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RNAポリメラーゼのアセチル化を介した新規転写誘導機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K14685
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 応用微生物学
研究機関東京大学

研究代表者

古園 さおり  東京大学, 生物生産工学研究センター, 特任准教授 (90321760)

研究分担者 小倉 光雄  東海大学, 海洋研究所, 教授 (80204163)
連携研究者 吉川 博文  東京農業大学, 応用生物科学部, 教授 (50175676)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2016年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードリジンアセチル化 / RNAポリメラーゼ / ECFシグマ因子 / 転写 / Bacillus subtilis / アセチル化 / 枯草菌
研究成果の概要

枯草菌ECFシグマ因子であるSigX依存的な転写がグルコース添加により誘導される現象(GI)に着目して、RNAポリメラーゼ(RNAP)のアセチル化を介した新規転写誘導機構の解明を目指した。グルコース添加・非添加条件で精製したRNAPでは前者の方がよりアセチル化されていた。また、SigXは前者のRNAP精製画分にのみ検出され、SigX依存転写活性も高いことがin vitro転写実験より示された。アセチル化模倣変異によりGIが増強されるリジン残基をbetaサブユニットに見出した。RNAPアセチル化が特定のシグマ因子とのホロ酵素形成に影響を及ぼす可能性が示唆された。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (38件)

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (30件) (うち国際学会 7件、 招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Crystal structure of the 2-iminoglutarate-bound complex of glutamate dehydrogenase from Corynebacterium glutamicum.2017

    • 著者名/発表者名
      Tomita T, Yin L, Nakamura S, Kosono S, Kuzuyama T, Nishiyama M.
    • 雑誌名

      FEBS Lett

      巻: 591 号: 11 ページ: 1611-1622

    • DOI

      10.1002/1873-3468.12667

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of lysine acetylation of a phosphoenolpyruvate carboxylase involved in glutamate overproduction in Corynebacterium glutamicum2017

    • 著者名/発表者名
      Nagano-Shoji M, Hamamoto Y, Mizuno Y, Yamada A, Kikuchi M, Shirouzu M, Umehara T, Yoshida M, Nishiyama M, Kosono S
    • 雑誌名

      Mol Microbiol.

      巻: 印刷中 号: 4 ページ: 677-689

    • DOI

      10.1111/mmi.13658

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of lysine succinylation on the regulation of 2-oxoglutarate dehydrogenase inhibitor, OdhI, involved in glutamate production in Corynebacterium glutamicum.2017

    • 著者名/発表者名
      Komine-Abe A, Nagano-Shoji M, Kubo S, Kawasaki H, Yoshida M, Nishiyama M, Kosono S.
    • 雑誌名

      Biosci Biotechnol Biochem

      巻: 81 号: 11 ページ: 2130-2138

    • DOI

      10.1080/09168451.2017.1372182

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dual regulation of Bacillus subtilis kinB gene encoding a sporulation trigger by SinR through transcription repression and positive stringent transcription control2017

    • 著者名/発表者名
      Fujita Y, Ogura M, Nii S and Hirooka K
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 8 ページ: 2502-2502

    • DOI

      10.3389/fmicb.2017.02502

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Novel stand-alone RAM domain protein-mediated catalytic control of anthranilate phosphoribosyltransferase in tryptophan biosynthesis in Thermus thermophilus.2017

    • 著者名/発表者名
      Kubota T, Matsushita H, Tomita T, Kosono S, Yoshida M, Kuzuyama T, Nishiyama M.
    • 雑誌名

      Extremophiles

      巻: 21 号: 1 ページ: 73-83

    • DOI

      10.1007/s00792-016-0884-0

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Protein acetylation involved in streptomycin biosynthesis in Streptomyces griseus.2017

    • 著者名/発表者名
      Ishigaki Y, Akanuma G, Yoshida M, Horinouchi S, Kosono S, Ohnishi Y.
    • 雑誌名

      J. Proteomics

      巻: 155 ページ: 63-72

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2016.12.006

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Altered acetylation and succinylation profiles in Corynebacterium glutamicum in response to conditions inducing glutamate overproduction.2016

    • 著者名/発表者名
      Mizuno Y., Nagano-Shoji M., Kubo S., Kawamura Y., Yoshida A., Kawasaki H., Nishiyama M., Yoshida M. and Kosono S.
    • 雑誌名

