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膜タンパク質複合体のS-SAD法による構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 15K14468
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 構造生物化学
研究機関大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構

研究代表者

加藤 龍一  大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 准教授 (50240833)

連携研究者 牧尾 尚能  高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 研究員 (00467474)
松垣 直宏  高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 准教授 (50342598)
山田 悠介  高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助教 (20391708)
萬谷 博  東京都健康長寿医療センター研究所, 研究副部長 (20321870)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2017年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2016年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード筋ジストロフィー / ジストログリカン / 膜タンパク質 / 結晶構造解析 / POMT1 / POMT2
研究成果の概要

先天性筋ジストロフィー症に関わる膜タンパク質複合体 POMT1-POMT2 の立体構造解析のため、哺乳類培養細胞での発現実験を行ったが発現量が非常に少なく、改善を試みたが結晶化を行うのに十分なタンパク質が得られなかった。そこで、昆虫虫体で発現させたタンパク質が体内で結晶化する方法を検討をしたが、目的タンパク質の発現は確認できなかった。
膜タンパク質であるPOMT1-POMT2 のX線結晶構造解析を、硫黄原子の異常分散効果を利用する位相決定法(S-SAD 法)で行う手法の開発については、高エネ機構の放射光ビームラインで標準タンパク質を用いてS-SAD 法の改良を行い、十分な成果が得られた。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2017 2016

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] Experimental phase determination with selenomethionine or mercury-derivatization in serial femtosecond crystallography.2017

    • 著者名/発表者名
      Yamashita, K., et al.
    • 雑誌名

      IUCrJ

      巻: 4 号: 5 ページ: 639-647

    • DOI

      10.1107/s2052252517008557

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] In-situ data collection at the photon factory macromolecular crystallography beamlines.2016

    • 著者名/発表者名
      Yamada, Y., Hiraki, M., Matsugaki, N., Kato, R., Senda, T.
    • 雑誌名

      AIP Conf. Proc.

      巻: 1741 ページ: 050023-050023

    • DOI

      10.1063/1.4952943

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ヒトタンパク質の哺乳動物を用いた細胞内結晶化2017

    • 著者名/発表者名
      小祝孝太郎、月本準、東哲也、真板宣夫、山田悠介、平木雅彦、加藤龍一、Leonard M. G. Chavas、千田俊哉、伊藤孝司、湯本史明
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] BINDSにおけるPFタンパク質結晶構造解析ビームラインの支援と高度化2017

    • 著者名/発表者名
      山田悠介、引田理英、松垣直宏、平木雅彦、田辺幹雄、湯本史明、加藤龍一、千田俊哉
    • 学会等名
      日本結晶学会平成29年度年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] PFタンパク質結晶構造解析ビームラインによる構造生物学研究支援2017

    • 著者名/発表者名
      山田 悠介、松垣 直宏、引田 理英、平木 雅彦、加藤 龍一、千田 俊哉
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ヒトタンパク質の哺乳動物細胞を用いた細胞内結晶化2017

    • 著者名/発表者名
      小祝 孝太郎、月本 準、東 哲也、真板 宣夫、山田 悠介、平木 雅彦、加藤 龍一、千田 俊哉、Chavas Leonard、伊藤 孝司、湯本 史明
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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