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サブシングルセル解析による二倍体メチロームの解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K14420
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 ゲノム生物学
研究機関九州大学

研究代表者

伊藤 隆司  九州大学, 医学研究院, 教授 (90201326)

連携研究者 三浦 史仁  九州大学, 大学院医学研究院, 講師 (50447348)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2015年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
キーワードDNAメチル化 / PBAT / 単一細胞 / バイサルファイトシーケンシング / バイサルファイトシーケンス / キャリアDNA
研究成果の概要

DNAのメチル化は、それぞれの細胞が発揮できる潜在能力を規定するエピジェネティクスを担う重要な仕組みのひとつです。ゲノム全体のDNAメチル化状態をメチロームと呼びます。メチロームは、細胞の種類によっても状態によっても変わりますし、父親由来のゲノムと母親由来のゲノムでも異なります。したがって、究極のメチローム解析は、単一の細胞から双方のゲノムについてメチル化パターンを完全に明らかにすることです。私達は独自の技術で単一細胞メチローム解析への途を拓いてきましたが、本研究では究極のメチローム解析に向けてその技術を更に高度化しました。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (2件) (うち招待講演 2件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] DNA methylation and gene expression in Mimulus guttatus2015

    • 著者名/発表者名
      Colicchio JM, Miura F, Kelly JK, Ito T, Hileman LC
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 16 号: 1 ページ: 507-507

    • DOI

      10.1186/s12864-015-1668-0

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Changepoint detection in base-resolution methylome data reveals a robust signature of methylated domain landscape2015

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama T, Miura F, Araki H, Okamura K, Ito T
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 16 号: 1 ページ: 594-594

    • DOI

      10.1186/s12864-015-1809-5

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 次世代シーケンシングによる高感度一塩基解像度メチローム解析2015

    • 著者名/発表者名
      伊藤隆司
    • 学会等名
      第28回バイオメディカル分析科学シンポジウム (BMAS2015)
    • 発表場所
      長崎大学
    • 年月日
      2015-08-22
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] PBATによる高感度メチロームシーケンシング2015

    • 著者名/発表者名
      伊藤隆司
    • 学会等名
      第42回日本毒性学会
    • 発表場所
      金沢日航ホテル
    • 年月日
      2015-07-01
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [産業財産権] 高効率な1本鎖DNA同士の連結方法2016

    • 発明者名
      三浦史仁、伊藤隆司
    • 権利者名
      三浦史仁、伊藤隆司
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2016-05-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2018-03-22  

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