      MicrobiologyOpen

      巻: 5 号: 1 ページ: 152-173

    • DOI

      10.1002/mbo3.320

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Changes in the acetylome and succinylome of Bacillus subtilis in response to carbon source.2015

    • 著者名/発表者名
      Kosono S., Tamura M., Suzuki S., Kawamura Y., Yoshida A., Nishiyama M., Yoshida M.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 10 号: 6 ページ: e0131169-e0131169

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0131169

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicumにおけるタンパク質アシル化修飾研究の現状と展望2018

    • 著者名/発表者名
      古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 枯草菌EF-Tuのアシル化修飾制御機構の解析2018

    • 著者名/発表者名
      近藤直子、鈴木祥太、吉田稔、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicum中央代謝酵素間におけるメタボロン形成の探索と解析2018

    • 著者名/発表者名
      山﨑史、村井恵一、吉田稔、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicum由来PDH-ODH超複合体のサブユニット構造解析2018

    • 著者名/発表者名
      衣川寛知、小峰理乃、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicumにおける2-オキソグルタル酸デヒドロゲナーゼ制御因子OdhIのアシル化部位の機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      阿部理乃、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2017年度大会
    • 発表場所
      京都女子大学(京都府京都市)
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicum由来Phosphoenolpyruvate carboxylaseにおけるPup化修飾の機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      濱本勇磨、永野愛、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2017年度大会
    • 発表場所
      京都女子大学(京都府京都市)
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 微生物代謝に関わるタンパク質アシル化修飾研究の現状と展望2017

    • 著者名/発表者名
      古園さおり
    • 学会等名
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      慶應義塾大学(神奈川県藤沢市)
    • 年月日
      2017-03-02
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Exploration of the impact of protein acylation in elongation factor Tu in Bacillus subtilis2017

    • 著者名/発表者名
      Kosono S, Suzuki S, Kondo N, Nishiyama M.
    • 学会等名
      19th International Conference on Bacilli and Gram-positive bacteria
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Exploring the impact of protein acylation on the biology of Corynebacterium glutamicum:2017

    • 著者名/発表者名
      Kosono S.
    • 学会等名
      US-Japan Joint Seminar on Microbial Biotechnology
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Protein acylation involved in the regulation of biological function and metabolism in Corynebacterium glutamicum2017

    • 著者名/発表者名
      Kosono S.
    • 学会等名
      Italy-Japan Joint Symposium. New Trends in Enzyme and Microbial Science in the Translational Biology Era
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicumのグルタミン酸生産に関わるメタボロンの探索と解析2017

    • 著者名/発表者名
      山﨑史、村井恵一、 西山真、古園さおり
    • 学会等名
      第32回(2017年度)日本放線菌学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicum由来PDH-ODH超複合体のサブユニット構造解析2017

    • 著者名/発表者名
      衣川寛知、小峰(阿部)理乃、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      第10回北陸合同バイオシンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] NaClは枯草菌マクロコロニー形成を促進し、YfjD/E/Fはそれに必要である2017

    • 著者名/発表者名
      小倉光雄
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of lysine acetylation in phosphoenolpyruvate carboxylase involved in glutamate overproduction in Corynebacterium glutamicum2016

    • 著者名/発表者名
      Megumi Nagano, Yuta Mizuno, Ayuka Yamada, Masaki Kikuchi, Mikako Shirouzu, Takeshi Umehara, Minoru Yoshida, Makoto Nishiyama, Saori Kosono
    • 学会等名
      2nd Conference on Post-Translational Modifications in Bacteria (PTM2016)
    • 発表場所
      Ecole Normale Superieure of Lyon (France)
    • 年月日
      2016-10-19
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 細菌におけるタンパク質アシル化修飾研究の現状と展望2016

    • 著者名/発表者名
      古園さおり
    • 学会等名
      第177回日本農芸化学会中部支部例会ミニシンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2016-09-24
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Analysis of Protein Acylation on Enzymes Involved in Branched-Chain Amino Acid Biosynthesis in Thermus thermophilus.2016

    • 著者名/発表者名
      Ayako YOSHIDA, Makoto NISHIYAMA, Minoru YOSHIDA, Saori KOSONO
    • 学会等名
      11th International Congress on Extremophiles
    • 発表場所
      京都大学(京都府京都市)
    • 年月日
      2016-09-12
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 翻訳因子EF-Tuにおけるアシル化修飾の機能解析2016

