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野生トランスクリプトームの数理モデリングと植物工場による再現

研究課題

研究課題/領域番号 15K12142
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生命・健康・医療情報学
研究機関大阪府立大学

研究代表者

福田 弘和  大阪府立大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (90405358)

研究分担者 徳田 功  立命館大学, 理工学部, 教授 (00261389)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2017年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード植物環境工学 / 植物工場 / 数理生物学 / 概日リズム / 位相方程式 / 環境応答 / 環境ストレス応答
研究成果の概要

野生の植物が呈する「固有の遺伝子発現パターン」は、固有の地質や気象、生態系によって形成される固有の生命状態を表し、かけがえのない生物情報である。しかし現在、この生物情報が気候変動によって急速に失われつつある。本研究では、網羅的な遺伝子発現解析(トランスクリプトーム解析)によって計測される生命状態を、人工環境システムによって再現する手法の提案と検証を目的とした。野外に自生する多年草の薬用植物(ツボクサCentella asiatica)を対象に、トランスクリプトームの情報構造を数理モデルとして縮約する技術、植物工場によってそのトランスクリプトームを再現する技術、について基礎研究を行った。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] 植物工場における概日時計の科学技術2018

    • 著者名/発表者名
      福田 弘和
    • 雑誌名

      植物環境工学

      巻: 30 号: 1 ページ: 20-27

    • DOI

      10.2525/shita.30.20

    • NAID

      130006415635

    • ISSN
      1880-2028, 1880-3563
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Transcriptome Analysis of a Cultivar of Green Perilla (<I>Perilla frutescens</I>) Using Genetic Similarity with Other Plants via Public Databases2017

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Tanigaki, Takanobu Higashi, Atsushi J. Nagano, Mie N. Honjo, Hirokazu Fukuda
    • 雑誌名

      Environment Control in Biology

      巻: 55 号: 2 ページ: 77-83

    • DOI

      10.2525/ecb.55.77

    • NAID

      130005607981

    • ISSN
      1880-554X, 1883-0986
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Multicellularity enriches the entrainment of Arabidopsis circadian clock2017

    • 著者名/発表者名
      Masuda Kosaku、Kitaoka Ryota、Ukai Kazuya、Tokuda Isao T.、Fukuda Hirokazu
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 3 号: 10

    • DOI

      10.1126/sciadv.1700808

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 連続明期及び明暗周期条件でのリーフレタスにおける遺伝子発現の周期性解析2016

    • 著者名/発表者名
      竹岡真梨、東孝信、福田弘和
    • 学会等名
      日本生物環境工学会
    • 発表場所
      金沢工業大学
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-12-27  

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