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ボロン酸型RNA結合リガンドの創製に基づく高選択的piRNA定量分析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 15K13716
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 分析化学
研究機関東北大学

研究代表者

西澤 精一  東北大学, 理学研究科, 教授 (40281969)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2015年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード小分子RNA / 2’-O-メチルRNA / 分離・検出 / アフィニティー電気泳動 / 分析科学 / 核酸 / 分子認識
研究成果の概要

Piwi-interacting RNA (piRNA)は、生殖細胞に特異的に発現しているユニークな小分子RNAで、その構造や機能が特に注目されている小分子RNAの一つである。本研究では、piRNAに特徴的な3’末端塩基の2′-O-メチル化構造に着目し、ポリアクリルアミドゲル担持ボロン酸に基づくアフィニティー電気泳動によるpiRNAの簡便な分離・検出法を開発した。既存のpiRNA定量分析法と比較して、本手法では、total RNAの精製を全く必要とせず、1ステップでの解析が可能であることから、極めて有用なpiRNA定量分析法になりうると期待できる。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 1件、 招待講演 6件)

  • [雑誌論文] Pteridine Derivatives Modified with a Guanidine for Binding and Sensing an Orphan Guanine in RNA duplexes2016

    • 著者名/発表者名
      Y. Sato, T. Asami, Y. Toriyabe, T. Sato, N. Teramae, and S. Nishizawa
    • 雑誌名

      Chem. Lett.

      巻: 45 号: 8 ページ: 982-984

    • DOI

      10.1246/cl.160425

    • NAID

      130005254494

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 核酸結合プローブの精密設計とRNA検出・細胞内イメージング2017

    • 著者名/発表者名
      西澤精一
    • 学会等名
      日本化学会 第97春季年会
    • 発表場所
      慶應義塾大学 日吉キャンパス
    • 年月日
      2017-03-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Design and synthesis of RNA-binding fluorescent molecules for analytical applications2016

    • 著者名/発表者名
      Seiichi Nishizawa
    • 学会等名
      Satellite International Mini Symposium on Middle Molecular Strategy in Sendai
    • 発表場所
      IMRAM, Tohoku University
    • 年月日
      2016-09-20
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] RNA検出・細胞内イメージングのための蛍光性核酸結合プローブの分子設計2016

    • 著者名/発表者名
      西澤精一
    • 学会等名
      第76回分析化学討論会
    • 発表場所
      岐阜薬科大学・岐阜大学
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 核酸結合リガンドによるRNA検出と細胞内イメージング2015

    • 著者名/発表者名
      西澤精一
    • 学会等名
      日本分析化学会第64年会
    • 発表場所
      九州大学伊都キャンパス
    • 年月日
      2015-09-10
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 核酸結合リガンドによるDNA・RNAセンシングと細胞内イメージング2015

    • 著者名/発表者名
      西澤精一
    • 学会等名
      第86回化学センサ研究会
    • 発表場所
      仙台市情報・産業プラザ
    • 年月日
      2015-08-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 核酸結合リガンドによるDNA・RNA検出と細胞内イメージング2015

    • 著者名/発表者名
      西澤精一
    • 学会等名
      第13回 ホスト・ゲスト化学シンポジウム
    • 発表場所
      東北大学川内北キャンパス
    • 年月日
      2015-06-06
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2018-03-22  

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