    • 著者名/発表者名
      近藤直子、鈴木祥太、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      2016年度グラム陽性細菌ゲノム機能会議
    • 発表場所
      KKRホテル熱海(静岡県熱海市)
    • 年月日
      2016-08-28
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicum由来ODH/PDH-E2サブユニットのアセチル化部位の機能解析2016

    • 著者名/発表者名
      阿部理乃、久保翔世、永野愛、川崎寿、吉田稔、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicum由来ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ (PEPC)のアセチル化制御はグルタミン酸生産に重要である。2016

    • 著者名/発表者名
      永野愛、山田鮎果、水野裕太、菊地正樹、白水美香子、梅原崇史、吉田彩子、吉田稔、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 枯草菌EF-Tuのアシル化修飾機構および制御機構の解析2016

    • 著者名/発表者名
      鈴木祥太、吉田稔、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 枯草菌ECFシグマ因子SigXのグルコース依存的な活性化に関わるRNAポリメラーゼのアセチル化2016

    • 著者名/発表者名
      米沢祐大、小倉光雄、鈴木祥太、吉田彩子、朝井計、吉田稔、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Protein lysine acetylation profile of a plasmid-free and pCAR1-harbouring Pseudomonas putida KT24402016

    • 著者名/発表者名
      ヴァシレヴァ デリアナ、水口千穂、古園さおり、吉田稔、岡田憲典、野尻秀昭
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 山本 寛之、吉田 彩子、富田 武郎、古園 さおり、葛山 智久、西山 真2016

    • 著者名/発表者名
      Thermus thermophilusにおいてアセチル化を受けるCoAトランスフェラーゼの機能と制御機構の解析
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Protein acylation: a post-translational modification in response to nutrient and metabolism.2016

    • 著者名/発表者名
      Saori Kosono
    • 学会等名
      異分野融合ワークショップ「微生物生命システム研究と合成生物学 の融合」
    • 発表場所
      奈良先端科学技術大学院大学(奈良県・生駒市)
    • 年月日
      2016-03-17
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Change of protein acyl modifications in response to glutamate overproduction in Corynebacterium glutamicum2015

    • 著者名/発表者名
      Saori Kosono
    • 学会等名
      東京大学生物生産工学研究センター国際シンポジウム「微生物の環境への応答と適応、そして進化」
    • 発表場所
      東京大学(東京都・文京区)
    • 年月日
      2015-10-21
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicumにおける短鎖アシル化修飾を介したホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ(PEPC)の機能調節2015

    • 著者名/発表者名
      永野愛、水野裕太、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部2015年度支部大会
    • 発表場所
      お茶の水女子大学(東京都・文京区)
    • 年月日
      2015-09-26
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 枯草菌EF-Tuのアシル化修飾による翻訳制御機構の解析2015

    • 著者名/発表者名
      鈴木祥太、古園さおり
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部2015年度支部大会
    • 発表場所
      お茶の水女子大学(東京都・文京区)
    • 年月日
      2015-09-26
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Altered protein acetylation and succinylation profiles in Corynebacterium glutamicum in response to L-glutamate overproduction2015

    • 著者名/発表者名
      Saori Kosono, Yuta Mizuno, Megumi Nagano-Shoji, Shosei Kubo, Yumi Kawamura, Ayako Yoshida, Hisashi Kawasaki, Makoto Nishiyama, and Minoru Yoshida
    • 学会等名
      第18回日本ドイツ酵素工学ワークショップ
    • 発表場所
      京都大学(京都府・京都市)
    • 年月日
      2015-09-14
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicumにおける短鎖アシル化修飾を介したホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ(PEPC)の機能調節2015

    • 著者名/発表者名
      永野愛、水野裕太、西山真、古園さおり
    • 学会等名
      2015年度グラム陽性菌ゲノム機能会議
    • 発表場所
      雄山荘(滋賀県・大津市)
    • 年月日
      2015-08-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 枯草菌EF-Tuのアシル化修飾による翻訳制御機構の解析2015

    • 著者名/発表者名
      鈴木祥太、古園さおり
    • 学会等名
      2015年度グラム陽性菌ゲノム機能会議
    • 発表場所
      雄山荘(滋賀県・大津市)
    • 年月日
      2015-08-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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