemophilus influenzae by using matrix-associated laser desorption ionization-time of flight mass?spectrometry.2018

    • 著者名/発表者名
      Takeuchi N, Segawa S, Ishiwada N, Ohkusu M, Tsuchida S, Satoh M, Matsushita K, Nomura F
    • 雑誌名

      Journal of infection and chemotherapy : official journal of the Japan Society of Chemotherapy

      巻: 18 号: 7 ページ: 300062-66

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2018.02.007

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Assessment by Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry of the Effects of Preanalytical Variables on Serum Peptidome Profiles Following Long-Term Sample Storage.2018

    • 著者名/発表者名
      Tsuchida S, Satoh M, Umemura H, Sogawa K, Takiwaki M, Ishige T, Miyabayashi Y, Iwasawa Y, Kobayashi S, Beppu M, Nishimura M, Kodera Y, Matsushita K, Nomura F
    • 雑誌名

      Proteomics. Clinical applications

      巻: 15 号: 3 ページ: 47-53

    • DOI

      10.1002/prca.201700047

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Ubiquitination in Periodontal Disease: A Review2017

    • 著者名/発表者名
      Tsuchida S, Satoh M, Takiwaki M, Nomura F
    • 雑誌名

      Int J Mol Sci

      巻: 18 号: 7 ページ: 1476-1476

    • DOI

      10.3390/ijms18071476

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Combined Secretomics and Transcriptomics Revealed Cancer-Derived GDF15 is Involved in Diffuse-Type Gastric Cancer Progression and Fibroblast Activation.2016

    • 著者名/発表者名
      Ishige T, Nishimura M, Satoh M, Fujimoto M, Fukuyo M, Semba T, Kado S, Tsuchida S, Sawai S, Matsushita K, Togawa A, Matsubara H, Kaneda A, Nomura F
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 6 号: 1 ページ: 21681-21681

    • DOI

      10.1038/srep21681

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of a novel serum biomarker for pancreatic cancer, C4b-binding protein α-chain (C4BPA) by quantitative proteomic analysis using tandem mass tags2016

    • 著者名/発表者名
      Sogawa K, Takano S, Iida F, Satoh M, Tsuchida S, Kawashima Y, Yoshitomi H, Sanda A, Kodera Y, Takizawa H, Mikata R, Ohtsuka M, Shimizu H, Miyazaki M, Yokosuka O, Nomura F.
    • 雑誌名

      Br J Cancer.

      巻: 115 号: 8 ページ: 949

    • DOI

      10.1038/bjc.2016.295

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Anti-FIRs (PUF60) auto-antibodies are detected in the sera of early-stage colon cancer patients.2016

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi S, Hoshino T, Hiwasa T, Satoh M, Rahmutulla B, Tsuchida S, Komukai Y, Tanaka T, Matsubara H, Shimada H, Nomura F, Matsushita K
    • 雑誌名

      Oncotarget

      巻: 7 号: 50 ページ: 82493-82503

    • DOI

      10.18632/oncotarget.12696

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Fibrinogen alpha C chain 5.9 kDa fragment (FIC5.9), a biomarker for various pathological conditions, is produced in post-blood collection by fibrinolysis and coagulation factors2016

    • 著者名/発表者名
      Kikuchi W, Nishimura M, Kuga T, Tsuchida S, Saito T, Satoh M, Noda K, Kodera Y, Tomonaga T, Nomura F
    • 雑誌名

      Clinical Proteomics

      巻: 13 号: 1 ページ: 27-27

    • DOI

      10.1186/s12014-016-9129-6

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Detection of Ubiquitinated Dermcidin in Gingival Crevicular Fluid in Periodontal Disease.2016

    • 著者名/発表者名
      Tsuchida S, Satoh M, Takiwaki M, Wakabayashi M, Ishige T, Beppu M, Nishimura M, Matsushita K, Nomura F.
    • 雑誌名

      Intl J Pept Res Ther

      巻: 未定 号: 2 ページ: 249-253

    • DOI

      10.1007/s10989-015-9504-6

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 血液培養陽性検体よりの複数菌由来の核酸検出2018

    • 著者名/発表者名
      西村 基, 村田 正太, 姚 躍, 土田 祥央, 田中 知明, 松下 一之
    • 学会等名
      第29回日本臨床微生物学会総会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] MALDI Biotyperを用いたrapid BACproIIの有用性に関する検討2017

