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シングルセル解析を進展させる環境微生物の機能推定技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 15K14807
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 水圏生命科学
研究機関阿南工業高等専門学校

研究代表者

川上 周司  阿南工業高等専門学校, 創造技術工学科, 講師 (00610461)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2015年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード環境微生物 / シングルセル解析 / FISH法 / aptamer / 微生物 / 排水処理 / アプタマー / 未培養微生物
研究成果の概要

汚染物質の浄化、地球温暖化ガスの固定、持続可能なエネルギーの創出に大きく関わる微生物資源を有効に利用するためには、さらなる微生物の理解が必要不可欠である。多くの微生物が人為的に分離培養できない現状において、近年発展著しい分子生物学的アプローチは有効である。さらに微生物細胞を遺伝子の運び屋として捉え、細胞のまま解析を行うシングルセル解析は、培養を伴わない解析手法として近年注目を集めている。本研究ではシングルセル解析のさらなる発展を目指し、細胞壁処理不要の新規な高感度FISH法であるin situ DNA HCR法を改変し、mRNAの検出に成功した。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Rapid and sensitive identification of marine bacteria by an improved in situ DNA hybridization chain reaction (quickHCR-FISH)2015

    • 著者名/発表者名
      Tsuyoshi Yamaguchi, Bernhard Maximilian Fuchs, Rudolf Amann, Shuji Kawakami, Kengo Kubota, Masashi Hatamoto and Takashi Yamaguchi.
    • 雑誌名

      Systematic and Applied Microbiology

      巻: 38 ページ: 400-405

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 蛍光標識 aptamer による E._coli の視覚的検出~高感度化と蛍光の均一化の検討~2017

    • 著者名/発表者名
      川上周司, 山口剛士, 山田剛史, 山口隆司
    • 学会等名
      第51回水環境学会年会
    • 発表場所
      熊本大学
    • 年月日
      2017-03-15
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Click_chemistry を利用した新規高感度 FISH 法の開発2017

    • 著者名/発表者名
      木村圭佑, 山口剛士, 山口隆司, 川上周司
    • 学会等名
      第51回水環境学会年会
    • 発表場所
      熊本大学
    • 年月日
      2017-03-15
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Click chemistry を用いた新規高感度 FISH 法の開発2016

    • 著者名/発表者名
      木村圭佑,山口剛士,山口隆司,川上周司
    • 学会等名
      第50回日本水環境学会年会
    • 発表場所
      アスティ徳島
    • 年月日
      2016-03-16
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2018-03-22  

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