網羅的RNAiによるドラッグリプロファイリングに向けたアプローチ

• 研究課題/領域番号: 15K12759
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ケミカルバイオロジー
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 松本 健 国立研究開発法人理化学研究所, 吉田化学遺伝学研究室, 専任研究員 (60222311)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円); 2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2015年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 化合物 / RNAi / スクリーニング / 標的同定 / shRNAスクリーニング / 化合物標的

研究成果の概要

化合物を基礎として生命科学の研究を進める上で、化合物の細胞内標的の同定は、非常に重要だがとても困難な課題である。本研究では、プール型shRNAライブラリーを用いたスクリーニングによる遺伝学的解析を効率化して、化合物の標的同定と関連パスウエイの同定に用いた。この方法で海洋天然物オーリライドBの解析を行った結果、ナトリウムポンプの触媒サブユニットATP1A1蛋白質が細胞のオーリライドBに対する感受性を決める因子であることがわかった。ATP1A1蛋白質の阻害剤ウアバインをオーリライドBと共に細胞に作用させると、単独の場合よりも低濃度でオーリライドBが細胞増殖抑制を引き起こした。

研究成果

• [雑誌論文] A quantitative shRNA screen identifies ATP1A1 as a gene that regulates cytotoxicity by aurilide B. (2017)
  • 著者名/発表者名: Takase, S., Kurokawa, R., Arai, D., Kanto, K. K., Okino, T., Nakao, Y., Kushiro, T., Yoshida, M., and Matsumoto, K.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 印刷中
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] YBX1 gene silencing inhibits migratory and invasive potential via CORO1C in breast cancer in vitro (2017)
  • 著者名/発表者名: Lim, J. P., Shyamasundar, S., Gunaratne, J., Scully, O. J., Matsumoto, K., and Bay, B.-H.
  • 雑誌名: BMC Cancer 巻: 17 号: 1 ページ: 201-201
  • DOI: 10.1186/s12885-017-3187-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] PRAS40 deregulates apoptosis in Ewing sarcoma family tumors by enhancing the insulin receptor/Akt and mTOR signaling pathways. (2016)
  • 著者名/発表者名: Lv, D., Liu, J., Guo, L., Wu, D., Matsumoto, K., and Huang, L.
  • 雑誌名: American Journal of Cancer Research 巻: 6 ページ: 486-497
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Identification of the determinants of 2-deoxyglucose sensitivity in cancer cells by shRNA library screening (2015)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, H. et al.
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 巻: 467 号: 1 ページ: 121-127
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.09.106
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] 網羅的shRNAスクリーニングによる海洋天然物aurilide Bの作用に関わる遺伝子の同定 (2017)
  • 著者名/発表者名: 高瀬翔平、黒川留美、新井大祐、中尾洋一、久城哲夫、吉田 稔、松本 健
  • 学会等名: 日本薬学会第137年会
  • 発表場所: 仙台国際センター（宮城県・仙台市）
  • 年月日: 2017-03-24
• [学会発表] shRNAスクリーニング法の改良による化合物の標的経路の同定の効率化 (2017)
  • 著者名/発表者名: 高瀬翔平、黒川留美、新井大祐、中尾洋一、久城哲夫、松本 健、吉田 稔
  • 学会等名: 日本農芸化学会2017年度大会
  • 発表場所: 京都女子大学（京都府・京都市）
  • 年月日: 2017-03-17
• [備考] 研究者ホームページ
  • URL: http://www.riken.jp/matsumok/index.html
• [備考] ホームページ
  • URL: http://www.riken.jp/matsumok/index.html