疾患関連遺伝子情報に基づくドラッグ・リポジショニングを用いたゲノム創薬手法の開発

• 研究課題/領域番号: 15K14429
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ゲノム医科学
• 研究機関: 大阪大学 (2016); 東京医科歯科大学 (2015)
• 研究代表者: 岡田 随象 大阪大学, 医学系研究科, 教授 (70727411)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2015年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 遺伝統計学 / ドラッグ・リポジショニング / ゲノム創薬

研究成果の概要

本研究では、大規模ヒト疾患ゲノム解析および疾患関連遺伝子の情報を対象に、ドラッグ・リポジショニング対象となる治療薬の効率的なスクリーニングを可能にするアルゴリズムの開発を行った。複数の創薬データベース上に登録された最新の疾患治療薬や、ATC分類に基づく各種疾患の治療薬のリストを取得し、感受性遺伝子情報から、リポジショニング対象治療薬および疾患を探索するシステムを実装した。生活習慣病を中心とする疾患ゲノム解析結果への適用を実施した。

研究成果

• [国際共同研究] Harvard Medical School/Broad Institute(米国)
• [国際共同研究] Sanger Institute(英国)
• [雑誌論文] The Rheumatoid Arthritis Risk Variant CCR6DNP Regulates CCR6 via PARP-1. (2016)
  • 著者名/発表者名: Li G, Cunin P, Wu D, Diogo D, Yang Y, Okada Y, Plenge RM, Nigrovic PA
  • 雑誌名: PLoS Genet 巻: 12 号: 9 ページ: e1006292-e1006292
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1006292
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Trans-ethnic Fine Mapping Highlights Kidney-Function Genes Linked to Salt Sensitivity. (2016)
  • 著者名/発表者名: Mahajan A, Rodan AR, Le TH, Gaulton KJ, Haessler J, ..., Okada Y, Laurie CC, Morris AP, Franceschini N
  • 雑誌名: Am J Hum Gen 巻: 99 号: 3 ページ: 636-646
  • DOI: 10.1016/j.ajhg.2016.07.012
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Association of variations in HLA class II and other loci with susceptibility to EGFR-mutated lung adenocarcinoma. (2016)
  • 著者名/発表者名: Shiraishi K, Okada Y 他44名 Inazawa J 38番目
  • 雑誌名: Nat Commun. 巻: 7 号: 1 ページ: 12451-12451
  • DOI: 10.1038/ncomms12451
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Contribution of a Non-classical HLA Gene, HLA-DOA, to the Risk of Rheumatoid Arthritis (2016)
  • 著者名/発表者名: Okada Y, Suzuki A, Ikari K, Terao C, Kochi Y, Ohmura K, Higasa K, Akiyama M, Ashikawa K, Kanai M, Hirata J, Suita N, Teo YY, Xu H, Bae SC, Takahashi A, Momozawa Y, Matsuda K, Momohara S, Taniguchi A, Yamada R, Mimori T, Kubo M, Brown MA, Raychaudhuri S, Matsuda F, Yamanaka H, Kamatani Y, Yamamoto K
  • 雑誌名: Am J Hum Genet 巻: 99 号: 2 ページ: 366-374
  • DOI: 10.1016/j.ajhg.2016.06.019
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genetic risk of extranodal natural killer T-cell lymphoma: a genome-wide association study. (2016)
  • 著者名/発表者名: Li Z, Xia Y, Feng LN, Chen JR, Li HM, Cui J, Cai QQ, Sim KS, ..., Okada Y, Raychaudhuri S, Lim ST, Tan W, Peng RJ, Khor CC, Bei JX
  • 雑誌名: Lancet Oncol 巻: 17 号: 9 ページ: 1240-1247
  • DOI: 10.1016/s1470-2045(16)30148-6
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Empirical estimation of genome-wide significance thresholds based on the 1000 Genomes Project data set (2016)
  • 著者名/発表者名: Kanai M, Tanaka T, Okada Y
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 61 号: 10 ページ: 861-866
  • DOI: 10.1038/jhg.2016.72
  • NAID: 40020966136
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Systematic analysis of mutation distribution in three dimensional protein structures identifies cancer driver genes (2016)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto A, Okada Y, Boroevich KA, Tsunoda T, Taniguchi H, Nakagawa H
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 6 号: 1 ページ: 26483-26483
  • DOI: 10.1038/srep26483
  • NAID: 120005774574
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Significant impact of miRNA-target gene networks on genetics of human complex traits. (2016)
  • 著者名/発表者名: Okada Y, Muramatsu T, Suita N, Kanai M, Kawakami E et al.
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 6 号: 1 ページ: 22223-22223
  • DOI: 10.1038/srep22223
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] High-density genotyping of immune-related loci identifies new SLE risk variants in individuals with Asian ancestry (2016)
  • 著者名/発表者名: 76.Imamura M, Takahashi A, Yamauchi T, Hara K, Yasuda K, ... Okada Y et al.
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 48 号: 3 ページ: 323-330
  • DOI: 10.1038/ng.3496
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Ethnically shared and heterogeneous impacts of molecular pathways suggested by the genome-wide meta-analysis of rheumatoid arthritis. (2016)
  • 著者名/発表者名: Okada Y, Raj T, Yamamoto K.
  • 雑誌名: Rheumatology 巻: 22 号: 1 ページ: 186-189
  • DOI: 10.1093/rheumatology/kev314
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Construction of a population-specific HLA imputation reference panel and its application to Graves’ disease risk in Japanese. (2015)
  • 著者名/発表者名: Okada Y, Momozawa Y, Ashikawa K, Kanai M, Matsuda K et al.
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 42 号: 7 ページ: 798-802
  • DOI: 10.1038/ng.3310
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著