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タンパク質量の均一化による微量タンパク質の網羅的解析

研究課題

研究課題/領域番号 15K13750
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生体関連化学
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

松本 桂彦  国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 特別研究員 (60632859)

研究協力者 上田 泰己  国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, グループディレクター (20373277)
鳴海 良平  国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, テクニカルスタッフ (60582202)
清水 義宏  国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, ユニットリーダー (90401231)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワードプロテオーム / 質量分析 / プロテオミクス
研究成果の概要

細胞の機能を調節している転写因子などの重要なタンパク質のおおくは、細胞内で微量にしか発現していないことが多く、これらを質量分析によって検出することは困難であった。そこで、無細胞翻訳系を用いた簡便な同位体標識標準ペプチドと、静電相互作用、疎水性相互作用を用いたクロマトグラフィーによる多次元の分離により、標的タンパク質フラグメントの純度を高めることで、微量タンパク質の高感度な絶対定量法であるMS-QBiC法を確立した。これにより1細胞内に数千分子しか存在しない概日時計の転写因子の増減を定量的に検出することに成功した。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて 2016

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件)

  • [雑誌論文] Mass spectrometry-based absolute quantification reveals rhythmic variation of mouse circadian clock proteins.2016

    • 著者名/発表者名
      Narumi R, Shimizu Y, Ukai-Tadenuma M, Ode KL, Kanda GN, Shinohara Y, Sato A, Matsumoto K, Ueda HR.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: 133 号: 24 ページ: 3461-3467

    • DOI

      10.1073/pnas.1603799113

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2018-03-22  

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