    • 著者名/発表者名
      土田 祥央, 村田 正太, 齊藤 知子, 宮部 安規子, 瀬川 俊介, 佐海 知子, 上原 麻美, 中村 恵海, 渡邊 正治, 芦澤 一穂, 寺田 崇, 佐藤 守, 西村 基, 松下 一之, 野村 文夫
    • 学会等名
      第28回日本臨床微生物学会総会
    • 発表場所
      長崎ブリックホール(長崎県・長崎市)
    • 年月日
      2017-01-20
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 質量分析計(MALDI-TOF-MS)を用いたHaemophilus influenzaeの莢膜型決定法の検討2017

    • 著者名/発表者名
      竹内 典子, 石和田 稔彦, 大楠 美佐子, 瀬川 俊介, 村田 正太, 土田 祥央, 佐藤 守, 野村 文夫
    • 学会等名
      第28回日本臨床微生物学会総会
    • 発表場所
      長崎ブリックホール(長崎県・長崎市)
    • 年月日
      2017-01-20
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 37mmクオリティモニターを用いたMALDI-TOF MSによる血液培養ボトルからの迅速細菌同定の検討2017

    • 著者名/発表者名
      土田 祥央, 宮部 安規子, 村田 正太, 齊藤 知子, 瀬川 俊介, 佐海 知子, 上原 麻美, 中村 恵海, 渡邊 正治, 曽川 一幸, 滝脇 正貴, 西村 基, 佐藤 守, 松下 一之, 野村 文夫
    • 学会等名
      第42回日本医用マススペクトル学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 保存された臨床検体(血清)の質量分析による劣化の評価 The effects of preanalytical variables on serum peptidome profiles following long-term storage2017

    • 著者名/発表者名
      土田 祥央,佐藤 守,梅村 啓史,曽川 一幸,滝脇 正貴,西村 基,小寺 義男,松下 一之,野村 文夫
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会 2017 年大会(JHUPO 第 15 回大会)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 保存された臨床検体(血清)の質量分析による劣化の評価2017

    • 著者名/発表者名
      土田祥央
    • 学会等名
      第3回クリニカルバイオバンク研究会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 血液培養陽性ボトルからの迅速同定におけるrapid BACproの有用性に関する検討2016

    • 著者名/発表者名
      村田 正太, 齊藤 知子, 宮部 安規子, 瀬川 俊介, 佐海 知子, 上原 麻美, 中村 恵海, 渡邊 正治, 芦澤 一穂, 寺田 崇, 土田 祥央, 佐藤 守, 西村 基, 野村 文夫, 松下 一之
    • 学会等名
      第27回日本臨床微生物学会総会
    • 発表場所
      仙台国際センター(宮城県・仙台市)
    • 年月日
      2016-01-29
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 質量分析計による細菌迅速同定を目的とした直接同定用前処理方法の検討2016

    • 著者名/発表者名
      芦澤 一穂, 村田 正太, 齊藤 知子, 宮部 安規子, 瀬川 俊介, 佐海 知子, 上原 麻美, 中村 恵海, 渡邊 正治, 土田 祥央, 佐藤 守, 西村 基, 野村 文夫, 松下 一之, 寺田 崇
    • 学会等名
      第27回日本臨床微生物学会総会
    • 発表場所
      仙台国際センター(宮城県・仙台市)
    • 年月日
      2016-01-29
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 千葉大学クリニカルバイオバンク・データベースの構築2015

    • 著者名/発表者名
      松下 一之, 西村 基, 澤部 祐司, 糸賀 栄, 清宮 正徳, 土田 祥央, 野村 文夫
    • 学会等名
      日本臨床検査自動化学会第47回大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2015-10-08
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Effects of preanalytical variables on serum peptidome profiling for long-term storage using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry2015

    • 著者名/発表者名
      Sachio Tsuchida, Mamoru Satoh, Hiroshi Umemura, Kazuyuki Sogawa, Masaki Takiwaki, Minako Beppu, Motoi Nishimura, Yoshio Kodera, Kazuyuki Matsushita, Fumio Nomura
    • 学会等名
      第40回年会日本医用マススペクトル学会
    • 発表場所
      アクトシティ浜松コングレスセンター(静岡県・浜松市)
    • 年月日
      2015-09-17
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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